More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12280 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3761  alkylglycerone-phosphate synthase  75.14 
 
 		 527 aa  802    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12280  flavoprotein  100 
 
 		 529 aa  1059    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00816767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3385  alkylglycerone-phosphate synthase  76.27 
 
 		 525 aa  789    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3374  alkylglycerone-phosphate synthase  76.27 
 
 		 525 aa  789    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3436  alkylglycerone-phosphate synthase  76.27 
 
 		 525 aa  789    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0692131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2772  alkylglycerone-phosphate synthase  75.14 
 
 		 527 aa  780    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1798  Alkylglycerone-phosphate synthase  55.39 
 
 		 528 aa  535  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00290405  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2238  alkylglycerone-phosphate synthase  54.44 
 
 		 532 aa  523  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.185547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6682  Alkylglycerone-phosphate synthase  55.68 
 
 		 521 aa  518  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0557877  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0302  Alkylglycerone-phosphate synthase  55.58 
 
 		 524 aa  496  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.709623 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5599  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.34 
 
 		 572 aa  497  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0254483  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4590  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.82 
 
 		 518 aa  490  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0387906  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0943  FAD linked oxidase-like  54.17 
 
 		 545 aa  484  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368093  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4399  Alkylglycerone-phosphate synthase  51.89 
 
 		 540 aa  464  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1958  Alkylglycerone-phosphate synthase  52.28 
 
 		 531 aa  465  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.778758  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2774  alkylglycerone-phosphate synthase  49.35 
 
 		 521 aa  438  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757745  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2577  alkylglycerone-phosphate synthase  50.95 
 
 		 520 aa  425  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5413  Alkylglycerone-phosphate synthase  47.32 
 
 		 550 aa  404  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33270  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  47.42 
 
 		 534 aa  385  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.495555  normal  0.797078 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0358  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.68 
 
 		 533 aa  343  4e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000693187  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1669  alkylglycerone-phosphate synthase  37.39 
 
 		 556 aa  338  9.999999999999999e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.216533  normal  0.884657 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27110  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  34.41 
 
 		 568 aa  329  8e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2176  oxidase, FAD-binding  33.45 
 
 		 563 aa  317  2e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000623586  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2658  FAD linked oxidase-like  34.83 
 
 		 584 aa  312  9e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128646  normal  0.201188 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3149  FAD linked oxidase domain protein  34.84 
 
 		 552 aa  311  1e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0907968  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24940  hypothetical protein  36.58 
 
 		 531 aa  312  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2132  hypothetical protein  36.4 
 
 		 531 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1558  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.77 
 
 		 531 aa  301  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0927889 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19490  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  34 
 
 		 557 aa  299  7e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1001  FAD linked oxidase domain protein  32.79 
 
 		 554 aa  298  1e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1346  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.92 
 
 		 534 aa  296  5e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0015  FAD linked oxidase-like  34.74 
 
 		 583 aa  296  6e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.344556 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2332  FAD linked oxidase-like  35.95 
 
 		 538 aa  296  8e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16388  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4359  alkylglycerone-phosphate synthase  32.79 
 
 		 559 aa  294  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0594  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.93 
 
 		 565 aa  293  5e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0138  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, putative  31.56 
 
 		 586 aa  291  2e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.568715  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3390  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.26 
 
 		 579 aa  286  9e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3120  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.29 
 
 		 535 aa  279  1e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0913078  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3350  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.55 
 
 		 536 aa  277  3e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0117199 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1045  FAD linked oxidase domain protein  40.22 
 
 		 546 aa  273  6e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0325485 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13124  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase agpS  38.94 
 
 		 527 aa  273  8.000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.09 
 
 		 564 aa  259  7e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.010282  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6436  FAD linked oxidase domain protein  34.24 
 
 		 534 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466111 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3848  FAD linked oxidase-like  36.83 
 
 		 532 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.16086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1454  FAD linked oxidase domain protein  37.31 
 
 		 531 aa  249  7e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5107  FAD linked oxidase-like  32.98 
 
 		 534 aa  248  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2483  FAD linked oxidase-like  32.38 
 
 		 502 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.0195086 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1270  FAD linked oxidase-like  36.66 
 
 		 532 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544288 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2454  Alkylglycerone-phosphate synthase  34.35 
 
 		 467 aa  224  4e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000169679  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1876  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.99 
 
 		 510 aa  222  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.606958  normal  0.0560108 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8219  FAD linked oxidase domain protein  37.1 
 
 		 470 aa  219  7e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4360  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.76 
 
 		 520 aa  214  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1372  alkylglycerone-phosphate synthase  32.24 
 
 		 465 aa  210  4e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.782717  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1119  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.49 
 
 		 516 aa  204  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2462  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.23 
 
 		 516 aa  202  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.806747  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5443  putative alkylglycerone-phosphate synthase  34.04 
 
 		 517 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2080  FAD linked oxidase-like  35.29 
 
 		 520 aa  196  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270192  normal  0.562813 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4576  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.45 
 
 		 523 aa  194  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539848  normal  0.906341 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44190  predicted protein  29.63 
 
 		 554 aa  188  3e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1036  FAD linked oxidase-like  31.87 
 
 		 513 aa  177  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2461  alkylglycerone-phosphate synthase  27.73 
 
 		 484 aa  166  6.9999999999999995e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4029  FAD binding domain protein  29.4 
 
 		 484 aa  163  6e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.637066 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2901  FAD binding domain-containing protein  29.17 
 
 		 484 aa  163  8.000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0940  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.4 
 
 		 484 aa  163  8.000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02617  predicted FAD containing dehydrogenase  30.09 
 
 		 484 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0916  FAD linked oxidase domain protein  30.09 
 
 		 484 aa  162  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3074  FAD binding domain-containing protein  29.17 
 
 		 484 aa  162  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2912  FAD binding domain-containing protein  29.17 
 
 		 484 aa  162  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02580  hypothetical protein  30.09 
 
 		 484 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2367  FAD linked oxidase domain protein  30.32 
 
 		 451 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.44 
 
 		 457 aa  156  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1299  FAD linked oxidase-like  30.43 
 
 		 456 aa  139  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.913204  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0268  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  29.2 
 
 		 462 aa  137  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.843143 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1292  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  30.56 
 
 		 469 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1149  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.35 
 
 		 467 aa  134  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.930112 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  26.54 
 
 		 470 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  26.54 
 
 		 470 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.53 
 
 		 474 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5949  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.36 
 
 		 472 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00822967 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.34 
 
 		 470 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  26.34 
 
 		 470 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3317  FAD linked oxidase domain protein  30.07 
 
 		 453 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0777  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.16 
 
 		 482 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  29.91 
 
 		 473 aa  130  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.43 
 
 		 470 aa  130  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.43 
 
 		 470 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.34 
 
 		 470 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  26.34 
 
 		 470 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2428  FAD linked oxidase domain protein  30.56 
 
 		 455 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3295  putative glycolate oxidase subunit  29.82 
 
 		 469 aa  128  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3329  putative glycolate oxidase subunit  29.82 
 
 		 469 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3341  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  29.82 
 
 		 469 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1477  FAD linked oxidase-like  30.05 
 
 		 474 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0640821  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3774  putative oxidoreductase  28.67 
 
 		 499 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3321  FAD linked oxidase domain protein  34.94 
 
 		 572 aa  127  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0988206  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.39 
 
 		 470 aa  127  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.29 
 
 		 469 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.26 
 
 		 474 aa  126  9e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1193  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  29.6 
 
 		 469 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0816  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.2 
 
 		 477 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.513401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>