More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12257 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12257  bifunctional RNase H/acid phosphatase  100 
 
 
364 aa  726  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000101677  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  70.96 
 
 
356 aa  513  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  71.78 
 
 
365 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  71.78 
 
 
365 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  71.78 
 
 
365 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  69.38 
 
 
369 aa  505  1e-142  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  60 
 
 
383 aa  408  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  60.26 
 
 
391 aa  399  1e-110  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  53.39 
 
 
378 aa  339  4e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  52.67 
 
 
382 aa  338  1e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  53.24 
 
 
378 aa  322  5e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  50.82 
 
 
363 aa  315  6e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  51.89 
 
 
378 aa  307  2e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  48.23 
 
 
370 aa  301  8e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  2.75954e-05  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  51.27 
 
 
402 aa  298  1e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  47.77 
 
 
412 aa  292  7e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  42.96 
 
 
411 aa  272  6e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  43.78 
 
 
401 aa  262  5e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  60.09 
 
 
215 aa  234  2e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  45.78 
 
 
366 aa  233  5e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  59.26 
 
 
218 aa  228  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  52.83 
 
 
427 aa  202  1e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  50 
 
 
452 aa  183  5e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  35.88 
 
 
412 aa  177  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  52.48 
 
 
440 aa  177  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4815  ribonuclease H  61.36 
 
 
137 aa  152  6e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09490  ribonuclease HI  52.45 
 
 
322 aa  138  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 
211 aa  114  2e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3660  ribonuclease H  48.12 
 
 
133 aa  113  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270083  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0723  ribonuclease H  48.39 
 
 
168 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  37.32 
 
 
205 aa  110  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  50 
 
 
222 aa  109  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0760  ribonuclease H  48.39 
 
 
253 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  50 
 
 
222 aa  109  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0760  ribonuclease H  48.39 
 
 
253 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  38.04 
 
 
213 aa  106  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  34.83 
 
 
208 aa  106  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2428  ribonuclease H  43.9 
 
 
198 aa  106  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  37.13 
 
 
209 aa  105  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1173  ribonuclease H  35.68 
 
 
194 aa  102  8e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0088  ribonuclease H  45.74 
 
 
211 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2587  ribonuclease H  46.03 
 
 
197 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  36.82 
 
 
205 aa  102  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  34.33 
 
 
213 aa  100  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  33.98 
 
 
243 aa  100  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  34.33 
 
 
213 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.63977e-06  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 
206 aa  100  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0764  ribonuclease H  44.35 
 
 
254 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00463107  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  39.13 
 
 
214 aa  100  5e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0179  ribonuclease H  42.97 
 
 
132 aa  98.6  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.2 
 
 
201 aa  97.8  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4219  ribonuclease H  41.54 
 
 
313 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  36.41 
 
 
213 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  33.52 
 
 
207 aa  97.4  4e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  35.92 
 
 
235 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 
209 aa  95.5  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  31.82 
 
 
200 aa  95.1  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  6.81703e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  33.82 
 
 
253 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  35.83 
 
 
213 aa  93.6  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  36.07 
 
 
209 aa  92.8  7e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  31.31 
 
 
200 aa  92.4  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  31.31 
 
 
200 aa  92.4  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1513  phosphoribosyltransferase, putative/phosphoglycerate mutase family protein  32.09 
 
 
438 aa  92.4  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000537342 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  36.32 
 
 
210 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3671  phosphoglycerate mutase  34.04 
 
 
207 aa  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.786994  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  31.5 
 
 
200 aa  91.7  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  2.1297e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3066  ribonuclease H  43.65 
 
 
197 aa  90.9  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  37.95 
 
 
212 aa  90.9  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  41.45 
 
 
203 aa  89.7  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0309  ribonuclease H  45.24 
 
 
197 aa  89.4  9e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 
201 aa  89.4  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  29.38 
 
 
196 aa  89  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  1.5335e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 
201 aa  89.4  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_8015  predicted protein  40.8 
 
 
126 aa  88.6  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00418489  normal  0.339866 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1437  ribonuclease H  36.64 
 
 
134 aa  88.6  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  32.99 
 
 
203 aa  88.2  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 
202 aa  88.2  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  5.9372e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  33.82 
 
 
208 aa  88.2  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  36.27 
 
 
223 aa  87  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  33.68 
 
 
227 aa  86.7  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  45.74 
 
 
243 aa  85.5  1e-15  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  40.12 
 
 
234 aa  85.9  1e-15  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  38.81 
 
 
228 aa  85.9  1e-15  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  35.98 
 
 
211 aa  85.9  1e-15  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  8.5953e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1556  ribonuclease H  32.58 
 
 
154 aa  85.1  2e-15  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
214 aa  85.1  2e-15  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0341  ribonuclease H  38.64 
 
 
142 aa  84.3  3e-15  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0928  Phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 
201 aa  84.3  3e-15  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0307  ribonuclease H  43.65 
 
 
198 aa  84.3  3e-15  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483531  normal  0.133717 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  40.51 
 
 
207 aa  84  3e-15  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1207  ribonuclease H  42.74 
 
 
198 aa  84  4e-15  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.623117  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  31.12 
 
 
200 aa  83.6  4e-15  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0273  ribonuclease H  37.31 
 
 
199 aa  84  4e-15  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.442052 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  40 
 
 
205 aa  84  4e-15  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  30.93 
 
 
203 aa  83.6  4e-15  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  30.57 
 
 
215 aa  83.6  5e-15  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  30.93 
 
 
203 aa  83.6  5e-15  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  43.75 
 
 
226 aa  83.2  6e-15  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  43.75 
 
 
226 aa  83.2  6e-15  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  43.75 
 
 
226 aa  83.2  6e-15  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>