65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12209 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12209  integral membrane protein  100 
 
 
427 aa  824    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3543  putative integral membrane protein  65.73 
 
 
428 aa  475  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2968  putative integral membrane protein  64.96 
 
 
430 aa  474  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3276  putative integral membrane protein  63.26 
 
 
418 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3338  putative integral membrane protein  63.26 
 
 
418 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3287  putative integral membrane protein  63.5 
 
 
418 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505534  normal  0.641522 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2502  Protein of unknown function DUF2029  38.8 
 
 
414 aa  207  3e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5506  hypothetical protein  40 
 
 
395 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344164  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5433  hypothetical protein  36.65 
 
 
420 aa  186  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2198  hypothetical protein  37.5 
 
 
408 aa  180  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4234  sugar transporter superfamily protein  35.23 
 
 
402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2282  Protein of unknown function DUF2029  34.92 
 
 
469 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291881  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0243  putative integral membrane protein  34.04 
 
 
417 aa  153  7e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0139  hypothetical protein  34.64 
 
 
437 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4020  Protein of unknown function DUF2029  31.61 
 
 
426 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.643753  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06020  Protein of unknown function (DUF2029)  35.53 
 
 
444 aa  143  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.179625 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1016  hypothetical protein  35.01 
 
 
419 aa  141  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1126  Protein of unknown function DUF2029  31 
 
 
425 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3224  hypothetical protein  39.66 
 
 
378 aa  139  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5329  hypothetical protein  34.14 
 
 
478 aa  137  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4322  mannosyltransferase  35.48 
 
 
417 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2916  hypothetical protein  34.97 
 
 
470 aa  134  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189824  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4545  hypothetical protein  32.66 
 
 
477 aa  133  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3057  hypothetical protein  31.67 
 
 
494 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0743  mannosyltransferase  35.98 
 
 
398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.186012  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21610  Protein of unknown function (DUF2029)  32.12 
 
 
421 aa  132  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0338543  normal  0.0110628 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0070  hypothetical protein  37.22 
 
 
455 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6115  hypothetical protein  29.24 
 
 
479 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112096  normal  0.027736 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5055  hypothetical protein  31.01 
 
 
477 aa  125  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11183  mannosyltransferase  32.09 
 
 
431 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000655823  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3057  Protein of unknown function DUF2029  32.29 
 
 
455 aa  119  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0888832  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4120  mannosyltransferase  33 
 
 
443 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.703888 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4045  mannosyltransferase  33 
 
 
443 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2153  mannosyltransferase  30.38 
 
 
369 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0955915  normal  0.0100871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3685  hypothetical protein  32.92 
 
 
420 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4274  mannosyltransferase  33 
 
 
443 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4550  mannosyltransferase  33 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.185586 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0477  mannosyltransferase  31.03 
 
 
438 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0466  mannosyltransferase  31.03 
 
 
438 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0453  mannosyltransferase  31.03 
 
 
438 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355546  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0425  hypothetical protein  31.42 
 
 
417 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0435  hypothetical protein  31.42 
 
 
417 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1385  hypothetical protein  32.46 
 
 
412 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488241  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0993  hypothetical protein  35.17 
 
 
411 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3060  hypothetical protein  32.47 
 
 
434 aa  107  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.647331  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1125  hypothetical protein  33.33 
 
 
408 aa  106  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.51418  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0468  mannosyltransferase  31.36 
 
 
422 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0479  mannosyltransferase  31.36 
 
 
422 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0455  mannosyltransferase  31.36 
 
 
422 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21600  Protein of unknown function (DUF2029)  28.71 
 
 
467 aa  99.4  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0988113  hitchhiker  0.00696231 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2285  Protein of unknown function DUF2029  31.27 
 
 
463 aa  97.8  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0467  mannosyltransferase  31.2 
 
 
428 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0478  mannosyltransferase  31.2 
 
 
428 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0454  mannosyltransferase  31.2 
 
 
428 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0119  hypothetical protein  33.77 
 
 
429 aa  93.6  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  29.73 
 
 
570 aa  92  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4089  hypothetical protein  32.21 
 
 
408 aa  90.1  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1343  hypothetical protein  31 
 
 
410 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3880  putative conserved membrane protein  31.86 
 
 
375 aa  63.5  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561968 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3146  Thiolase  27.87 
 
 
468 aa  54.7  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0205  hypothetical protein  27.12 
 
 
734 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.746079  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2387  hypothetical protein  30.69 
 
 
462 aa  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00724191  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0753  hypothetical protein  23.49 
 
 
437 aa  47.4  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3867  hypothetical protein  25.17 
 
 
734 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0838155  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5286  hypothetical protein  21.99 
 
 
431 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.32718 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>