241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12098 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_3507  cobaltochelatase subunit CobN  40.18 
 
 
1253 aa  781    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2533  cobaltochelatase subunit CobN  83.14 
 
 
1198 aa  1982    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1611  cobaltochelatase, CobN subunit  65.9 
 
 
1207 aa  1564    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316783  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1306  cobaltochelatase subunit CobN  39.27 
 
 
1263 aa  775    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3149  cobN/magnesium chelatase family protein  40.65 
 
 
1254 aa  821    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206272  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1170  cobaltochelatase  43.4 
 
 
1220 aa  757    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.345597  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3015  cobaltochelatase subunit CobN  40.06 
 
 
1254 aa  820    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0319  cobaltochelatase subunit CobN  68.4 
 
 
1209 aa  1630    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0331  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  31.31 
 
 
1262 aa  667    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0158  cobaltochelatase  38.58 
 
 
1235 aa  738    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.75394  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2269  cobaltochelatase subunit CobN  40.18 
 
 
1253 aa  780    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09801  cobalamin biosynthetic protein CobN  31.51 
 
 
1245 aa  696    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2482  cobaltochelatase, CobN subunit  72.64 
 
 
1203 aa  1667    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.440822  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1859  Cobaltochelatase  35.14 
 
 
1302 aa  697    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.243773 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1167  cobaltochelatase subunit CobN  40.11 
 
 
1288 aa  865    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4488  cobaltochelatase, CobN subunit  37.05 
 
 
1253 aa  840    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.036895 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0816  cobaltochelatase, CobN subunit  45.32 
 
 
1175 aa  856    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2099  cobaltochelatase subunit CobN  41.63 
 
 
1281 aa  814    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662171  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3098  cobaltochelatase subunit CobN  38.91 
 
 
1257 aa  803    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391048  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0558  cobaltochelatase, CobN subunit  43.84 
 
 
1453 aa  976    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0787  cobaltochelatase subunit CobN  39.03 
 
 
1249 aa  723    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4806  cobaltochelatase subunit CobN  41.34 
 
 
1269 aa  815    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140016  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1059  cobaltochelatase, CobN subunit  43.66 
 
 
1435 aa  974    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.792006  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3301  cobaltochelatase, CobN subunit  38.88 
 
 
1247 aa  872    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1576  cobaltochelatase subunit CobN  41.01 
 
 
1270 aa  814    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104948  normal  0.435931 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3152  cobaltochelatase subunit CobN  41.54 
 
 
1267 aa  833    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456868  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1121  cobaltochelatase, CobN subunit  37.3 
 
 
1256 aa  701    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229116  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6126  cobaltochelatase subunit CobN  62.17 
 
 
1238 aa  1450    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173021  hitchhiker  0.00419275 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1018  Cobaltochelatase  35.59 
 
 
1259 aa  723    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1357  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  34.65 
 
 
1242 aa  659    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.250832 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5367  cobaltochelatase, CobN subunit  43.61 
 
 
1426 aa  1004    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0921  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  31.81 
 
 
1245 aa  696    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.308916  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2773  cobaltochelatase subunit CobN  40.15 
 
 
1253 aa  786    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0097  cobaltochelatase subunit CobN  40.28 
 
 
1263 aa  858    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1377  cobaltochelatase, CobN subunit  38.89 
 
 
1293 aa  794    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.376222  normal  0.163745 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1279  Cobaltochelatase  35.56 
 
 
1258 aa  753    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.553698  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3366  cobaltochelatase subunit CobN  40.86 
 
 
1240 aa  784    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2407  cobaltochelatase subunit CobN  41.84 
 
 
1278 aa  808    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1518  cobaltochelatase subunit CobN  70.78 
 
 
1364 aa  1548    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0461692  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12098  cobaltochelatase subunit CobN  100 
 
 
1194 aa  2399    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000146421  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1631  cobaltochelatase subunit CobN  41.05 
 
 
1269 aa  818    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498133  normal  0.0450481 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1278  cobaltochelatase, CobN subunit  44.99 
 
 
1406 aa  979    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0282  CobN/magnesium chelatase  33 
 
 
1255 aa  702    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.171743 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2495  cobaltochelatase, CobN subunit  70.77 
 
 
1196 aa  1673    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.148712 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1269  cobaltochelatase subunit CobN  39.27 
 
 
1263 aa  777    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0120  cobaltochelatase  34.1 
 
 
1220 aa  778    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2647  cobaltochelatase CobN subunit  39.13 
 
 
1260 aa  768    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.844431  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4586  cobaltochelatase subunit CobN  38.9 
 
 
1248 aa  796    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465963  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1582  cobaltochelatase subunit CobN  41.34 
 
 
1269 aa  813    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0866134 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1646  cobaltochelatase subunit CobN  41.04 
 
 
1267 aa  806    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244329  normal  0.0408694 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0883  cobaltochelatase subunit CobN  43.4 
 
 
1220 aa  757    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.221354  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1784  cobaltochelatase subunit CobN  70.79 
 
 
1193 aa  1702    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.174802  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0636  cobaltochelatase subunit CobN  39.17 
 
 
1247 aa  718    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411028  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5001  cobaltochelatase subunit CobN  40.97 
 
 
1269 aa  810    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0676394  decreased coverage  0.00000811844 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2352  cobaltochelatase, CobN subunit  43.85 
 
 
1444 aa  956    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.113617  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0145  cobaltochelatase subunit CobN  69.47 
 
 
1212 aa  1640    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1177  cobaltochelatase subunit CobN  41.29 
 
 
1269 aa  822    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2496  cobaltochelatase subunit CobN  83.22 
 
 
1198 aa  1981    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315782  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0635  cobaltochelatase subunit CobN  55.05 
 
 
1237 aa  1294    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1005  Cobaltochelatase  35.47 
 
 
1298 aa  680    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1291  cobaltochelatase, CobN subunit  61.45 
 
 
1264 aa  828    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.526885  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2422  cobaltochelatase subunit CobN  40.34 
 
 
1253 aa  779    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.842189  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1557  cobaltochelatase subunit CobN  41.16 
 
 
1270 aa  816    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25970  cobaltochelatase subunit CobN  41.72 
 
 
1248 aa  813    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.359324  normal  0.429696 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3461  CobN/magnesium chelatase  35.4 
 
 
1304 aa  661    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1657  cobaltochelatase subunit CobN  41.29 
 
 
1269 aa  822    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0434  cobaltochelatase, CobN subunit  38.27 
 
 
1244 aa  860    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.396305  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2196  cobaltochelatase, CobN subunit  72.42 
 
 
1191 aa  1695    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0587089  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17590  cobaltochelatase subunit CobN  66.64 
 
 
1199 aa  1566    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2815  cobaltochelatase, CobN subunit  39.83 
 
 
1247 aa  874    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.265823 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0562  cobaltochelatase subunit CobN  38.95 
 
 
1290 aa  868    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5746  cobaltochelatase, CobN subunit  41.59 
 
 
1273 aa  806    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000307872 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1259  cobaltochelatase  36.75 
 
 
1256 aa  743    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0583  cobaltochelatase, CobN subunit  68.95 
 
 
1206 aa  1651    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.773066  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08851  cobalamin biosynthetic protein CobN  32.15 
 
 
1253 aa  684    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000327208 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5234  cobaltochelatase, CobN subunit  38.97 
 
 
1261 aa  877    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34386 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2131  cobaltochelatase subunit CobN  41.44 
 
 
1330 aa  730    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0808058  normal  0.0966772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3112  cobaltochelatase subunit CobN  81.27 
 
 
1213 aa  1989    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2878  cobaltochelatase subunit CobN  65.02 
 
 
1190 aa  1524    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2541  cobaltochelatase subunit CobN  83.22 
 
 
1198 aa  1981    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3426  cobaltochelatase subunit CobN  83.32 
 
 
1205 aa  2019    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.127026  normal  0.438589 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1615  cobaltochelatase subunit CobN  43.31 
 
 
1220 aa  754    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144906  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2219  cobaltochelatase subunit CobN  41.13 
 
 
1248 aa  809    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09821  cobalamin biosynthetic protein CobN  32.01 
 
 
1245 aa  695    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2528  cobaltochelatase subunit CobN  62.78 
 
 
1222 aa  1502    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.341314  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4862  cobaltochelatase subunit CobN  62.73 
 
 
1266 aa  1488    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114113  normal  0.358132 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09611  cobalamin biosynthetic protein CobN  32.4 
 
 
1245 aa  715    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10041  cobalamin biosynthetic protein CobN  31.27 
 
 
1262 aa  671    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.460676 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5591  Cobaltochelatase  71.25 
 
 
1207 aa  1740    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.270637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2710  cobaltochelatase subunit CobN  63.78 
 
 
1222 aa  1506    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.381245  decreased coverage  0.0000125335 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14911  cobalamin biosynthetic protein CobN  34.89 
 
 
1259 aa  686    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.629118 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0277  cobaltochelatase subunit CobN  43.4 
 
 
1220 aa  757    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.408292  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1877  cobaltochelatase subunit CobN  38.86 
 
 
1263 aa  759    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0648  cobaltochelatase, CobN subunit  45.56 
 
 
1409 aa  961    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1759  cobaltochelatase subunit CobN  39.01 
 
 
1273 aa  769    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193122  normal  0.0775991 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1938  cobaltochelatase subunit CobN  41.55 
 
 
1281 aa  813    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.812521  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1954  cobaltochelatase subunit CobN  41.63 
 
 
1281 aa  815    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.68761  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1646  Cobaltochelatase  35.15 
 
 
1293 aa  628  1e-178  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.45922  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0749  cobalamin biosynthesis protein CobN, putative  30.38 
 
 
1244 aa  620  1e-176  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1219  cobaltochelatase  34.62 
 
 
1285 aa  606  9.999999999999999e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0742888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>