More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12085 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  52.32 
 
 
1831 aa  1253    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  39.79 
 
 
2232 aa  743    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  52.09 
 
 
7210 aa  1582    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  49.52 
 
 
3033 aa  991    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  51.66 
 
 
2376 aa  880    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12960  polyketide synthase pks1  58.09 
 
 
1616 aa  1635    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  47.89 
 
 
4840 aa  1332    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  52.84 
 
 
2374 aa  879    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  100 
 
 
4151 aa  8163    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  45.79 
 
 
2719 aa  1600    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  41.62 
 
 
2066 aa  935    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  37.64 
 
 
1559 aa  663    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  56.64 
 
 
1584 aa  951    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  50.29 
 
 
1955 aa  870    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  47.62 
 
 
2113 aa  1025    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.44 
 
 
1559 aa  660    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  39.33 
 
 
2230 aa  747    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  48.45 
 
 
1924 aa  1036    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.91 
 
 
2551 aa  740    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.07 
 
 
1874 aa  796    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  42.5 
 
 
1656 aa  696    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  51.8 
 
 
4607 aa  1693    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  43.29 
 
 
1587 aa  692    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  50.68 
 
 
5154 aa  1306    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.16 
 
 
3092 aa  1177    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  48.68 
 
 
3158 aa  1151    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11682  polyketide synthase pks9  48.3 
 
 
1017 aa  718    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.910189  normal  0.256718 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  53.59 
 
 
1593 aa  817    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  53.93 
 
 
1789 aa  1240    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  38.63 
 
 
3252 aa  643    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  34.98 
 
 
1939 aa  743    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  43.02 
 
 
3493 aa  1079    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  41.03 
 
 
3099 aa  640    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.25 
 
 
1816 aa  1220    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  50.09 
 
 
2081 aa  879    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  34.45 
 
 
3111 aa  667    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  36.25 
 
 
1349 aa  667    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  35.75 
 
 
2462 aa  697    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  47.13 
 
 
7279 aa  1310    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.46 
 
 
5400 aa  1579    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  50.2 
 
 
3148 aa  1008    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  36.81 
 
 
3693 aa  1231    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  51.8 
 
 
1402 aa  895    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.82 
 
 
3874 aa  2431    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  45.59 
 
 
2847 aa  993    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  53.64 
 
 
1601 aa  873    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  35.31 
 
 
2085 aa  885    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  47.51 
 
 
1820 aa  1085    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13859  polyketide synthase pks2  34.33 
 
 
2126 aa  836    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  33.69 
 
 
2551 aa  683    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.83 
 
 
1837 aa  1014    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  42.17 
 
 
1354 aa  698    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  53.08 
 
 
1071 aa  825    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  47.95 
 
 
3508 aa  1103    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  37.96 
 
 
1832 aa  672    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  51.28 
 
 
3494 aa  1450    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  55.01 
 
 
3254 aa  1156    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  49.34 
 
 
2367 aa  1660    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  42.69 
 
 
4478 aa  864    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  51.03 
 
 
3408 aa  1157    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  61.3 
 
 
2126 aa  2172    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  36.81 
 
 
3693 aa  1231    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4356  KR domain protein  43.98 
 
 
3400 aa  690    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  51.19 
 
 
3355 aa  1090    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  47.56 
 
 
2107 aa  979    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4019  Acyl transferase  35.22 
 
 
5526 aa  712    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  35.31 
 
 
2085 aa  885    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  53.88 
 
 
1143 aa  894    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  36.36 
 
 
3676 aa  1008    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  44.84 
 
 
2477 aa  669    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  40.47 
 
 
3696 aa  872    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  36.13 
 
 
3101 aa  642    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  48.6 
 
 
2090 aa  1120    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  47.94 
 
 
2846 aa  1026    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  48.23 
 
 
2060 aa  1492    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  48.61 
 
 
4575 aa  2414    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  40.37 
 
 
1827 aa  666    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.87 
 
 
1349 aa  661    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  38.02 
 
 
3645 aa  813    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  52.72 
 
 
3463 aa  1494    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  51.41 
 
 
3711 aa  1444    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  51.49 
 
 
2966 aa  1124    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  40.61 
 
 
2880 aa  812    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  49.65 
 
 
2024 aa  839    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.32 
 
 
7110 aa  1500    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  38.56 
 
 
2762 aa  679    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  39.97 
 
 
3702 aa  903    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11205  polyketide beta-ketoacyl synthase pks4  35.05 
 
 
2101 aa  866    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  49.72 
 
 
3670 aa  1348    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  37.5 
 
 
2333 aa  677    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  35.31 
 
 
2085 aa  881    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  50.87 
 
 
5255 aa  1360    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  45.44 
 
 
4930 aa  1237    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  37.97 
 
 
3176 aa  1101    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  41.2 
 
 
1087 aa  678    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  40.53 
 
 
3679 aa  911    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  59.37 
 
 
1602 aa  1670    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  43.19 
 
 
4111 aa  1063    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  51.28 
 
 
4080 aa  1221    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  49.81 
 
 
6768 aa  3246    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>