More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12038 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_3044  trehalose 6-phosphate phosphorylase  49.75 
 
 
804 aa  729    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.886681  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  45.34 
 
 
1314 aa  1129    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4811  trehalose 6-phosphate phosphorylase  50.07 
 
 
713 aa  679    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  41.06 
 
 
1055 aa  652    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4989  HAD family hydrolase  60.61 
 
 
1186 aa  1330    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294557  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4370  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  49.07 
 
 
1088 aa  775    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402344  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3531  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  53.45 
 
 
794 aa  787    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.607347  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3407  HAD family hydrolase  59.11 
 
 
1215 aa  1343    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.377185  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0342  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  45.91 
 
 
1053 aa  681    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3470  HAD family hydrolase  59.11 
 
 
1215 aa  1343    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0400404 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4107  HAD family hydrolase  58.87 
 
 
1225 aa  1347    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130759  normal  0.249958 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2162  trehalose 6-phosphate phosphorylase  51.45 
 
 
807 aa  794    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.40305 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1109  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  52.54 
 
 
788 aa  743    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.824966  normal  0.328257 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4794  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  46.36 
 
 
807 aa  669    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0346  trehalose 6-phosphate phosphorylase  48.88 
 
 
807 aa  764    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0553991  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12038  trehalose-6-phosphate phosphatase otsB1  100 
 
 
1327 aa  2694    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3418  HAD family hydrolase  59.11 
 
 
1215 aa  1343    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.059768  normal  0.266902 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  40.98 
 
 
1053 aa  635  1e-180  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  40.43 
 
 
1051 aa  633  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1462  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  40.13 
 
 
1050 aa  632  1e-179  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  39.56 
 
 
1051 aa  628  1e-178  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  40.93 
 
 
1053 aa  624  1e-177  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  40.72 
 
 
1052 aa  620  1e-176  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21740  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  38.39 
 
 
1125 aa  579  1.0000000000000001e-163  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.976778  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0768  Trehalose 6-phosphate phosphorylase  35.71 
 
 
904 aa  503  1e-140  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261171  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1283  glycoside hydrolase family protein 65  39.1 
 
 
806 aa  479  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.461041 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0483  trehalose and maltose hydrolase ( phosphorylase)  34.41 
 
 
769 aa  425  1e-117  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3917  Kojibiose phosphorylase  32.94 
 
 
748 aa  345  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.057945 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13408  trehalose 6-phosphate phosphatase otsB2  56.64 
 
 
391 aa  345  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0398  Kojibiose phosphorylase  30.13 
 
 
755 aa  339  1.9999999999999998e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00143976  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2161  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  40.87 
 
 
525 aa  337  7e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.135077 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  31.03 
 
 
965 aa  333  1e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00420  Kojibiose phosphorylase  27.94 
 
 
780 aa  333  1e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2279  glycoside hydrolase family protein  29.55 
 
 
759 aa  328  4.0000000000000003e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.7939 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0140  Kojibiose phosphorylase  27.95 
 
 
763 aa  325  3e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  29.43 
 
 
978 aa  320  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2202  Kojibiose phosphorylase  28.04 
 
 
775 aa  317  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.387396  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2264  Kojibiose phosphorylase  31.37 
 
 
720 aa  301  4e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.170179  hitchhiker  0.00000128676 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0811  Kojibiose phosphorylase  29.54 
 
 
787 aa  293  2e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.427192  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1264  glycosy hydrolase family protein  29.45 
 
 
781 aa  286  2.0000000000000002e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.353218  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1203  Kojibiose phosphorylase  29.31 
 
 
807 aa  283  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.204393  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20830  Kojibiose phosphorylase  25.67 
 
 
769 aa  272  2.9999999999999997e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0919  Kojibiose phosphorylase  28.23 
 
 
794 aa  268  5e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.570777 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1550  Kojibiose phosphorylase  28.19 
 
 
789 aa  268  7e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1530  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  26.79 
 
 
759 aa  264  8e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14560  Kojibiose phosphorylase  26.26 
 
 
778 aa  260  1e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000528962  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0403  Kojibiose phosphorylase  25.46 
 
 
781 aa  255  3e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.10881  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2869  Kojibiose phosphorylase  30.23 
 
 
760 aa  254  9.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173251  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1194  Kojibiose phosphorylase  27.4 
 
 
787 aa  253  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8722  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  31.43 
 
 
762 aa  253  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909698  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2158  Kojibiose phosphorylase  28.18 
 
 
757 aa  253  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.848315 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2193  Kojibiose phosphorylase  25.44 
 
 
780 aa  247  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1117  glycosy hydrolase family protein  26.38 
 
 
780 aa  245  5e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158926  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3421  Kojibiose phosphorylase  28.16 
 
 
858 aa  243  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6156  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  34.92 
 
 
777 aa  239  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1281  Kojibiose phosphorylase  28.89 
 
 
761 aa  239  4e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0038  Kojibiose phosphorylase  28.89 
 
 
761 aa  238  7e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02160  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  26.98 
 
 
825 aa  238  7e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3525  trehalose 6-phosphate phosphorylase  40.21 
 
 
450 aa  235  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125105  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3243  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  25.37 
 
 
749 aa  231  6e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0497  Kojibiose phosphorylase  27 
 
 
795 aa  228  9e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01293  predicted hydrolase  27.73 
 
 
755 aa  226  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.940342  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01304  hypothetical protein  27.73 
 
 
755 aa  226  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.95805  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2330  Kojibiose phosphorylase  27.6 
 
 
755 aa  226  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.21539  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1527  glycosy hydrolase family protein  27.93 
 
 
755 aa  226  3e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1431  glycosy hydrolase family protein  27.86 
 
 
755 aa  226  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1961  glycosyl hydrolase, family 65  27.85 
 
 
755 aa  225  4e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.756125  normal  0.752383 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1155  Kojibiose phosphorylase  29.48 
 
 
704 aa  225  4e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.162173  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0562  Kojibiose phosphorylase  26.76 
 
 
795 aa  225  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2962  Kojibiose phosphorylase  27.42 
 
 
778 aa  225  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000307404  normal  0.340362 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2309  Kojibiose phosphorylase  27.6 
 
 
755 aa  225  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5087  maltose phosphorylase  25.34 
 
 
774 aa  224  9e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.076109  normal  0.646973 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2155  HAD family hydrolase  39.23 
 
 
346 aa  221  8.999999999999998e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.555356  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0054  maltose phosphorylase  23.97 
 
 
750 aa  220  1e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000286879  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1016  Kojibiose phosphorylase  28.31 
 
 
776 aa  219  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1019  Kojibiose phosphorylase  24.91 
 
 
756 aa  218  4e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0036  Kojibiose phosphorylase  25.98 
 
 
790 aa  218  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0720168  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1279  Kojibiose phosphorylase  25.73 
 
 
790 aa  215  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.192796  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3313  Kojibiose phosphorylase  25.68 
 
 
748 aa  214  5.999999999999999e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09380  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  26.6 
 
 
848 aa  214  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1401  maltose phosphorylase  23.68 
 
 
767 aa  213  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.900484  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0533  Kojibiose phosphorylase  27.82 
 
 
795 aa  212  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.704179 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4269  Kojibiose phosphorylase  26.09 
 
 
767 aa  211  5e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0995  maltose phosphorylase  25.37 
 
 
752 aa  211  5e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1874  Kojibiose phosphorylase  25.43 
 
 
753 aa  211  7e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3033  Kojibiose phosphorylase  27.65 
 
 
780 aa  211  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.10218  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2716  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  27.87 
 
 
787 aa  209  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1437  Kojibiose phosphorylase  25.78 
 
 
788 aa  209  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217423  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0241  Kojibiose phosphorylase  28.88 
 
 
800 aa  208  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1806  glycosy hydrolase family protein  26.06 
 
 
755 aa  208  5e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.769957  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0980  glycosy hydrolase family protein  25.28 
 
 
789 aa  208  6e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.966041  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2756  maltose phosphorylase  26.26 
 
 
771 aa  207  7e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.264043 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05085  Trehalose/maltose hydrolase (phosphorylase)  22.97 
 
 
768 aa  206  2e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0054  trehalose-phosphatase  44.32 
 
 
271 aa  205  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1847  maltose phosphorylase  26.19 
 
 
751 aa  204  8e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0894  maltose phosphorylase  25.47 
 
 
752 aa  204  9.999999999999999e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0839  maltose phosphorylase  24.48 
 
 
710 aa  202  3e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0771265  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1493  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  26.09 
 
 
786 aa  201  7e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.310066  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2116  Kojibiose phosphorylase  26.25 
 
 
834 aa  201  7.999999999999999e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0190  maltose phosphorylase  24.21 
 
 
765 aa  200  2.0000000000000003e-49  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>