21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12027 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12027  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000558386  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1456  hypothetical protein  45.69 
 
 
206 aa  176  5e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0103956  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1323  hypothetical protein  40 
 
 
235 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3104  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  39.73 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2519  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.9 
 
 
232 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1641  hypothetical protein  41.33 
 
 
268 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0307  hypothetical protein  28.05 
 
 
184 aa  62  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1196  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.58 
 
 
182 aa  55.8  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.406056  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3669  hypothetical protein  25.16 
 
 
185 aa  55.5  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0292536 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2937  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  23.03 
 
 
184 aa  53.1  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3145  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.55 
 
 
316 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2428  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.17 
 
 
202 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0824334 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0760  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  23.84 
 
 
177 aa  48.9  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000791976  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0260  hemerythrin HHE cation binding protein  23.46 
 
 
183 aa  47.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0505  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.54 
 
 
180 aa  46.2  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.581987  normal  0.213341 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  27.21 
 
 
437 aa  45.4  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0771  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  23.48 
 
 
185 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1164  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  20.67 
 
 
184 aa  45.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1610  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  23.85 
 
 
185 aa  43.1  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7075  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  23.46 
 
 
191 aa  43.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2550  putative hemerythrin  20.13 
 
 
176 aa  43.1  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>