98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11984 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11984  transcriptional regulator  100 
 
 		 149 aa  303  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2922  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.562834  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01487  phage N15 gp48-like protein  39.74 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.497667  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01498  hypothetical protein  39.74 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0010  DNA-binding protein  44.62 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.713803 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0024  DNA-binding protein  44.62 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2243  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2518  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.99787 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0282  transcriptional regulator, XRE family  41.46 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3540  transcriptional regulator, XRE family  41.33 
 
 		 94 aa  57  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3835  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0665  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3588  DNA-binding protein  43.66 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4003  DNA-binding protein  43.66 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2396  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3722  XRE family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0676164  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0024  hypothetical protein  49.15 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000416515  hitchhiker  0.00176167 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2034  XRE family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 83 aa  54.3  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.194194 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1457  putative transcriptional regulator, XRE family  45.76 
 
 		 100 aa  53.5  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0521049  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0791  transcriptional regulator, XRE family  34.44 
 
 		 91 aa  53.5  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0650  XRE family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0074  hypothetical protein  35.82 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6666  helix-turn-helix domain protein  49.21 
 
 		 102 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384306  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1909  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0827  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 116 aa  51.2  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.551431  normal  0.496549 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0986  helix-turn-helix domain protein  46.43 
 
 		 124 aa  50.4  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.85534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0647  XRE family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 97 aa  50.4  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.459505 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0744  DNA-binding protein  40 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0365  helix-turn-helix domain-containing protein  41.18 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0718  Cro/CI family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 264 aa  49.3  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0726  Cro/CI family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 264 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1801  DNA-binding transcriptional regulator HipB  36.36 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0306  transciptional regulator  41.18 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.93162  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  30.34 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0378  helix-turn-helix domain-containing protein  41.18 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2672  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.474837  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1932  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1380  transcription regulator  29.11 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2419  transcriptional regulator, XRE family  36.25 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2125  transcriptional regulator, XRE family  30.34 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1829  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 103 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4582  transcriptional regulator, XRE family  31.33 
 
 		 99 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.752323 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0928  DNA polymerase III delta prime subunit  33.33 
 
 		 90 aa  47  0.00009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0065  hypothetical protein  41.18 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0496  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0723  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000669172 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2220  DNA-binding protein  37.31 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0402427  normal  0.0285701 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1927  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0590  transcriptional regulator, XRE family  31.46 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1591  DNA-binding transcriptional regulator HipB  30 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1709  DNA-binding transcriptional regulator HipB  30 
 
 		 94 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0367  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0010  DNA-binding protein  34.33 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.235299  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1817  DNA-binding protein  37.31 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.252724  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1031  transcriptional regulator, XRE family  29.63 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000313321  normal  0.707924 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2149  DNA-binding transcriptional regulator HipB  30 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01480  hypothetical protein  30 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2138  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0287483  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01470  DNA-binding transcriptional regulator  30 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0039  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.514774  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1336  XRE family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40166 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2564  XRE family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5820  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 104 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.790408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2735  XRE family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8282  putative transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 92 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145655  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  47.92 
 
 		 227 aa  44.3  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3847  helix-turn-helix domain-containing protein  31.82 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3280  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.843876 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0364  XRE family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000740846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2429  helix-turn-helix domain-containing protein  46.43 
 
 		 103 aa  43.9  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3411  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4032  helix-turn-helix domain protein  40.98 
 
 		 83 aa  43.5  0.0009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.964235  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4384  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0117  putative DNA-binding protein  32.1 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197061  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1922  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189064  normal  0.0105553 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4157  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 95 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.555179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5489  helix-turn-helix domain-containing protein  46.15 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.173303  normal  0.332694 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2805  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0099  DNA-binding protein  32.81 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0889  putative transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0315  XRE family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0773865 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3174  XRE family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 98 aa  42  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00826056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5139  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0390  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2214  hypothetical protein  34.67 
 
 		 103 aa  41.6  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.351958 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0763  XRE family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4613  helix-turn-helix domain protein  38.33 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.590277  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3675  hypothetical protein  37.88 
 
 		 261 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.241589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5447  XRE family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5523  helix-turn-helix domain-containing protein  43.1 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0720631  hitchhiker  0.0000000329462 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  30.91 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4245  helix-turn-helix domain protein  41.07 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0593  transcriptional regulator, XRE family  29.49 
 
 		 108 aa  40.4  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0244812  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0658  XRE family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 95 aa  40.4  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1476  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2042  putative cytochrome c  26.67 
 
 		 90 aa  40.4  0.009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3620  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 99 aa  40  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>