More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11862 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  100 
 
 		 286 aa  584  1e-166  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2475  alpha/beta hydrolase fold protein  56.46 
 
 		 287 aa  317  1e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  32.63 
 
 		 314 aa  146  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  32.29 
 
 		 294 aa  136  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  31.38 
 
 		 289 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 		 298 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2009  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  28.01 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 301 aa  126  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  28.01 
 
 		 302 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  28.01 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  28.01 
 
 		 339 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  28.01 
 
 		 339 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  28.01 
 
 		 318 aa  125  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 		 290 aa  125  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  27.66 
 
 		 302 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 293 aa  123  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6821  alpha/beta hydrolase fold protein  33.21 
 
 		 300 aa  122  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  27.89 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1849  Alpha/beta hydrolase  31.31 
 
 		 307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542461  normal  0.272584 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 		 296 aa  119  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  25.89 
 
 		 291 aa  119  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  27.21 
 
 		 300 aa  119  7e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3885  alpha/beta hydrolase fold  31.53 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345695  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  31.53 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.901488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2973  haloalkane dehalogenase  33.23 
 
 		 302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3335  alpha/beta hydrolase fold  30.54 
 
 		 307 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4184  alpha/beta hydrolase fold  30.54 
 
 		 307 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4182  alpha/beta hydrolase fold  30.54 
 
 		 307 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250212  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  25.6 
 
 		 297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2638  alpha/beta hydrolase fold protein  29.64 
 
 		 294 aa  112  6e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3197  haloalkane dehalogenase  29.97 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0885  alpha/beta hydrolase fold  28.43 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2620  haloalkane dehalogenase  28.77 
 
 		 330 aa  106  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.198111  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7956  haloalkane dehalogenase  30.86 
 
 		 292 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3680  haloalkane dehalogenase  29.35 
 
 		 302 aa  106  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1007  haloalkane dehalogenase  28.43 
 
 		 301 aa  106  5e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0490132  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  25.64 
 
 		 293 aa  105  8e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  25.27 
 
 		 302 aa  103  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1253  haloalkane dehalogenase  28.24 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0257  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 		 300 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12319  haloalkane dehalogenase  30.77 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7423  alpha/beta hydrolase fold protein  31 
 
 		 294 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0008  haloalkane dehalogenase  31.16 
 
 		 304 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.717639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1183  alpha/beta fold family hydrolase  26.97 
 
 		 310 aa  102  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 		 278 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03953  haloalkane dehalogenase  26.37 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0665  alpha/beta hydrolase fold  32.58 
 
 		 405 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.910637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 		 296 aa  98.2  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1915  haloalkane dehalogenase  27.74 
 
 		 306 aa  98.2  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01260  haloalkane dehalogenase  32.12 
 
 		 303 aa  96.7  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.754797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2428  haloalkane dehalogenase  28.98 
 
 		 299 aa  96.7  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  26.82 
 
 		 275 aa  95.1  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2462  AMP-dependent synthetase and ligase  32.97 
 
 		 861 aa  94.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1611  haloalkane dehalogenase  27.82 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  26.82 
 
 		 287 aa  94  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1777  alpha/beta hydrolase fold  26.76 
 
 		 324 aa  94  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1124  hydrolase/oxidase  27.33 
 
 		 292 aa  93.6  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.370065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2056  haloalkane dehalogenase  27.72 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12599  haloalkane dehalogenase  29.76 
 
 		 300 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.365341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1907  alpha/beta hydrolase fold protein  30.24 
 
 		 299 aa  93.2  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  27.93 
 
 		 354 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  31.32 
 
 		 461 aa  92.4  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2384  haloalkane dehalogenase  27.3 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00566343 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6597  haloalkane dehalogenase  28.99 
 
 		 296 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000200949 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2671  haloalkane dehalogenase  30.29 
 
 		 302 aa  90.9  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.731283  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  28.73 
 
 		 321 aa  91.3  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9195  alpha/beta hydrolase fold protein  42.86 
 
 		 296 aa  90.1  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0447  AMP-dependent synthetase and ligase  32.68 
 
 		 927 aa  89.7  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  27.45 
 
 		 286 aa  89.4  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5099  haloalkane dehalogenase  26.97 
 
 		 295 aa  89  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548735  normal  0.0388419 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 		 342 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 311 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  41.59 
 
 		 309 aa  87.4  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  41.07 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 311 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 		 332 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  27.49 
 
 		 290 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4949  haloalkane dehalogenase  30.07 
 
 		 304 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00300745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5037  haloalkane dehalogenase  30.07 
 
 		 304 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5330  haloalkane dehalogenase  30.07 
 
 		 304 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  41.27 
 
 		 296 aa  85.5  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11214  hypothetical protein  28.21 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00241452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  26.35 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0879  alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0873  alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  27.56 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0890  alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  30.56 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6184  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 		 374 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.893606  normal  0.450025 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  28.83 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6057  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00402067  normal  0.493992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>