More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11778 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11778  MmpL family membrane protein  100 
 
 
945 aa  1868    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000786949  decreased coverage  0.0000000000113435 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5599  MMPL  32.39 
 
 
945 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6000  MMPL domain-containing protein  32.39 
 
 
945 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000163798 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10690  transmembrane transport protein mmpL5  31.92 
 
 
964 aa  481  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3189  transport protein  32.4 
 
 
968 aa  481  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10456  transmembrane transport protein mmpL4  31.79 
 
 
967 aa  476  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5174  transport protein  31.81 
 
 
968 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3435  transport protein  31.51 
 
 
968 aa  472  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.541306  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5263  transport protein  31.81 
 
 
968 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10407  transmembrane transport protein mmpL1  32.59 
 
 
958 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.665513  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5555  transport protein  31.81 
 
 
968 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188099  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12363  transmembrane transport protein mmpL9  31.51 
 
 
962 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1936  transport protein  31.9 
 
 
941 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4418  transport protein  31.5 
 
 
948 aa  457  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063936  normal  0.179465 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4825  transport protein  31.15 
 
 
1001 aa  458  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1614  transport protein  30.6 
 
 
968 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3833  transport protein  31.49 
 
 
944 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3029  transport protein  30.61 
 
 
959 aa  437  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3401  transport protein  31.33 
 
 
955 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.057109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3464  transport protein  31.33 
 
 
955 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0593599 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3412  transport protein  31.33 
 
 
955 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0674616  normal  0.562796 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1057  transport protein  30.01 
 
 
963 aa  422  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2705  transport protein  31.32 
 
 
957 aa  419  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10518  transmembrane transport protein mmpL2  30.89 
 
 
968 aa  412  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.930398 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2959  MMPL domain protein  29.26 
 
 
1011 aa  390  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301766  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  28.78 
 
 
1077 aa  379  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3114  transport protein  28.97 
 
 
1062 aa  365  3e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11207  transmembrane transport protein mmpL10  30.02 
 
 
1002 aa  365  3e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3174  transport protein  28.97 
 
 
1062 aa  365  3e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  27.86 
 
 
1146 aa  352  2e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2900  MMPL domain-containing protein  29.25 
 
 
1003 aa  339  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.689966  normal  0.0696558 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  29.53 
 
 
1001 aa  337  7e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  29.47 
 
 
998 aa  334  5e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  29.47 
 
 
998 aa  333  1e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  29.47 
 
 
998 aa  333  1e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4841  MMPL  28.2 
 
 
1022 aa  332  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0784394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4929  MMPL domain-containing protein  28.2 
 
 
1022 aa  332  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559096  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13857  integral membrane transport protein mmpL8  28.52 
 
 
1089 aa  330  8e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0271  transport protein  29.31 
 
 
1000 aa  329  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.26507 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2163  MMPL domain-containing protein  29.52 
 
 
1013 aa  328  4.0000000000000003e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  28.41 
 
 
1013 aa  323  8e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0312  MMPL domain-containing protein  28.04 
 
 
1028 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4595  MMPL domain-containing protein  28.01 
 
 
1040 aa  320  1e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12956  transmembrane transport protein mmpL7  28.65 
 
 
920 aa  244  5e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  25.05 
 
 
981 aa  241  5.999999999999999e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  23.04 
 
 
974 aa  218  5.9999999999999996e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4632  MMPL domain-containing protein  30.05 
 
 
681 aa  195  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.839502 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0818  MMPL domain protein  23.05 
 
 
1054 aa  181  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11589  transmembrane transport protein mmpL6  40.16 
 
 
397 aa  176  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.9101799999999998e-86  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  22.14 
 
 
1040 aa  164  9e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  25.91 
 
 
974 aa  142  3e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4635  MMPL domain-containing protein  28.57 
 
 
470 aa  140  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2990  MmpL family membrane protein putative  21.38 
 
 
1038 aa  132  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189958  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2691  MmpL family membrane protein  22.11 
 
 
1041 aa  132  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.475251  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2953  membrane protein, MmpL family  19.94 
 
 
1038 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.305637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2949  putative membrane protein, MmpL family  21.06 
 
 
888 aa  127  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4025e-34 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2996  putative membrane protein, MmpL family  21.03 
 
 
1038 aa  126  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000662064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2287  membrane protein, MmpL family  21.41 
 
 
1038 aa  121  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0482318  hitchhiker  0.0000000000000416433 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2742  MMPL domain-containing protein  20.51 
 
 
1038 aa  121  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242391  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2670  hypothetical protein  24.29 
 
 
1041 aa  114  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  29.08 
 
 
882 aa  110  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0343  MMPL domain protein  25 
 
 
1068 aa  109  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0890  MMPL domain protein  19.09 
 
 
1026 aa  107  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000250771  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  36.79 
 
 
750 aa  107  9e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1013  hypothetical protein  39.05 
 
 
860 aa  106  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000218575 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  35.05 
 
 
764 aa  105  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3196  MMPL domain-containing protein  18.94 
 
 
1049 aa  104  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  36.13 
 
 
699 aa  103  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0580  putative transporter  20.15 
 
 
1109 aa  102  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0665985  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  27.36 
 
 
713 aa  102  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  33.74 
 
 
576 aa  101  8e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  27.46 
 
 
745 aa  100  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1580  hypothetical protein  37.27 
 
 
869 aa  100  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000620673 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  37.42 
 
 
702 aa  100  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  35.08 
 
 
780 aa  100  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0591  MmpL family membrane protein  19.77 
 
 
1109 aa  99.8  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  34.78 
 
 
673 aa  99.8  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  28.9 
 
 
730 aa  99.4  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  29.47 
 
 
712 aa  99  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  34.62 
 
 
682 aa  98.6  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  35.68 
 
 
753 aa  99  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  38.85 
 
 
701 aa  98.6  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  33.56 
 
 
702 aa  98.6  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  37.5 
 
 
699 aa  97.4  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0683  MMPL domain-containing protein  38.1 
 
 
679 aa  96.3  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316421 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  36.91 
 
 
697 aa  96.3  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  35.4 
 
 
339 aa  95.1  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  38.1 
 
 
733 aa  95.5  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  35.4 
 
 
713 aa  94.7  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  38.61 
 
 
700 aa  94.7  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1450  hypothetical protein  38.78 
 
 
863 aa  94  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  37.3 
 
 
714 aa  93.6  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0224  MMPL domain-containing protein  36.73 
 
 
678 aa  94  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  35.17 
 
 
778 aa  93.6  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  34.9 
 
 
775 aa  92.8  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  30.81 
 
 
747 aa  92  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2105  MMPL domain protein  37.11 
 
 
762 aa  92.4  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174165  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  30.03 
 
 
699 aa  92  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0161  hypothetical protein  35.29 
 
 
934 aa  92  5e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.703618 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  36.05 
 
 
674 aa  90.5  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>