93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11771 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11947  PPE family protein  67.56 
 
 
1013 aa  1011    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11771  PPE family protein  100 
 
 
975 aa  1813    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.49393e-28  hitchhiker  0.0000000153091 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13386  PPE family protein  46.63 
 
 
3787 aa  389  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000441987 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11946  PPE family protein  49.66 
 
 
1457 aa  369  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.515956  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11581  PPE family protein  47.64 
 
 
760 aa  356  1e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.912214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13566  PPE family protein  51.54 
 
 
582 aa  348  4e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.514261  hitchhiker  0.0000000713233 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10360  PPE family protein  38.19 
 
 
3295 aa  345  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.683224 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10310  PPE family protein  49.83 
 
 
3166 aa  333  1e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.395007 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13381  PPE family protein  47.67 
 
 
647 aa  327  5e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00213792  normal  0.0214486 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13376  PPE family protein  45.95 
 
 
2532 aa  325  2e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0812485  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10769  PPE family protein  44.93 
 
 
645 aa  301  4e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000490344  normal  0.972574 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12382  PPE family protein  54.6 
 
 
615 aa  296  1e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105692  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11157  PPE family protein  52.96 
 
 
636 aa  293  1e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.38215e-17  normal  0.405765 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12379  PPE family protein  51.98 
 
 
613 aa  281  4e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000086115  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13180  PPE family protein  53.21 
 
 
590 aa  281  4e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.78339e-28  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10895  PPE family protein  52.2 
 
 
448 aa  258  4e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0951157  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13380  PPE family protein  43.99 
 
 
2472 aa  247  6e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.21147  normal  0.142656 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13591  PPE family protein  46.21 
 
 
551 aa  233  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000128496  normal  0.122271 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  51.67 
 
 
580 aa  211  7e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10447  PPE family protein  42.69 
 
 
487 aa  197  9e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.925376  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  57.89 
 
 
655 aa  167  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13165  PPE family protein  62.64 
 
 
409 aa  157  9e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11832  PPE family protein  54.6 
 
 
423 aa  146  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000026976  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13145  PPE family protein  51.78 
 
 
391 aa  144  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.213785 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11838  PPE family protein  55.75 
 
 
409 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10392  PPE family protein  53.95 
 
 
443 aa  137  9e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000154935  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11392  PPE family protein  48.24 
 
 
396 aa  132  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12376  PPE family protein  56.74 
 
 
391 aa  131  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  5.84927e-25  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13513  PPE family protein  47.06 
 
 
392 aa  131  7.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11837  PPE family protein  52.3 
 
 
403 aa  130  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11720  PPE family protein  50.88 
 
 
385 aa  130  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.112292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13565  PPE family protein  46.19 
 
 
406 aa  129  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000859509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12906  PPE family protein  53.85 
 
 
408 aa  127  9e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00379008  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13157  PPE family protein  39.64 
 
 
380 aa  126  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11839  PPE family protein  51.45 
 
 
470 aa  125  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11220  PPE family protein  47.06 
 
 
391 aa  125  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.540836  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10933  PPE family protein  54.34 
 
 
423 aa  120  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11817  PPE family protein  48.54 
 
 
350 aa  117  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11833  PPE family protein  56.11 
 
 
463 aa  116  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031557  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11820  PPE family protein  48.54 
 
 
350 aa  116  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.261988  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11819  PPE family protein  56.07 
 
 
393 aa  115  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.240142  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13572  PPE family protein  57.47 
 
 
479 aa  111  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542589 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12783  PPE family protein  46.67 
 
 
382 aa  108  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34943 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12458  PPE family protein  32.75 
 
 
194 aa  100  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.755851 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13652  PPE family protein  47.37 
 
 
413 aa  99.4  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.134565  hitchhiker  0.000334929 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11721  PPE family protein  49.43 
 
 
394 aa  98.6  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.168821 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11193  PPE family protein  40.35 
 
 
346 aa  97.8  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12781  PPE family protein  48.89 
 
 
394 aa  95.1  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000422215  normal  0.399199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11057  PPE family protein  50.87 
 
 
391 aa  92  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.824067 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3860  pentapeptide repeat containing protein  49.46 
 
 
285 aa  88.6  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.179261  normal  0.135456 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10359  PPE family protein  51.64 
 
 
183 aa  86.7  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.215984  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13458  hypothetical protein  32.75 
 
 
176 aa  85.9  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423938  hitchhiker  0.0000923952 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13465  PPE family protein  32.57 
 
 
178 aa  85.9  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213323  hitchhiker  0.000182876 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13459  PPE family protein  32.54 
 
 
173 aa  85.5  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.091e-18  hitchhiker  0.000474891 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13462  PPE family protein  30.64 
 
 
180 aa  83.6  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119714  decreased coverage  0.000040288 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10459  PPE family protein  39.24 
 
 
518 aa  83.6  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11416  PPE family protein  33.13 
 
 
539 aa  81.3  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000793928  normal  0.128386 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0196  pentapeptide repeat-containing protein  47.93 
 
 
315 aa  79.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12140  PPE family protein  36.21 
 
 
213 aa  79  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.95332e-49  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0811  pentapeptide repeat containing protein  48.61 
 
 
278 aa  78.6  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2875  pentapeptide repeat containing protein  48.61 
 
 
278 aa  78.6  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.88171  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0216  pentapeptide repeat-containing protein  42.41 
 
 
316 aa  77.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0207  pentapeptide repeat-containing protein  42.41 
 
 
316 aa  77.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0768  PPE protein  33.12 
 
 
436 aa  76.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10293  PPE family protein  39.6 
 
 
513 aa  75.5  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.312861 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10097  PPE family protein  38.19 
 
 
463 aa  73.6  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13037  PPE family protein  38.51 
 
 
435 aa  73.2  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.52144e-113  hitchhiker  0.00208652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13033  PPE family protein  38.51 
 
 
434 aa  72.8  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.2921e-59  normal  0.0390657 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1851  pentapeptide repeat-containing protein  33.49 
 
 
551 aa  72.4  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000406154  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0325  PPE protein  36.09 
 
 
540 aa  72  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500492  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10259  PPE family protein  32.69 
 
 
556 aa  71.6  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0388917 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13908  PPE family protein  36.94 
 
 
368 aa  71.2  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00117141  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10287  PPE family protein  36.91 
 
 
536 aa  66.6  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.80093e-35  normal  0.372086 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0327  PPE protein  32.5 
 
 
445 aa  65.9  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.821755  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0415  PPE protein  37.66 
 
 
524 aa  65.1  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0374  PPE protein  38.56 
 
 
525 aa  64.3  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0363  PPE protein  38.56 
 
 
525 aa  64.3  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0384  PPE protein  38.56 
 
 
525 aa  64.3  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5774  PPE protein  37.37 
 
 
413 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.118496 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0069  PPE protein  32.05 
 
 
443 aa  63.2  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439016  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0078  PPE protein  32.05 
 
 
443 aa  63.2  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.6171  normal  0.0155913 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0059  PPE protein  32.05 
 
 
443 aa  62.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0146152 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13156  PPE family protein  48.31 
 
 
185 aa  59.7  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5055  hypothetical protein  46.67 
 
 
265 aa  57.4  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12155  PPE family protein  35.98 
 
 
496 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.649845 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13771  PPE family protein  48.48 
 
 
77 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0077  PPE protein  32.03 
 
 
439 aa  54.3  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.150251  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5651  exported repetitive protein precursor PirG (cell surface protein) (EXP53)  40.8 
 
 
320 aa  52.4  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.692701 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  40.2 
 
 
819 aa  50.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4569  hypothetical protein  20.69 
 
 
495 aa  49.3  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0942693  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4835  hypothetical protein  30.28 
 
 
1168 aa  47  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.391306  decreased coverage  0.000518688 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  29.09 
 
 
900 aa  47  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1158  repeat of unknown function XGLTT  34.09 
 
 
324 aa  46.6  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.04272  normal  0.133986 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>