More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11768 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3835  AMP-dependent synthetase and ligase  61.98 
 
 
532 aa  661  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3965  acyl-CoA synthetase  65.09 
 
 
527 aa  646  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.551618  normal  0.449613 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4341  acyl-CoA synthetase  66.54 
 
 
526 aa  709  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227386  normal  0.0335846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3891  acyl-CoA synthetase  65.09 
 
 
527 aa  646  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3877  acyl-CoA synthetase  65.09 
 
 
527 aa  646  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.133257 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11768  acyl-CoA synthetase  100 
 
 
532 aa  1085  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  3.65626e-06 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2305  acyl-CoA synthetase  65.39 
 
 
525 aa  703  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.918677 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1549  acyl-CoA synthetase  52.73 
 
 
512 aa  478  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00257603  normal  0.272175 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4712  acyl-CoA synthetase  52.09 
 
 
500 aa  478  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4624  acyl-CoA synthetase  52.09 
 
 
500 aa  478  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3512  AMP-dependent synthetase and ligase  51.39 
 
 
539 aa  474  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.161778  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5007  acyl-CoA synthetase  53.86 
 
 
501 aa  471  1e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223508  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13540  acyl-CoA synthetase  52.05 
 
 
502 aa  461  1e-128  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.55264e-46  hitchhiker  1.44188e-05 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5208  acyl-CoA synthetase  54.07 
 
 
503 aa  457  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3957  AMP-dependent synthetase and ligase  48.03 
 
 
518 aa  437  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3484  AMP-dependent synthetase and ligase  44.61 
 
 
551 aa  415  1e-115  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.436889  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8199  AMP-dependent synthetase and ligase  45.35 
 
 
522 aa  401  1e-110  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.996066  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5900  acyl-CoA synthetase  42.35 
 
 
543 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0206  acyl-CoA synthetase  46.64 
 
 
549 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1548  acyl-CoA synthetase  43.25 
 
 
557 aa  381  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0453148  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5209  acyl-CoA synthetase  43.52 
 
 
554 aa  375  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2118  AMP-dependent synthetase and ligase  32.23 
 
 
613 aa  209  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000346834  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0112  AMP-dependent synthetase and ligase  31.5 
 
 
572 aa  201  3e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1300  DitJ-like CoA ligase  29.73 
 
 
547 aa  187  5e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2709  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.37 
 
 
534 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.710965  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2688  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.37 
 
 
534 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.204709  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0040  AMP-dependent synthetase and ligase  29.09 
 
 
708 aa  176  8e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1508  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  29.27 
 
 
535 aa  165  2e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3258  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  27.84 
 
 
545 aa  163  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15308  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2757  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  27.37 
 
 
538 aa  160  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679806  normal  0.462941 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7121  AMP-dependent synthetase and ligase  32.22 
 
 
542 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0866  AMP-dependent synthetase and ligase  31.05 
 
 
509 aa  157  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3639  AMP-dependent synthetase and ligase  28.24 
 
 
512 aa  157  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.917263  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3316  long-chain-acyl-CoA synthetase  30.49 
 
 
608 aa  156  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390941  hitchhiker  5.71786e-05 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3882  AMP-dependent synthetase and ligase  30.4 
 
 
549 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3345  acid-CoA ligase family protein  27.65 
 
 
547 aa  153  8e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4608  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  31.61 
 
 
550 aa  150  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0075  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.07 
 
 
517 aa  150  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33180  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.21 
 
 
509 aa  149  1e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0193282  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2066  AMP-dependent synthetase and ligase  29.52 
 
 
527 aa  149  2e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  30.64 
 
 
532 aa  148  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0077  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.07 
 
 
517 aa  147  4e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0079  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.87 
 
 
517 aa  146  7e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.187597  normal  0.982419 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0078  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.46 
 
 
517 aa  146  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  25.56 
 
 
552 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0075  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.66 
 
 
517 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.672086  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  29.36 
 
 
520 aa  144  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4007  long-chain-acyl-CoA synthetase  28.68 
 
 
592 aa  144  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.657785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4081  long-chain-acyl-CoA synthetase  28.68 
 
 
592 aa  144  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0876602  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4237  long-chain-acyl-CoA synthetase  28.68 
 
 
592 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.168634 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2453  AMP-dependent synthetase and ligase  28.44 
 
 
544 aa  142  1e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1832  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  30.47 
 
 
537 aa  142  2e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.603335 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0832  AMP-dependent synthetase and ligase  27.67 
 
 
551 aa  141  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2539  putative acyl-CoA synthetase  29.22 
 
 
546 aa  140  5e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.389975 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  26.67 
 
 
570 aa  140  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  27.82 
 
 
576 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  27.82 
 
 
576 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4281  AMP-dependent synthetase and ligase  27.22 
 
 
524 aa  139  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131424  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  27.82 
 
 
576 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  27.82 
 
 
576 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  27.82 
 
 
576 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  27.82 
 
 
570 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0576  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.76 
 
 
516 aa  139  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  30.96 
 
 
535 aa  138  3e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.114603  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  27.6 
 
 
578 aa  137  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  28.97 
 
 
525 aa  137  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1645  long-chain-acyl-CoA synthetase  27.85 
 
 
600 aa  137  6e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  27.68 
 
 
576 aa  137  6e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  25.79 
 
 
576 aa  136  1e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1150  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  26.54 
 
 
509 aa  135  2e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.794043  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7061  AMP-dependent synthetase and ligase  26.85 
 
 
513 aa  135  2e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.131857 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6181  AMP-dependent synthetase and ligase  27.82 
 
 
537 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  26.24 
 
 
576 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3892  AMP-binding domain protein  25.75 
 
 
576 aa  133  8e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239396  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  29.95 
 
 
510 aa  133  9e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3780  AMP-dependent synthetase and ligase  28.29 
 
 
577 aa  132  1e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.97917 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2150  long-chain-acyl-CoA synthetase  28.81 
 
 
621 aa  132  2e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1103  long-chain-acyl-CoA synthetase  31.7 
 
 
630 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6217  AMP-dependent synthetase and ligase  30.57 
 
 
546 aa  131  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158197  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  27.22 
 
 
576 aa  131  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17630  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  28.73 
 
 
592 aa  131  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.100128  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00040  hypothetical protein  24.64 
 
 
522 aa  131  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1000  long-chain-acyl-CoA synthetase  29.74 
 
 
622 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.832439 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00041  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  24.64 
 
 
522 aa  131  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2434  AMP-dependent synthetase and ligase  27.76 
 
 
534 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.097494  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  25.86 
 
 
529 aa  131  4e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1747  AMP-dependent synthetase and ligase  26 
 
 
517 aa  130  5e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4612  AMP-dependent synthetase and ligase  25.4 
 
 
511 aa  130  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0041  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  24.64 
 
 
517 aa  130  7e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3540  long-chain-acyl-CoA synthetase  28.79 
 
 
596 aa  130  7e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.498772 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  30.83 
 
 
506 aa  129  9e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3618  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  24.64 
 
 
505 aa  129  1e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.221467 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  29.7 
 
 
512 aa  129  1e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2673  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.77 
 
 
518 aa  129  1e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0414  AMP-dependent synthetase and ligase  25.05 
 
 
511 aa  129  1e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3769  AMP-dependent synthetase and ligase  28.18 
 
 
568 aa  129  1e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.43817  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0333  AMP-binding domain protein  26.69 
 
 
571 aa  129  1e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  27.08 
 
 
505 aa  129  1e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  26.46 
 
 
544 aa  129  1e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  29.4 
 
 
521 aa  129  1e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>