81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11720 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11720  PPE family protein  100 
 
 
385 aa  739  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.112292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11819  PPE family protein  58.06 
 
 
393 aa  269  7e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.240142  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11837  PPE family protein  50.37 
 
 
403 aa  233  5e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11832  PPE family protein  48.44 
 
 
423 aa  228  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.6976e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11838  PPE family protein  50.14 
 
 
409 aa  226  6e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12906  PPE family protein  45.39 
 
 
408 aa  224  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00379008  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11820  PPE family protein  43.3 
 
 
350 aa  221  2e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.261988  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11817  PPE family protein  42.35 
 
 
350 aa  211  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11839  PPE family protein  44.21 
 
 
470 aa  206  5e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13565  PPE family protein  40.24 
 
 
406 aa  198  2e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  8.59509e-09 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11833  PPE family protein  45.94 
 
 
463 aa  196  5e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.1557e-11  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13157  PPE family protein  38.46 
 
 
380 aa  195  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11392  PPE family protein  38.29 
 
 
396 aa  193  4e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13513  PPE family protein  36.52 
 
 
392 aa  184  2e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12783  PPE family protein  46.3 
 
 
382 aa  182  7e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34943 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11220  PPE family protein  36.77 
 
 
391 aa  175  9e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.540836  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10933  PPE family protein  42.18 
 
 
423 aa  175  1e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11721  PPE family protein  62.44 
 
 
394 aa  169  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.168821 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10392  PPE family protein  62.91 
 
 
443 aa  164  2e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.54935e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11057  PPE family protein  42.22 
 
 
391 aa  164  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.824067 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12781  PPE family protein  40.78 
 
 
394 aa  163  4e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000422215  normal  0.399199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13145  PPE family protein  40.12 
 
 
391 aa  150  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.213785 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11581  PPE family protein  52.41 
 
 
760 aa  146  6e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.912214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10360  PPE family protein  55.62 
 
 
3295 aa  135  8e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.683224 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  53.57 
 
 
580 aa  135  9e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.2358e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11946  PPE family protein  51.98 
 
 
1457 aa  133  5e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.515956  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11193  PPE family protein  37 
 
 
346 aa  130  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10895  PPE family protein  50.79 
 
 
448 aa  126  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0951157  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  52.44 
 
 
655 aa  126  7e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12376  PPE family protein  51.46 
 
 
391 aa  125  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  5.84927e-25  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10769  PPE family protein  53.02 
 
 
645 aa  120  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000490344  normal  0.972574 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13566  PPE family protein  51.19 
 
 
582 aa  120  5e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.514261  hitchhiker  7.13233e-08 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13165  PPE family protein  51.48 
 
 
409 aa  120  5e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10310  PPE family protein  55.36 
 
 
3166 aa  119  7e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.395007 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12458  PPE family protein  36.99 
 
 
194 aa  118  1e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.755851 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0327  PPE protein  40.68 
 
 
445 aa  115  1e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.821755  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11771  PPE family protein  50.88 
 
 
975 aa  114  2e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.49393e-28  hitchhiker  1.53091e-08 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13386  PPE family protein  51.3 
 
 
3787 aa  111  2e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000441987 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13180  PPE family protein  51.28 
 
 
590 aa  102  8e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.78339e-28  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10447  PPE family protein  47.74 
 
 
487 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.925376  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11947  PPE family protein  50.88 
 
 
1013 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12140  PPE family protein  36.09 
 
 
213 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.95332e-49  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13376  PPE family protein  51.22 
 
 
2532 aa  92  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0812485  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11416  PPE family protein  34.13 
 
 
539 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.93928e-11  normal  0.128386 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0768  PPE protein  34.94 
 
 
436 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13591  PPE family protein  50.31 
 
 
551 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.28496e-05  normal  0.122271 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13033  PPE family protein  34.01 
 
 
434 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.2921e-59  normal  0.0390657 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13037  PPE family protein  38.15 
 
 
435 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.52144e-113  hitchhiker  0.00208652 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0059  PPE protein  37.95 
 
 
443 aa  87  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0146152 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0078  PPE protein  37.95 
 
 
443 aa  87  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.6171  normal  0.0155913 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0069  PPE protein  37.95 
 
 
443 aa  87  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439016  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13572  PPE family protein  52.1 
 
 
479 aa  85.5  1e-15  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  5.42589e-05 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10097  PPE family protein  37.98 
 
 
463 aa  85.1  2e-15  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10259  PPE family protein  35.14 
 
 
556 aa  84  4e-15  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0388917 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11157  PPE family protein  50.81 
 
 
636 aa  82.8  1e-14  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.38215e-17  normal  0.405765 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12382  PPE family protein  52.2 
 
 
615 aa  81.3  2e-14  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.05692e-12  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13908  PPE family protein  38.46 
 
 
368 aa  82  2e-14  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00117141  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0077  PPE protein  36.9 
 
 
439 aa  81.6  2e-14  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.150251  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10459  PPE family protein  30.43 
 
 
518 aa  80.5  4e-14  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13458  hypothetical protein  32.34 
 
 
176 aa  74.7  2e-12  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.23938e-12  hitchhiker  9.23952e-05 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0325  PPE protein  39.16 
 
 
540 aa  74.3  3e-12  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500492  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13465  PPE family protein  31.71 
 
 
178 aa  73.9  5e-12  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.13323e-10  hitchhiker  0.000182876 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13459  PPE family protein  31.14 
 
 
173 aa  73.6  5e-12  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.091e-18  hitchhiker  0.000474891 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0415  PPE protein  42.21 
 
 
524 aa  72.8  9e-12  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10293  PPE family protein  40 
 
 
513 aa  72.8  1e-11  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.312861 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10287  PPE family protein  39.86 
 
 
536 aa  71.2  3e-11  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.80093e-35  normal  0.372086 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13462  PPE family protein  28.32 
 
 
180 aa  69.7  8e-11  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.19714e-09  decreased coverage  4.0288e-05 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13156  PPE family protein  50.38 
 
 
185 aa  69.7  8e-11  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13381  PPE family protein  50 
 
 
647 aa  68.9  1e-10  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00213792  normal  0.0214486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0374  PPE protein  40 
 
 
525 aa  68.2  2e-10  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0363  PPE protein  40 
 
 
525 aa  68.2  2e-10  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0384  PPE protein  40 
 
 
525 aa  68.2  2e-10  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5962  PPE protein  32.53 
 
 
452 aa  67.4  4e-10  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.738574  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5559  PPE protein  32.53 
 
 
452 aa  67.4  4e-10  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67535  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12155  PPE family protein  37.95 
 
 
496 aa  67  5e-10  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.649845 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12379  PPE family protein  51.37 
 
 
613 aa  63.9  5e-09  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.6115e-13  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5459  PPE protein  37.65 
 
 
450 aa  57.4  5e-07  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.785537  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5774  PPE protein  39.73 
 
 
413 aa  51.2  3e-05  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.118496 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13652  PPE family protein  38.32 
 
 
413 aa  47  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.134565  hitchhiker  0.000334929 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13770  PPE family protein  42.67 
 
 
315 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13771  PPE family protein  41.18 
 
 
77 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>