More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11657 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  53.99 
 
 
1138 aa  1194    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  50.91 
 
 
1094 aa  919    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  50.46 
 
 
1100 aa  998    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  74.67 
 
 
1111 aa  1647    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 
1113 aa  837    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  74.33 
 
 
1112 aa  1642    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 
1120 aa  809    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  49.06 
 
 
1098 aa  1009    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 
1172 aa  2375    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3027  lysyl-tRNA synthetase  74.33 
 
 
1112 aa  1642    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  75.84 
 
 
1100 aa  1622    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  46 
 
 
1147 aa  830    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  74.34 
 
 
1101 aa  1610    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8377  lysyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 
506 aa  540  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2881  lysyl-tRNA synthetase  53.72 
 
 
496 aa  525  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.075021  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4987  lysyl-tRNA synthetase  53.01 
 
 
500 aa  512  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.771259  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4482  lysyl-tRNA synthetase  51 
 
 
499 aa  498  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16450  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 
499 aa  499  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9155  lysyl-tRNA synthetase  51.6 
 
 
500 aa  496  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3422  lysyl-tRNA synthetase  50.49 
 
 
499 aa  491  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316072  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0216  lysyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 
501 aa  473  1.0000000000000001e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404886  normal  0.127983 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0637  lysyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 
528 aa  445  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4347  lysyl-tRNA synthetase  48.61 
 
 
516 aa  443  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4277  lysyl-tRNA synthetase  48 
 
 
502 aa  439  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.654573 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0641  lysyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 
495 aa  438  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.15563 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4711  lysyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 
502 aa  432  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243441  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31970  lysyl-tRNA synthetase (class II)  45.49 
 
 
510 aa  420  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0329  lysyl-tRNA synthetase  46 
 
 
503 aa  422  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12890  lysyl-tRNA synthetase (class II)  44.98 
 
 
502 aa  417  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0133257  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2092  lysyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 
515 aa  417  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2977  lysyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 
504 aa  418  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.120285  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0855  lysyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 
504 aa  415  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4000  lysyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 
507 aa  414  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0329  lysyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 
512 aa  408  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24660  lysyl-tRNA synthetase  45 
 
 
520 aa  406  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01510  lysyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 
504 aa  405  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0576  lysyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 
500 aa  406  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.1487  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4758  lysyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 
512 aa  405  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.38099  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0165  lysyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 
510 aa  405  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5144  lysyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 
512 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4844  lysyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 
512 aa  405  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0720  lysyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 
503 aa  402  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  0.145533 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5360  lysyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 
509 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370612  normal  0.216522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6803  protein of unknown function DUF470  41.4 
 
 
592 aa  391  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13631  lysyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 
505 aa  390  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.57395e-59  normal  0.0200312 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6309  lysyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
501 aa  389  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 
573 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2476  protein of unknown function DUF470  52.46 
 
 
578 aa  382  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 
573 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1428  lysyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 
501 aa  383  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.680622  normal  0.318104 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0393  lysine--tRNA ligase  41.28 
 
 
565 aa  382  1e-104  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 
501 aa  380  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1906  lysyl-tRNA synthetase  46.56 
 
 
498 aa  379  1e-103  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1357  lysyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
501 aa  374  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 
504 aa  371  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 
573 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1777  lysyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 
560 aa  372  1e-101  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0105014  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 
561 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 
1118 aa  368  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 
491 aa  366  2e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 
499 aa  365  4e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1485  lysyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 
562 aa  363  9e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 
497 aa  363  1e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 
509 aa  363  1e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1711  lysyl-tRNA synthetase  38.65 
 
 
512 aa  360  8e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0154  lysyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 
502 aa  359  1.9999999999999998e-97  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 
489 aa  359  1.9999999999999998e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 
499 aa  357  5.999999999999999e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  40.32 
 
 
505 aa  357  1e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  40.32 
 
 
505 aa  357  1e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3862  lysyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 
505 aa  356  1e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 
505 aa  356  1e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18101  lysyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 
512 aa  356  1e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 
505 aa  356  1e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 
505 aa  356  1e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18281  lysyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 
488 aa  355  2e-96  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.505849  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6390  lysyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 
583 aa  355  4e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163114  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 
509 aa  355  4e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
505 aa  354  5e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2354  lysyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 
496 aa  354  5e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0808673  decreased coverage  0.00196891 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
505 aa  354  5e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1187  lysyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 
533 aa  352  2e-95  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.33244  normal  0.0846582 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 
489 aa  352  2e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01841  lysyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 
508 aa  352  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0271  lysyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 
508 aa  352  3e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000549631  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 
501 aa  352  3e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0551  lysyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 
498 aa  351  4e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18071  lysyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 
512 aa  351  4e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66414  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0503  lysyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 
504 aa  351  5e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1001  lysyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 
502 aa  351  5e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000393607  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0009  lysyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 
489 aa  351  5e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00617172  hitchhiker  0.00000378083 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1129  lysyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 
502 aa  351  5e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0254067  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 
508 aa  350  6e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2847  lysyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 
484 aa  351  6e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 
501 aa  350  6e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1378  lysyl-tRNA synthetase  36.85 
 
 
502 aa  350  7e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00071  lysyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 
505 aa  350  8e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381624  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13230  lysyl-tRNA synthetase (class II)  39.31 
 
 
771 aa  350  8e-95  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0295969  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3308  lysyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 
505 aa  350  8e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2319  lysyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 
1132 aa  350  1e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>