50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11605 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11605  REP13E12 repeat-containing protein  100 
 
 
222 aa  434  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.46537e-16  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10096  hypothetical protein  96.4 
 
 
260 aa  370  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.493023  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13503  hypothetical protein  95.95 
 
 
222 aa  344  5e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.946921  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11151  hypothetical protein  57.66 
 
 
451 aa  149  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11717  hypothetical protein  54.35 
 
 
454 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.12455 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11974  hypothetical protein  58.27 
 
 
454 aa  124  9e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11173  hypothetical protein  58.27 
 
 
499 aa  124  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3050  hypothetical protein  39.57 
 
 
495 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4451  hypothetical protein  36.69 
 
 
518 aa  85.1  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3851  hypothetical protein  36.69 
 
 
513 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.432378 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4912  hypothetical protein  39.55 
 
 
508 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477526  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4397  hypothetical protein  41.27 
 
 
501 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3231  hypothetical protein  39.55 
 
 
510 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5865  hypothetical protein  39.39 
 
 
511 aa  78.6  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563621  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1835  hypothetical protein  40 
 
 
489 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3477  hypothetical protein  41.8 
 
 
506 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.800826  normal  0.648899 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4827  hypothetical protein  36.57 
 
 
508 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.79889  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1777  hypothetical protein  37.12 
 
 
507 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159063  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2793  hypothetical protein  36.57 
 
 
473 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.925956  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1730  hypothetical protein  37.12 
 
 
507 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2749  hypothetical protein  36.57 
 
 
473 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.621595  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1709  hypothetical protein  37.12 
 
 
507 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3615  hypothetical protein  37.12 
 
 
444 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3542  hypothetical protein  37.12 
 
 
444 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0338  hypothetical protein  36.03 
 
 
492 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0348  hypothetical protein  36.03 
 
 
492 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5454  hypothetical protein  37.12 
 
 
519 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157039  decreased coverage  0.0069948 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3484  hypothetical protein  36.03 
 
 
552 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210016  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4351  hypothetical protein  37.12 
 
 
507 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489972  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5741  hypothetical protein  37.12 
 
 
519 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4437  hypothetical protein  37.12 
 
 
507 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.835135  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2106  hypothetical protein  38.98 
 
 
446 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.426457  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4731  hypothetical protein  37.12 
 
 
507 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5363  hypothetical protein  37.12 
 
 
355 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2152  hypothetical protein  36.76 
 
 
492 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.166446 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2089  hypothetical protein  37.01 
 
 
493 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4014  hypothetical protein  37.5 
 
 
464 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00728967 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0170  hypothetical protein  36.36 
 
 
442 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3547  hypothetical protein  35.61 
 
 
444 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0179  hypothetical protein  36.36 
 
 
442 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0327  hypothetical protein  36.03 
 
 
490 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2779  hypothetical protein  35.61 
 
 
473 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3379  hypothetical protein  37.62 
 
 
497 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal  0.158077 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4610  hypothetical protein  37.5 
 
 
448 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4232  hypothetical protein  37.5 
 
 
448 aa  62  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815534  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3803  hypothetical protein  36.61 
 
 
447 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.866819  normal  0.47715 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2470  protein of unknown function DUF222  38.66 
 
 
437 aa  53.5  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4127  protein of unknown function DUF222  36.97 
 
 
532 aa  52.8  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3745  protein of unknown function DUF222  36.97 
 
 
531 aa  52.4  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2293  protein of unknown function DUF222  30.99 
 
 
540 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>