96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11581 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11581  PPE family protein  100 
 
 
760 aa  1444    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.912214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11157  PPE family protein  51.84 
 
 
636 aa  414  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.38215e-17  normal  0.405765 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12382  PPE family protein  52.48 
 
 
615 aa  383  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105692  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13566  PPE family protein  46.8 
 
 
582 aa  320  6e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.514261  hitchhiker  0.0000000713233 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13180  PPE family protein  52.58 
 
 
590 aa  318  2e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.78339e-28  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12379  PPE family protein  48.1 
 
 
613 aa  318  2e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000086115  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10769  PPE family protein  43.14 
 
 
645 aa  313  7.999999999999999e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000490344  normal  0.972574 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10360  PPE family protein  43.15 
 
 
3295 aa  288  2e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.683224 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11771  PPE family protein  47.84 
 
 
975 aa  279  2e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.49393e-28  hitchhiker  0.0000000153091 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10895  PPE family protein  48.42 
 
 
448 aa  261  4e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0951157  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11946  PPE family protein  52.97 
 
 
1457 aa  234  6e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.515956  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13386  PPE family protein  50.45 
 
 
3787 aa  228  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000441987 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13591  PPE family protein  43.31 
 
 
551 aa  213  7.999999999999999e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000128496  normal  0.122271 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  59.7 
 
 
580 aa  206  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10310  PPE family protein  49.41 
 
 
3166 aa  205  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.395007 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11947  PPE family protein  49.44 
 
 
1013 aa  201  6e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13376  PPE family protein  46.89 
 
 
2532 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0812485  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13380  PPE family protein  48.69 
 
 
2472 aa  195  3e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.21147  normal  0.142656 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10447  PPE family protein  51.66 
 
 
487 aa  190  7e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.925376  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13381  PPE family protein  52.53 
 
 
647 aa  188  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00213792  normal  0.0214486 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  67.07 
 
 
655 aa  169  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13145  PPE family protein  62.07 
 
 
391 aa  156  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.213785 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13165  PPE family protein  63.69 
 
 
409 aa  155  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12376  PPE family protein  62.64 
 
 
391 aa  140  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  5.84927e-25  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11838  PPE family protein  52.91 
 
 
409 aa  140  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11832  PPE family protein  52.02 
 
 
423 aa  139  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000026976  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12906  PPE family protein  54.65 
 
 
408 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00379008  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11392  PPE family protein  46.24 
 
 
396 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11720  PPE family protein  52.41 
 
 
385 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.112292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11839  PPE family protein  52.87 
 
 
470 aa  128  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13513  PPE family protein  44.77 
 
 
392 aa  127  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11837  PPE family protein  56.21 
 
 
403 aa  127  9e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13565  PPE family protein  47.34 
 
 
406 aa  126  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000859509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10392  PPE family protein  50.33 
 
 
443 aa  121  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000154935  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10933  PPE family protein  52.94 
 
 
423 aa  121  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13157  PPE family protein  39.22 
 
 
380 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11220  PPE family protein  44.83 
 
 
391 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.540836  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11817  PPE family protein  47.98 
 
 
350 aa  117  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11820  PPE family protein  47.98 
 
 
350 aa  117  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.261988  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12783  PPE family protein  50.65 
 
 
382 aa  115  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34943 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11819  PPE family protein  57.62 
 
 
393 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.240142  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11721  PPE family protein  52.2 
 
 
394 aa  108  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.168821 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11833  PPE family protein  55.81 
 
 
463 aa  108  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031557  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11057  PPE family protein  53.33 
 
 
391 aa  105  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.824067 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13652  PPE family protein  53.38 
 
 
413 aa  103  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.134565  hitchhiker  0.000334929 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13572  PPE family protein  57.49 
 
 
479 aa  102  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542589 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12781  PPE family protein  53.64 
 
 
394 aa  102  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000422215  normal  0.399199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12458  PPE family protein  33.71 
 
 
194 aa  100  7e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.755851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0196  pentapeptide repeat-containing protein  48.82 
 
 
315 aa  90.9  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0207  pentapeptide repeat-containing protein  48.03 
 
 
316 aa  89  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0216  pentapeptide repeat-containing protein  48.03 
 
 
316 aa  89  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11193  PPE family protein  34.47 
 
 
346 aa  87.4  8e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13459  PPE family protein  32.67 
 
 
173 aa  82.4  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.091e-18  hitchhiker  0.000474891 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11416  PPE family protein  33.73 
 
 
539 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000793928  normal  0.128386 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13462  PPE family protein  31.4 
 
 
180 aa  79.7  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119714  decreased coverage  0.000040288 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12140  PPE family protein  39.17 
 
 
213 aa  78.6  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.95332e-49  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10459  PPE family protein  34.94 
 
 
518 aa  77.4  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10259  PPE family protein  31.74 
 
 
556 aa  77.4  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0388917 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0327  PPE protein  33.33 
 
 
445 aa  77  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.821755  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13458  hypothetical protein  31.33 
 
 
176 aa  75.5  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423938  hitchhiker  0.0000923952 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0768  PPE protein  32.98 
 
 
436 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13037  PPE family protein  35.53 
 
 
435 aa  71.6  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.52144e-113  hitchhiker  0.00208652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13033  PPE family protein  37.13 
 
 
434 aa  71.2  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.2921e-59  normal  0.0390657 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1851  pentapeptide repeat-containing protein  37.93 
 
 
551 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000406154  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0069  PPE protein  33.72 
 
 
443 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439016  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0059  PPE protein  33.72 
 
 
443 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0146152 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0078  PPE protein  33.72 
 
 
443 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.6171  normal  0.0155913 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13465  PPE family protein  27.81 
 
 
178 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213323  hitchhiker  0.000182876 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10293  PPE family protein  39.43 
 
 
513 aa  65.1  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.312861 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10287  PPE family protein  34.94 
 
 
536 aa  65.1  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.80093e-35  normal  0.372086 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13156  PPE family protein  49.14 
 
 
185 aa  63.9  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5774  PPE protein  43.81 
 
 
413 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.118496 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0325  PPE protein  34.91 
 
 
540 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500492  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0415  PPE protein  37.75 
 
 
524 aa  62  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0374  PPE protein  36.71 
 
 
525 aa  61.6  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0384  PPE protein  36.71 
 
 
525 aa  61.6  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0363  PPE protein  36.71 
 
 
525 aa  61.6  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10097  PPE family protein  36.81 
 
 
463 aa  61.2  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3860  pentapeptide repeat containing protein  44.83 
 
 
285 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.179261  normal  0.135456 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13908  PPE family protein  36.71 
 
 
368 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00117141  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  26.58 
 
 
734 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0077  PPE protein  36.42 
 
 
439 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.150251  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  27.56 
 
 
381 aa  53.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13771  PPE family protein  40.91 
 
 
77 aa  52  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0811  pentapeptide repeat containing protein  46.75 
 
 
278 aa  50.4  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2875  pentapeptide repeat containing protein  46.75 
 
 
278 aa  50.4  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.88171  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12155  PPE family protein  35.29 
 
 
496 aa  49.3  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.649845 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  30.83 
 
 
900 aa  48.1  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5055  hypothetical protein  42.65 
 
 
265 aa  48.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  24.75 
 
 
493 aa  46.6  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  26.42 
 
 
567 aa  47  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  26.23 
 
 
401 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  26.23 
 
 
401 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  26.99 
 
 
219 aa  45.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  29.88 
 
 
576 aa  44.7  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  25.69 
 
 
483 aa  43.9  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>