More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11577 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11577  ketoacyl reductase  100 
 
 
267 aa  534  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.03 
 
 
262 aa  305  6e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.999856 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.56 
 
 
266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12531  short-chain type dehydrogenase/reductase  43.8 
 
 
268 aa  194  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342881 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.27 
 
 
261 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000076045 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.32 
 
 
256 aa  185  7e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.11 
 
 
273 aa  185  8e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19807  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18580  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  43.72 
 
 
258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.489964  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 
261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.41 
 
 
268 aa  181  9.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.700313  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.25 
 
 
268 aa  180  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.98 
 
 
271 aa  178  8e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1836  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 
260 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.63 
 
 
268 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129425  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 
264 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0188274  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
264 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000179752 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.24 
 
 
268 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.428554  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.6 
 
 
275 aa  175  7e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  0.200034 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2321  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  46.12 
 
 
275 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.195083 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.86 
 
 
268 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.230051  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000620196  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.25 
 
 
268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.522448  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.19 
 
 
264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 
263 aa  172  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.08 
 
 
255 aa  172  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.6 
 
 
264 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.036497  normal  0.609933 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.39 
 
 
258 aa  169  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.392131  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1011  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 
258 aa  169  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.968961  hitchhiker  0.00922057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.9 
 
 
255 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.125829  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0244  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 
258 aa  168  9e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 
267 aa  167  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.322734  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.711928  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.37 
 
 
258 aa  165  8e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.37 
 
 
258 aa  165  8e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.354983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.37 
 
 
258 aa  165  8e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.56 
 
 
263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.38 
 
 
267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.38 
 
 
267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.209625  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.74 
 
 
289 aa  163  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.327148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.52 
 
 
260 aa  163  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.756544 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 
262 aa  163  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.38 
 
 
267 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08440  putative short chain alcohol dehydrogenase  42.57 
 
 
266 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000229698 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.31 
 
 
259 aa  162  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 
259 aa  161  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0177311  normal  0.151964 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 
257 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.29 
 
 
291 aa  159  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.25 
 
 
258 aa  159  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.381329 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 
262 aa  159  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 
260 aa  158  8e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2195  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
250 aa  158  9e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.92313 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.15 
 
 
292 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.858349  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
259 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63890  putative short-chain dehydrogenase  40.82 
 
 
265 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
259 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.996462  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38500  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  39.04 
 
 
253 aa  156  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1269  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.57 
 
 
294 aa  156  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.618635  normal  0.87927 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
257 aa  155  4e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
263 aa  155  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5585  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 
265 aa  156  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.892025  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0799  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.11 
 
 
266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 
269 aa  155  9e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.17 
 
 
266 aa  155  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0189  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.59 
 
 
267 aa  154  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000709968  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0689  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 
259 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3621  short-chain dehydrogenase  35.34 
 
 
258 aa  154  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 
269 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3794  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
262 aa  154  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.23 
 
 
256 aa  154  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.87 
 
 
262 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.87 
 
 
262 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.87 
 
 
262 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.25 
 
 
265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.162957 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3912  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.32 
 
 
266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.97 
 
 
265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0355963  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3264  putative oxidoreductase protein  41.38 
 
 
264 aa  152  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.26 
 
 
258 aa  152  7e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00673203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.32 
 
 
266 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.98 
 
 
250 aa  151  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.757683  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0274  short chain dehydrogenase/reductase family protein  39.2 
 
 
259 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.74 
 
 
262 aa  151  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.418257  normal  0.135019 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2585  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.56 
 
 
257 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5145  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.06 
 
 
267 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645114  normal  0.0551529 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.19 
 
 
257 aa  150  2e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 
254 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.485174  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1378  hypothetical protein  33.33 
 
 
259 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.68 
 
 
272 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.514892 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.74 
 
 
262 aa  150  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.128983  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0055  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 
259 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0606  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
256 aa  150  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1382  hypothetical protein  33.73 
 
 
259 aa  149  4e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
258 aa  149  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.859893  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5551  putative short-chain dehydrogenase  40.79 
 
 
265 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.74 
 
 
263 aa  149  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.520585  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0468951  hitchhiker  0.00252787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312813  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 
259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 
266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642907  decreased coverage  0.0040913 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>