More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11572 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
224 aa  435  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2773  lipoprotein signal peptidase  80.2 
 
 
234 aa  296  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  0.677006 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  77.94 
 
 
272 aa  287  9e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3113  lipoprotein signal peptidase  75.37 
 
 
230 aa  261  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.719311  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3153  lipoprotein signal peptidase  87.16 
 
 
230 aa  241  9e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3093  lipoprotein signal peptidase  87.16 
 
 
230 aa  241  9e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280943  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  57.75 
 
 
219 aa  195  5.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3196  lipoprotein signal peptidase  48.76 
 
 
212 aa  160  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000467207  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4001  lipoprotein signal peptidase  49.38 
 
 
195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0911  lipoprotein signal peptidase  48.84 
 
 
204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2912  peptidase A8 signal peptidase II  53.02 
 
 
193 aa  138  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000001174  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5747  lipoprotein signal peptidase  51.1 
 
 
254 aa  137  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3189  lipoprotein signal peptidase  48.54 
 
 
197 aa  135  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5087  lipoprotein signal peptidase  52.08 
 
 
243 aa  135  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00915922  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1425  lipoprotein signal peptidase  50.81 
 
 
201 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.0381743 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  47.2 
 
 
207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2402  lipoprotein signal peptidase  39.07 
 
 
213 aa  121  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3053  peptidase A8, signal peptidase II  42.04 
 
 
198 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507002  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3249  lipoprotein signal peptidase  46.77 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.620504  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27280  lipoprotein signal peptidase  44.87 
 
 
207 aa  118  7.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.097176  normal  0.384801 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  47.1 
 
 
204 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1122  signal peptidase II  39.89 
 
 
182 aa  112  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2628  lipoprotein signal peptidase  50.6 
 
 
182 aa  111  7.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.191199  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3202  lipoprotein signal peptidase  41.13 
 
 
232 aa  108  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3428  lipoprotein signal peptidase  42.53 
 
 
220 aa  107  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.319038  decreased coverage  0.00618792 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2882  lipoprotein signal peptidase  42.78 
 
 
182 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.859985  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1419  lipoprotein signal peptidase  48.48 
 
 
165 aa  98.6  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1031  signal peptidase II  41.4 
 
 
182 aa  97.1  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0513962  normal  0.0206613 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5736  lipoprotein signal peptidase  42.59 
 
 
291 aa  95.9  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1580  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 
190 aa  95.1  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1293  lipoprotein signal peptidase  43.11 
 
 
210 aa  92.8  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248018  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22710  lipoprotein signal peptidase  44.57 
 
 
227 aa  90.5  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.52944  normal  0.101415 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0140  lipoprotein signal peptidase  42.45 
 
 
182 aa  88.2  9e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0759445  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  37.98 
 
 
149 aa  85.9  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  40.51 
 
 
178 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
178 aa  82.4  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  38.26 
 
 
169 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 
167 aa  80.5  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  41.18 
 
 
163 aa  80.9  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1604  lipoprotein signal peptidase  54.74 
 
 
219 aa  79  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  normal  0.485547 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  37.06 
 
 
145 aa  79  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  41.1 
 
 
150 aa  79  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  39.2 
 
 
163 aa  78.2  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 
153 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  41.61 
 
 
157 aa  77.4  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1579  lipoprotein signal peptidase  36.81 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0479337  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 
173 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  34.48 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  37.8 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  32.52 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4558  lipoprotein signal peptidase  38.13 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21418  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  34.75 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  32.67 
 
 
163 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 
154 aa  74.7  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0604  lipoprotein signal peptidase  37.86 
 
 
176 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975545  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  32.58 
 
 
150 aa  74.7  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  36.43 
 
 
170 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0645  lipoprotein signal peptidase  37.86 
 
 
171 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  39.47 
 
 
160 aa  74.3  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1116  signal peptidase II  33.33 
 
 
169 aa  74.3  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2288  lipoprotein signal peptidase  32.03 
 
 
191 aa  73.6  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2615  signal peptidase II  34.01 
 
 
173 aa  73.6  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0650  lipoprotein signal peptidase  38.13 
 
 
171 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  40.13 
 
 
169 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  36.5 
 
 
165 aa  73.6  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  31.58 
 
 
164 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  36.81 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  39.6 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  36.23 
 
 
181 aa  73.2  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  37.01 
 
 
149 aa  72  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0482  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
167 aa  72  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  36.73 
 
 
166 aa  72  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13510  signal peptidase II  40.91 
 
 
156 aa  71.2  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.376411  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  35 
 
 
176 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  34.69 
 
 
155 aa  70.9  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  35.33 
 
 
235 aa  71.2  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  38.93 
 
 
169 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  33.99 
 
 
173 aa  70.5  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  35.37 
 
 
174 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  35.95 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  32.89 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2067  lipoprotein signal peptidase  31.25 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  36.05 
 
 
173 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1346  lipoprotein signal peptidase  29.81 
 
 
163 aa  69.3  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  38.16 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  38.16 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  38.16 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  38.16 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  38.16 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  38.16 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  38.16 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  34.25 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  34.25 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  38.16 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  38.16 
 
 
173 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  38.16 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>