More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11498 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11498  thioredoxin trxA  100 
 
 		 124 aa  259  6.999999999999999e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000146148  normal  0.118625 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2481  thioredoxin  58.49 
 
 		 121 aa  120  8e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.555436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11499  thioredoxin trxB1  54.78 
 
 		 123 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0242294  normal  0.175347 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2444  thioredoxin  57.55 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2489  thioredoxin  57.55 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2740  thioredoxin  52.73 
 
 		 120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.529199 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  45.71 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  45.71 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  48.08 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21270  thioredoxin  47.12 
 
 		 143 aa  107  5e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.724232  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  46.15 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  44.76 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3670  thioredoxin  50.96 
 
 		 120 aa  104  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.603645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0368  thioredoxin  45 
 
 		 123 aa  103  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  43.81 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  41.86 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  42.86 
 
 		 125 aa  100  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  44.23 
 
 		 123 aa  100  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  45.54 
 
 		 121 aa  100  8e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  44.55 
 
 		 140 aa  100  9e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24970  thioredoxin  49.44 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  38.39 
 
 		 131 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0207  thioredoxin  41.9 
 
 		 120 aa  95.9  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2647  thioredoxin  44.23 
 
 		 120 aa  95.9  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  40.95 
 
 		 120 aa  95.9  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  50.56 
 
 		 122 aa  95.9  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0362  thioredoxin  39.42 
 
 		 127 aa  95.9  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.125249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  40.95 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1065  thioredoxin  41.9 
 
 		 123 aa  95.1  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  41.35 
 
 		 125 aa  94.7  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  41.9 
 
 		 126 aa  94.4  4e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01500  thioredoxin  42.31 
 
 		 153 aa  94.4  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  40.78 
 
 		 125 aa  93.6  8e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  41.35 
 
 		 123 aa  93.2  9e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  40.38 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0143  thioredoxin  48.08 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2426  thioredoxin  40.38 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.660115  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  46.07 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1297  thioredoxin  44.23 
 
 		 130 aa  91.3  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.47539 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  40 
 
 		 123 aa  90.9  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  40 
 
 		 123 aa  90.9  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  35.78 
 
 		 124 aa  90.1  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0988  thioredoxin domain-containing protein  41.18 
 
 		 124 aa  89.4  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  37.86 
 
 		 131 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  37.5 
 
 		 117 aa  88.2  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3837  thioredoxin  44.23 
 
 		 120 aa  87.8  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  35.58 
 
 		 125 aa  87.4  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  35.58 
 
 		 122 aa  87  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  36.54 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  38.46 
 
 		 123 aa  86.3  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  36.54 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  37.86 
 
 		 132 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  37.86 
 
 		 132 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  35.58 
 
 		 123 aa  84  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  35.24 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  40 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  34.55 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1828  thioredoxin-related  34.91 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00237221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3287  thioredoxin  35.96 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14050  thioredoxin  38.46 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  35.24 
 
 		 149 aa  77  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0303  thioredoxin  33.65 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1185  thioredoxin-related  37.62 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0751428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1900  thioredoxin domain-containing protein  34.29 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0850569  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4281  thioredoxin  34.02 
 
 		 104 aa  72.4  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0356  thioredoxin  34 
 
 		 113 aa  72  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  34.31 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  36.96 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1363  hypothetical protein  34.31 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  37.08 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0564  thioredoxin  37.08 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.21989e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1619  thioredoxin  37.08 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000289203  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  32.71 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1247  thioredoxin  39.78 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000845354  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  37.93 
 
 		 135 aa  67  0.00000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  35.35 
 
 		 140 aa  66.6  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  36.45 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  35.35 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  38.89 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4942  thioredoxin  34.95 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  36.45 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2304  thioredoxin  37.93 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258464  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5069  thioredoxin  34.31 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0618  thioredoxin  36.78 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2099  thioredoxin  33.33 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4481  thioredoxin  34.09 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  40.23 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1161  thioredoxin  40.23 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  32.58 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5119  thioredoxin  34.88 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  38.71 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  31.18 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  34.31 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  35.85 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  34.95 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  34.95 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  34.95 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  32.04 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  30.53 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  38.82 
 
 		 304 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>