140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11459 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11459  PE family protein  100 
 
 
528 aa  1030    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10152  PE family protein  50.62 
 
 
588 aa  318  2e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10160  PE family protein  48.51 
 
 
468 aa  297  4e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  54.58 
 
 
580 aa  282  1e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10161  PE family protein  41.49 
 
 
502 aa  270  5e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00736493  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  38.13 
 
 
655 aa  248  3e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10153  PE family protein  46.6 
 
 
533 aa  224  4e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4726  hypothetical protein  35.53 
 
 
526 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4030  PE-PPE domain protein  33.02 
 
 
540 aa  137  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1918  hypothetical protein  37.66 
 
 
533 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.777477  normal  0.457029 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1735  PE-PPE-like protein  35.12 
 
 
307 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1782  hypothetical protein  35.12 
 
 
307 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1714  hypothetical protein  35.12 
 
 
307 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4281  PE-PPE-like protein  37.07 
 
 
517 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.55456  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4367  hypothetical protein  37.07 
 
 
517 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1011  hypothetical protein  34.73 
 
 
427 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0659585 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0041  hypothetical protein  37.25 
 
 
494 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4660  hypothetical protein  36.73 
 
 
517 aa  115  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.741942  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0407  hypothetical protein  37.19 
 
 
499 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0427492  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3250  hypothetical protein  39.67 
 
 
391 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11480  PE-PGRS family protein  62.5 
 
 
737 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.94455e-50  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5039  hypothetical protein  35.77 
 
 
413 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0487726  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4951  PE-PPE-like protein  35.77 
 
 
433 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0809948  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5332  hypothetical protein  35.77 
 
 
433 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10889  PE-PGRS family protein  63.54 
 
 
609 aa  108  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.275087  normal  0.540095 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4815  hypothetical protein  32.5 
 
 
517 aa  107  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.036701  normal  0.942051 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5244  hypothetical protein  36.07 
 
 
433 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13114  hypothetical protein  47.14 
 
 
437 aa  103  6e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.773081 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12868  PE-PGRS family protein  56.25 
 
 
663 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00218222  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11478  PE-PGRS family protein  62.5 
 
 
1407 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000217058  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12513  PE-PGRS family protein  63.44 
 
 
272 aa  101  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.7912e-70  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2825  PE-PPE-like protein  36.13 
 
 
542 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0670236  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2869  hypothetical protein  36.13 
 
 
542 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.826193  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2852  hypothetical protein  36.13 
 
 
542 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.493175  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3720  hypothetical protein  37.21 
 
 
458 aa  99  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.079292 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4518  hypothetical protein  31.62 
 
 
423 aa  99  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2967  hypothetical protein  34.52 
 
 
401 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550701  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0949  PE-PPE-like protein  29.67 
 
 
529 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0967  hypothetical protein  29.67 
 
 
529 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0508627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1238  hypothetical protein  29.45 
 
 
518 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.207514 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13628  PE-PGRS family protein  65.43 
 
 
439 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000236295  normal  0.0644121 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3102  hypothetical protein  38.35 
 
 
410 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057545  normal  0.238846 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0970  hypothetical protein  30.04 
 
 
527 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5374  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
469 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3106  hypothetical protein  35.32 
 
 
411 aa  90.5  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929764  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10849  PE-PGRS family protein  64.1 
 
 
879 aa  90.5  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.4370299999999996e-27  hitchhiker  0.00000147431 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12424  PE-PGRS family protein  59.09 
 
 
382 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.712465  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11105  PE-PGRS family protein  66.67 
 
 
779 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  5.19894e-57  normal  0.745031 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11796  PE-PGRS family protein  61.05 
 
 
618 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000152846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0419  PE-PPE-like protein  39.39 
 
 
341 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0428  hypothetical protein  39.39 
 
 
341 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0973739  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11357  PE-PGRS family protein  61.73 
 
 
603 aa  87.8  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0271727  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11086  PE-PGRS family protein  53.19 
 
 
463 aa  86.7  9e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.21582e-33  normal  0.255 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10995  PE-PGRS family protein  45 
 
 
923 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  5.02084e-24  normal  0.770391 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13542  PE-PGRS family protein  62.96 
 
 
2332 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000034434  hitchhiker  0.00332748 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13422  PE-PGRS family protein  61.96 
 
 
731 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000255336  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13547  PE-PGRS family protein  62.96 
 
 
1086 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.98986e-36  hitchhiker  0.0000786536 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3374  hypothetical protein  30.3 
 
 
421 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12754  PE-PGRS family protein  63.41 
 
 
565 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000417196  normal  0.0386161 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12192  PE-PGRS family protein  61.7 
 
 
532 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.9578499999999997e-20  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13378  PE-PGRS family protein  66.27 
 
 
1570 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.793451  normal  0.887646 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12014  PE-PGRS family protein  53.47 
 
 
558 aa  84  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3371  hypothetical protein  31.72 
 
 
431 aa  83.2  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.21394  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11848  PE-PGRS family protein  64.2 
 
 
518 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.114393  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13856  hypothetical protein  34.39 
 
 
404 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12351  PE family protein  55.79 
 
 
382 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2068  hypothetical protein  38.25 
 
 
432 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183001  normal  0.202085 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13623  PE-PGRS family protein  62.5 
 
 
584 aa  80.9  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.91824e-18  normal  0.0516609 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3110  hypothetical protein  33.49 
 
 
768 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11834  PE-PGRS family protein  53.09 
 
 
650 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00239965  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13512  PE family protein  51.58 
 
 
98 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.951509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13846  PE-PGRS family protein  59.57 
 
 
504 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200621  normal  0.262827 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10588  PE-PGRS family protein  55 
 
 
1306 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00297042  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13545  PE-PGRS family protein  57.45 
 
 
1888 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000435663  hitchhiker  0.000141751 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0761  hypothetical protein  32.69 
 
 
401 aa  77.8  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11469  PE-PGRS family protein  58.62 
 
 
491 aa  77.8  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0503304  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3103  hypothetical protein  28.63 
 
 
413 aa  77  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0463748  normal  0.241935 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0401  hypothetical protein  30.82 
 
 
380 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.530994  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11112  PE-PGRS family protein  69.23 
 
 
853 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336586  normal  0.286221 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12611  PE-PGRS family protein  56.47 
 
 
543 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0987331  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1838  hypothetical protein  30.29 
 
 
435 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.896009 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3378  hypothetical protein  29.47 
 
 
783 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11868  PE-PGRS family protein  66.67 
 
 
515 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000473061  normal  0.517398 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11496  PE-PGRS family protein  62.96 
 
 
375 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000634061  normal  0.0755488 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0248  PE-PPE-like protein  29.25 
 
 
377 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0258  hypothetical protein  29.25 
 
 
377 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0307728 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10110  PE-PGRS family protein  58.95 
 
 
533 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0238  hypothetical protein  29.25 
 
 
377 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107724  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12364  PE-PGRS family protein  57.5 
 
 
413 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10996  PE-PGRS family protein  57.89 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.7191000000000003e-35  normal  0.547752 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10285  PE-PGRS family protein  67.07 
 
 
906 aa  73.6  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.9295399999999998e-51  normal  0.572415 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10998  PE-PGRS family protein  57.89 
 
 
457 aa  73.6  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104383  normal  0.995085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0276  hypothetical protein  29.93 
 
 
388 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33965  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3864  hypothetical protein  27.51 
 
 
448 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0367973  normal  0.130474 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11197  PE family protein  58.82 
 
 
308 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11269  PE-PGRS family protein  55.13 
 
 
414 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119088  hitchhiker  0.00152162 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12540  PE family protein  48.08 
 
 
492 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000611241  hitchhiker  0.0026092 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11425  PE-PGRS family protein  62.2 
 
 
576 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000100458  normal  0.0951709 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12653  PE-PGRS family protein  59.38 
 
 
788 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000028408  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13572  PPE family protein  37.24 
 
 
479 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542589 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>