186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11383 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11383  transcriptional regulator  100 
 
 		 261 aa  535  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.900966 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1989  TetR family transcriptional regulator  70.08 
 
 		 250 aa  357  9e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4355  TetR family transcriptional regulator  70.87 
 
 		 244 aa  342  4e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1770  TetR family transcriptional regulator  64.23 
 
 		 250 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1817  TetR family transcriptional regulator  64.23 
 
 		 250 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1751  TetR family transcriptional regulator  64.23 
 
 		 250 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3861  regulatory protein TetR  41.89 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.153714  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2594  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 221 aa  103  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.971437  normal  0.0759549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 236 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  26.55 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  30.81 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  30.81 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  30.81 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  25.94 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2728  putative transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  24.7 
 
 		 268 aa  67  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  26.91 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  26.07 
 
 		 343 aa  62.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  26.61 
 
 		 266 aa  62  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 218 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  26.76 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  24.89 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  25.37 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3105  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1040  regulatory protein TetR  27.92 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.591621  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  34.19 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1495  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 200 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.969103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0594  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 208 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0040  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 211 aa  57  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.970085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  26.64 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  25.7 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  25.11 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  25.55 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 255 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 		 213 aa  55.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  28.68 
 
 		 250 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  25.1 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  23.71 
 
 		 222 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 242 aa  54.3  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 242 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  26.34 
 
 		 247 aa  53.9  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 185 aa  53.1  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 229 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 285 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  26.82 
 
 		 226 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 239 aa  52.4  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  26.17 
 
 		 343 aa  52  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  24.78 
 
 		 248 aa  52  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 211 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3085  regulatory protein, TetR  30.93 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.355286  normal  0.26404 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  27.35 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  26.41 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  23.14 
 
 		 259 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2494  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000125237  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 240 aa  51.2  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3273  Tetracyclin repressor domain protein  25.6 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120229  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  28.12 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0251  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 230 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  25.12 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3985  hypothetical protein  27.57 
 
 		 228 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 239 aa  49.7  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 223 aa  49.7  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 212 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>