More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11356 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11356  thioredoxin  100 
 
 
304 aa  595  1e-169  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675127  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3848  thioredoxin domain-containing protein  69.08 
 
 
299 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00807359 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3862  thioredoxin domain-containing protein  69.08 
 
 
299 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3936  thioredoxin domain-containing protein  69.08 
 
 
299 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4303  thioredoxin domain-containing protein  64.8 
 
 
297 aa  343  2e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408854  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2342  thioredoxin domain-containing protein  62.95 
 
 
298 aa  330  1e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.299917  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  45.69 
 
 
299 aa  218  7e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6079  thioredoxin domain protein  47.58 
 
 
326 aa  215  9e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1954  Thioredoxin domain protein  41.9 
 
 
313 aa  211  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1268  Thioredoxin domain protein  42.12 
 
 
323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1333  Thioredoxin domain protein  41.83 
 
 
311 aa  176  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1925  Thioredoxin domain-containing protein  35.39 
 
 
299 aa  176  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4105  Thioredoxin domain protein  40.54 
 
 
321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1704  thioredoxin domain protein  37.18 
 
 
310 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  36.82 
 
 
297 aa  158  8e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3607  thioredoxin domain-containing protein  37.2 
 
 
300 aa  156  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3988  thioredoxin domain-containing protein  35.81 
 
 
300 aa  152  8.999999999999999e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000709703 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2594  thioredoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
339 aa  149  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.238157  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3886  Thioredoxin domain protein  36.7 
 
 
312 aa  147  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54182  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2327  thioredoxin domain protein  33.33 
 
 
334 aa  145  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128937 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1092  Thioredoxin domain protein  36 
 
 
310 aa  143  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.509026  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  34.08 
 
 
337 aa  143  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1048  thioredoxin domain-containing protein  36.95 
 
 
331 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157412  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0921  thioredoxin domain-containing protein  34.08 
 
 
301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.460441 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3683  thioredoxin-related  36.03 
 
 
329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1730  putative thioredoxin domain-containing protein  35.5 
 
 
313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1804  thioredoxin domain-containing protein  31.19 
 
 
314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0364  putative thioredoxin  32.5 
 
 
320 aa  112  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.163537  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3098  thioredoxin  41.04 
 
 
333 aa  112  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032408  hitchhiker  0.0000022841 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  26.01 
 
 
330 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09500  thioredoxin domain-containing protein  30 
 
 
346 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.460116  normal  0.88242 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10300  thioredoxin domain-containing protein  33.21 
 
 
313 aa  109  6e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  26.85 
 
 
324 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  25.68 
 
 
334 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  29.86 
 
 
293 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  30.71 
 
 
280 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  25.5 
 
 
324 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  31.38 
 
 
293 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  30.85 
 
 
289 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0139  hypothetical protein  27.9 
 
 
340 aa  102  7e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2422  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.77 
 
 
319 aa  100  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  30.04 
 
 
310 aa  99.8  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  28.38 
 
 
306 aa  99.8  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  30.28 
 
 
281 aa  99.4  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  29.05 
 
 
303 aa  99  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  30.74 
 
 
280 aa  98.6  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  29.82 
 
 
281 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  26.6 
 
 
302 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  29.86 
 
 
290 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  27.36 
 
 
302 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  29.01 
 
 
290 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  30.85 
 
 
289 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  32.84 
 
 
282 aa  94.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  27.66 
 
 
306 aa  94  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  29.35 
 
 
290 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1282  Thioredoxin domain  32.6 
 
 
319 aa  93.2  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00790933  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  27.96 
 
 
304 aa  92.8  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  29.17 
 
 
290 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  28.87 
 
 
282 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19060  thioredoxin domain-containing protein  32.46 
 
 
299 aa  90.1  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.595284  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  28.57 
 
 
311 aa  90.1  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  26.91 
 
 
306 aa  89.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  25.68 
 
 
317 aa  89.4  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  27.34 
 
 
290 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  28.33 
 
 
290 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  29.35 
 
 
290 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  26 
 
 
304 aa  87  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  25.29 
 
 
324 aa  86.7  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  27.78 
 
 
289 aa  86.7  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  24.75 
 
 
305 aa  86.7  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  25.91 
 
 
306 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1117  thioredoxin-related protein  26.95 
 
 
324 aa  86.7  5e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  25.68 
 
 
329 aa  86.3  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2392  putative thioredoxin  33.01 
 
 
309 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  27.65 
 
 
304 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  27.99 
 
 
304 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  28.81 
 
 
282 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3023  putative thioredoxin  44 
 
 
289 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  31.6 
 
 
282 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3161  thioredoxin domain-containing protein  44 
 
 
289 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.324735  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1269  putative thioredoxin  44 
 
 
289 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  26.03 
 
 
302 aa  84  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  28.52 
 
 
302 aa  83.6  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  30.39 
 
 
282 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  26.67 
 
 
274 aa  83.2  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  26.01 
 
 
306 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  27.48 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  31.14 
 
 
301 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0966  thioredoxin domain-containing protein  37.96 
 
 
284 aa  82.4  0.000000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  31.14 
 
 
282 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0886  putative thioredoxin protein  27.87 
 
 
287 aa  81.6  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  31.14 
 
 
282 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  28.77 
 
 
282 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  25.84 
 
 
320 aa  82  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  27.82 
 
 
282 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  27.82 
 
 
282 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0364  thioredoxin domain-containing protein  25 
 
 
312 aa  82  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000110184 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  39.81 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  31.14 
 
 
918 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  27.56 
 
 
290 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>