More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11319 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5548  arginyl-tRNA synthetase  58.88 
 
 
550 aa  658    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598965  normal  0.0339829 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1250  arginyl-tRNA synthetase  60.29 
 
 
554 aa  670    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0409478  normal  0.0986355 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1052  arginyl-tRNA synthetase  60.71 
 
 
560 aa  669    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3972  arginyl-tRNA synthetase  84 
 
 
550 aa  945    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2467  arginyl-tRNA synthetase  61.44 
 
 
566 aa  667    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0465289  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3653  arginyl-tRNA synthetase  63.18 
 
 
554 aa  712    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4350  arginyl-tRNA synthetase  84 
 
 
550 aa  946    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.301994 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11319  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
550 aa  1122    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6158  arginyl-tRNA synthetase  66.18 
 
 
550 aa  763    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29980  arginyl-tRNA synthetase  66.97 
 
 
551 aa  755    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.661681  normal  0.169962 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1899  arginyl-tRNA synthetase  70 
 
 
550 aa  783    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09800  arginyl-tRNA synthetase  61.9 
 
 
559 aa  682    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0453043  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3898  arginyl-tRNA synthetase  84 
 
 
550 aa  945    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0879275  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3884  arginyl-tRNA synthetase  83.82 
 
 
550 aa  942    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.103344  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4035  arginyl-tRNA synthetase  63.18 
 
 
554 aa  713    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.205832  hitchhiker  0.00704959 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2092  arginyl-tRNA synthetase  63.65 
 
 
551 aa  660    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000567814  normal  0.0511831 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1228  arginyl-tRNA synthetase  70.73 
 
 
550 aa  804    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4155  arginyl-tRNA synthetase  61.01 
 
 
553 aa  672    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.60572  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2296  arginyl-tRNA synthetase  82.91 
 
 
550 aa  947    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.847928 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1793  arginyl-tRNA synthetase  58.42 
 
 
558 aa  628  1e-179  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203439  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1742  arginyl-tRNA synthetase  55.36 
 
 
522 aa  595  1e-169  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1004  arginyl-tRNA synthetase  53.85 
 
 
570 aa  586  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0195  arginine--tRNA ligase  51.67 
 
 
598 aa  588  1e-166  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0628  arginyl-tRNA synthetase  52.81 
 
 
562 aa  586  1e-166  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0559225  decreased coverage  0.00224273 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1197  arginyl-tRNA synthetase  51.62 
 
 
556 aa  564  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1605  arginyl-tRNA synthetase  49.35 
 
 
620 aa  559  1e-158  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18400  arginyl-tRNA synthetase  50 
 
 
547 aa  545  1e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.25654  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2358  arginyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 
554 aa  536  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000260389 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2625  arginyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 
554 aa  537  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.657674  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08000  arginyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 
556 aa  515  1.0000000000000001e-145  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00405045  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 
556 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 
557 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
561 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 
553 aa  428  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 
556 aa  427  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 
556 aa  426  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 
556 aa  428  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 
556 aa  428  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 
556 aa  428  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 
556 aa  426  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 
556 aa  427  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0602  arginyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 
561 aa  427  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.154913  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 
556 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0648  arginyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 
559 aa  424  1e-117  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0541152  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 
556 aa  422  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 
556 aa  424  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 
556 aa  425  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 
553 aa  420  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01700  arginyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 
583 aa  419  1e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000411406  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 
553 aa  420  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2283  arginyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 
554 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.263992  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 
554 aa  415  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0280  arginyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 
562 aa  412  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920432  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2673  arginyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 
556 aa  415  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0820  arginyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 
561 aa  414  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0474084  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 
570 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000995895  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2181  arginyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 
563 aa  409  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.264732  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 
551 aa  411  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3089  arginyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 
586 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191401  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
586 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1812  arginyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 
568 aa  402  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246046  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0850  arginyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 
551 aa  404  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 
551 aa  403  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0050  arginyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 
564 aa  403  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1316  arginyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 
551 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1944  arginyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 
575 aa  400  9.999999999999999e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.567724  normal  0.240014 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0124  arginyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 
562 aa  395  1e-109  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2410  arginyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 
560 aa  398  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000917803  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 
559 aa  397  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0561  arginyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 
559 aa  395  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0529  arginyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 
614 aa  394  1e-108  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000661895 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 
556 aa  392  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0188  arginyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 
594 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.826253  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0109  arginyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 
562 aa  395  1e-108  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3183  arginyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 
561 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000169325  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0198  arginyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 
592 aa  390  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06570  arginyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 
575 aa  391  1e-107  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.645664 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0743  arginyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 
550 aa  389  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02918  arginyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 
562 aa  392  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2304  arginyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 
561 aa  390  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0307018  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0385  arginyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 
598 aa  392  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603012  normal  0.077689 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1935  arginyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 
564 aa  390  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000950947  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0902  arginyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 
580 aa  388  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.09451  normal  0.0464581 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0247  arginyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 
587 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0358001  normal  0.157381 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1588  arginyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 
580 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.175533 
 
 
-
 
NC_004310  BR0877  arginyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 
585 aa  387  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1607  arginyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 
551 aa  387  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113173  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2351  arginyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 
585 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0742  arginyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 
554 aa  387  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000856279  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6262  arginyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 
593 aa  388  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1434  arginyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 
569 aa  388  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0988806  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 
584 aa  386  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2456  arginyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 
598 aa  386  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0285  arginyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 
564 aa  386  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0318968  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1659  arginyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 
543 aa  387  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.826444  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0410  arginyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 
594 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0430  arginyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 
594 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1686  arginyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 
575 aa  387  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0592  arginyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 
594 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.597736  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2943  arginyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 
583 aa  385  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.201497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>