194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11277 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  47.95 
 
 
1250 aa  986    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  41.82 
 
 
1270 aa  782    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  67.92 
 
 
1143 aa  1469    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  48.74 
 
 
1228 aa  952    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  46.01 
 
 
1215 aa  872    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  40.33 
 
 
1153 aa  645    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  67.92 
 
 
1143 aa  1469    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  64.73 
 
 
1151 aa  1446    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  44.47 
 
 
1215 aa  855    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  67.92 
 
 
1143 aa  1468    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  62.63 
 
 
1163 aa  1409    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  48.12 
 
 
1324 aa  720    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  100 
 
 
1139 aa  2293    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  44.07 
 
 
1196 aa  796    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  38.65 
 
 
1247 aa  674    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  37.55 
 
 
1198 aa  546  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  37.2 
 
 
1082 aa  538  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  33.99 
 
 
1118 aa  504  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  32.39 
 
 
1116 aa  501  1e-140  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  33.25 
 
 
1126 aa  502  1e-140  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  46.2 
 
 
1350 aa  487  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  31.05 
 
 
1172 aa  460  9.999999999999999e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1529  hypothetical protein  35.38 
 
 
1175 aa  428  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0907559  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4059  hypothetical protein  42.35 
 
 
522 aa  350  1e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  39.02 
 
 
1280 aa  326  2e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  44.04 
 
 
1121 aa  241  8e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  30.59 
 
 
934 aa  124  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  28.67 
 
 
902 aa  110  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  27.95 
 
 
606 aa  110  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  30.53 
 
 
901 aa  106  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1516  AAA ATPase  27.49 
 
 
1271 aa  102  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.18518 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  28.68 
 
 
902 aa  100  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  30.81 
 
 
986 aa  99.4  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1720  hypothetical protein  29.93 
 
 
1259 aa  97.8  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  26.48 
 
 
636 aa  97.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  29.09 
 
 
752 aa  93.2  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  28.06 
 
 
632 aa  93.6  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  25.5 
 
 
1038 aa  90.9  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3349  hypothetical protein  25.39 
 
 
512 aa  90.1  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  31.23 
 
 
635 aa  90.5  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  25.83 
 
 
636 aa  85.5  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0518  RecB family-like nuclease  26.99 
 
 
390 aa  82.8  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.13317  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  27.59 
 
 
521 aa  81.3  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0336  hypothetical protein  22.84 
 
 
487 aa  80.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4865  hypothetical protein  26.67 
 
 
494 aa  79.7  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120137  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  24.49 
 
 
1090 aa  79.3  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2207  AAA ATPase  26.52 
 
 
1255 aa  79.3  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  28.46 
 
 
932 aa  78.2  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  25.39 
 
 
486 aa  78.2  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  29.06 
 
 
609 aa  77  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  23.65 
 
 
797 aa  76.3  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  31.94 
 
 
553 aa  76.3  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  31.94 
 
 
553 aa  76.3  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2870  hypothetical protein  28.09 
 
 
493 aa  75.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2280  AAA ATPase  24.25 
 
 
1403 aa  75.9  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00184905  decreased coverage  0.00000493751 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3226  nuclease (RecB family)-like protein  28.09 
 
 
493 aa  75.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.492235  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  25.97 
 
 
2245 aa  75.5  0.000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  23.64 
 
 
1408 aa  75.5  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  22.44 
 
 
611 aa  75.1  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  24.24 
 
 
585 aa  74.3  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4376  superfamily I DNA/RNA helicase  31.6 
 
 
659 aa  73.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.568868 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2051  hypothetical protein  26.8 
 
 
480 aa  73.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  24.25 
 
 
715 aa  73.2  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  26.54 
 
 
479 aa  73.9  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  23.47 
 
 
1077 aa  73.2  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2410  RecB family nuclease, putative  25.67 
 
 
486 aa  72.8  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  31.16 
 
 
464 aa  72.8  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  27.43 
 
 
619 aa  72.4  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  25.45 
 
 
1099 aa  72  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  26.64 
 
 
922 aa  71.2  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  28.36 
 
 
1189 aa  71.2  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  24.41 
 
 
952 aa  69.7  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  26.37 
 
 
1999 aa  70.1  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4249  superfamily I DNA/RNA helicase  27.06 
 
 
1185 aa  69.3  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  27.48 
 
 
629 aa  68.6  0.0000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  23.67 
 
 
1048 aa  68.6  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4194  AAA ATPase  26.32 
 
 
1126 aa  68.6  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0708139 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9531  helicase ATP-binding protein  31.86 
 
 
1137 aa  68.2  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.964957  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  25.78 
 
 
1620 aa  67.8  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  25.65 
 
 
1585 aa  66.6  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  25.65 
 
 
1585 aa  66.6  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  31.62 
 
 
622 aa  67  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  31.23 
 
 
622 aa  66.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1790  superfamily I DNA/RNA helicase  24.4 
 
 
1427 aa  66.2  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.824667  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2796  transcription factor jumonji, jmjC  56.86 
 
 
193 aa  65.9  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132584  hitchhiker  0.00000604093 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2434  hypothetical protein  28.85 
 
 
914 aa  65.5  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000217788 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  25.53 
 
 
388 aa  65.9  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  25.45 
 
 
716 aa  65.1  0.000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  27.14 
 
 
925 aa  64.3  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3926  superfamily I DNA/RNA helicase  29.13 
 
 
1190 aa  64.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.08 
 
 
1203 aa  64.3  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1133  superfamily I DNA/RNA helicase  27.21 
 
 
914 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  25.18 
 
 
1653 aa  63.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24981  RecB family nuclease  25.71 
 
 
535 aa  63.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  26.04 
 
 
795 aa  63.9  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  26.2 
 
 
754 aa  63.2  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  24.91 
 
 
650 aa  63.2  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1356  RAP domain-containing protein  23.66 
 
 
1121 aa  63.2  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  23.79 
 
 
633 aa  62.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1511  hypothetical protein  30.29 
 
 
1275 aa  61.6  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>