More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11114 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0754  Glycine hydroxymethyltransferase  75 
 
 
428 aa  644    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128225  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0694  serine hydroxymethyltransferase  75.53 
 
 
429 aa  636    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1663  Glycine hydroxymethyltransferase  79.53 
 
 
435 aa  692    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27940  serine hydroxymethyltransferase  75.3 
 
 
430 aa  644    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.958283  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11114  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 
426 aa  856    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000666035  normal  0.472146 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3130  Glycine hydroxymethyltransferase  78.12 
 
 
432 aa  661    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1189  serine hydroxymethyltransferase  74.76 
 
 
432 aa  623  1e-177  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000045975 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04680  serine hydroxymethyltransferase  72.38 
 
 
426 aa  620  1e-176  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2501  Glycine hydroxymethyltransferase  74.4 
 
 
427 aa  618  1e-176  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1115  serine hydroxymethyltransferase  74.16 
 
 
435 aa  618  1e-176  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234213  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2989  Glycine hydroxymethyltransferase  76.54 
 
 
440 aa  604  1.0000000000000001e-171  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3981  Glycine hydroxymethyltransferase  76.21 
 
 
434 aa  602  1.0000000000000001e-171  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.638114 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21370  serine hydroxymethyltransferase  72.46 
 
 
422 aa  585  1e-166  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.100651  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3847  Glycine hydroxymethyltransferase  72.95 
 
 
420 aa  584  1e-166  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2353  serine hydroxymethyltransferase  71.53 
 
 
423 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0383526  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13350  serine hydroxymethyltransferase  71.88 
 
 
423 aa  580  1e-164  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0767  serine hydroxymethyltransferase  68.99 
 
 
445 aa  575  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0535  Glycine hydroxymethyltransferase  69.21 
 
 
434 aa  574  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0424  Glycine hydroxymethyltransferase  70.33 
 
 
422 aa  569  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3186  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3596  Glycine hydroxymethyltransferase  70.73 
 
 
447 aa  566  1e-160  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3705  serine hydroxymethyltransferase  69.23 
 
 
453 aa  561  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2884  Glycine hydroxymethyltransferase  69.3 
 
 
442 aa  558  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595685  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10070  serine hydroxymethyltransferase  68.51 
 
 
425 aa  559  1e-158  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.9411  normal  0.116151 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18800  serine hydroxymethyltransferase  70.29 
 
 
412 aa  550  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4629  Glycine hydroxymethyltransferase  66.51 
 
 
430 aa  546  1e-154  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.162942 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0657  Glycine hydroxymethyltransferase  68.32 
 
 
452 aa  538  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5659  Glycine hydroxymethyltransferase  70.88 
 
 
421 aa  536  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0469  serine hydroxymethyltransferase  65.06 
 
 
474 aa  531  1e-150  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996315  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  56.07 
 
 
415 aa  475  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  56.04 
 
 
413 aa  474  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  57.45 
 
 
415 aa  474  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  55.72 
 
 
411 aa  472  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  56.8 
 
 
414 aa  474  1e-132  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  56.45 
 
 
417 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  58.39 
 
 
420 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  58.27 
 
 
431 aa  469  1.0000000000000001e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  57.28 
 
 
415 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  58.17 
 
 
416 aa  469  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03361  serine hydroxymethyltransferase  55.23 
 
 
411 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.498926  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  56.8 
 
 
415 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  54.57 
 
 
417 aa  465  9.999999999999999e-131  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  57.14 
 
 
429 aa  466  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  57.14 
 
 
412 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  57.28 
 
 
411 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  56.8 
 
 
424 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1649  serine hydroxymethyltransferase  57.69 
 
 
434 aa  462  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  56.8 
 
 
415 aa  462  1e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  55.34 
 
 
415 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  54.16 
 
 
423 aa  460  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02841  serine hydroxymethyltransferase  54.31 
 
 
416 aa  461  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  56.09 
 
 
418 aa  460  9.999999999999999e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  54.26 
 
 
412 aa  458  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  55.58 
 
 
413 aa  460  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  55.58 
 
 
415 aa  457  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  54.22 
 
 
413 aa  455  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  55.34 
 
 
415 aa  456  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02911  serine hydroxymethyltransferase  53.44 
 
 
423 aa  455  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  55.16 
 
 
413 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  54.46 
 
 
413 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6283  glycine hydroxymethyltransferase  57.07 
 
 
419 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.461604 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  54.46 
 
 
413 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  53.94 
 
 
414 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  54.18 
 
 
414 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  59.07 
 
 
415 aa  451  1.0000000000000001e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2312  serine hydroxymethyltransferase  54.13 
 
 
412 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.297378  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  53.46 
 
 
416 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  53.92 
 
 
423 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  57.07 
 
 
427 aa  452  1.0000000000000001e-126  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  54.01 
 
 
410 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  54.12 
 
 
422 aa  452  1.0000000000000001e-126  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  53.44 
 
 
423 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  53.88 
 
 
412 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  54.63 
 
 
412 aa  449  1e-125  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  53.94 
 
 
414 aa  451  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1225  serine hydroxymethyltransferase  55.56 
 
 
433 aa  451  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  54.22 
 
 
413 aa  451  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  55.56 
 
 
417 aa  448  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  54.22 
 
 
413 aa  449  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  53.53 
 
 
410 aa  450  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  54.22 
 
 
413 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  54.72 
 
 
412 aa  451  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  55.79 
 
 
434 aa  450  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  54.46 
 
 
413 aa  450  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  55.77 
 
 
417 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  52.94 
 
 
424 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  55.79 
 
 
434 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  54.48 
 
 
412 aa  448  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1438  glycine hydroxymethyltransferase  54.31 
 
 
421 aa  445  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  53.73 
 
 
413 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  54.87 
 
 
438 aa  447  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280655  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  54.5 
 
 
425 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2671  serine hydroxymethyltransferase  56.74 
 
 
433 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163758  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1579  serine hydroxymethyltransferase  54.69 
 
 
431 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  55.79 
 
 
434 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  54.48 
 
 
412 aa  448  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  54.5 
 
 
425 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  54.68 
 
 
427 aa  443  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3004  serine hydroxymethyltransferase  56.6 
 
 
432 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21133  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  56.53 
 
 
432 aa  442  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1827  serine hydroxymethyltransferase  54.59 
 
 
430 aa  443  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.752619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>