90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10895 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10895  PPE family protein  100 
 
 
448 aa  863  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0951157  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11581  PPE family protein  53.33 
 
 
760 aa  293  5e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.912214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11157  PPE family protein  57.67 
 
 
636 aa  288  2e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.38215e-17  normal  0.405765 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13566  PPE family protein  50.58 
 
 
582 aa  260  4e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.514261  hitchhiker  7.13233e-08 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13180  PPE family protein  54.48 
 
 
590 aa  258  1e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.78339e-28  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11771  PPE family protein  47.52 
 
 
975 aa  255  1e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.49393e-28  hitchhiker  1.53091e-08 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11946  PPE family protein  49.63 
 
 
1457 aa  245  1e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.515956  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10360  PPE family protein  47.81 
 
 
3295 aa  243  4e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.683224 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12382  PPE family protein  52.86 
 
 
615 aa  237  3e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.05692e-12  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10310  PPE family protein  48.39 
 
 
3166 aa  227  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.395007 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13386  PPE family protein  50.77 
 
 
3787 aa  223  5e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000441987 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12379  PPE family protein  53.9 
 
 
613 aa  221  2e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.6115e-13  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  54.15 
 
 
580 aa  215  2e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.2358e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10769  PPE family protein  45.02 
 
 
645 aa  214  3e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000490344  normal  0.972574 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13591  PPE family protein  43.03 
 
 
551 aa  202  7e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.28496e-05  normal  0.122271 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11947  PPE family protein  44.47 
 
 
1013 aa  202  1e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10447  PPE family protein  47.06 
 
 
487 aa  191  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.925376  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13376  PPE family protein  47.14 
 
 
2532 aa  183  4e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0812485  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13381  PPE family protein  49.33 
 
 
647 aa  173  5e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00213792  normal  0.0214486 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  63.48 
 
 
655 aa  172  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13165  PPE family protein  61.45 
 
 
409 aa  171  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11838  PPE family protein  57.23 
 
 
409 aa  150  5e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13145  PPE family protein  54.45 
 
 
391 aa  149  7e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.213785 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10392  PPE family protein  57.79 
 
 
443 aa  149  8e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.54935e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11832  PPE family protein  55.03 
 
 
423 aa  149  1e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.6976e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12906  PPE family protein  58.24 
 
 
408 aa  141  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00379008  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13157  PPE family protein  41.13 
 
 
380 aa  139  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12376  PPE family protein  60.23 
 
 
391 aa  137  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  5.84927e-25  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11720  PPE family protein  50.79 
 
 
385 aa  136  6e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.112292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11839  PPE family protein  53.22 
 
 
470 aa  134  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11392  PPE family protein  46.51 
 
 
396 aa  134  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11837  PPE family protein  56.07 
 
 
403 aa  134  4e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13513  PPE family protein  45.35 
 
 
392 aa  133  6e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11817  PPE family protein  52.87 
 
 
350 aa  128  2e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11820  PPE family protein  52.87 
 
 
350 aa  128  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.261988  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11220  PPE family protein  45.66 
 
 
391 aa  124  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.540836  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13565  PPE family protein  45.61 
 
 
406 aa  120  6e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  8.59509e-09 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10933  PPE family protein  56.6 
 
 
423 aa  119  1e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11833  PPE family protein  54.04 
 
 
463 aa  117  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.1557e-11  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11819  PPE family protein  58.44 
 
 
393 aa  117  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.240142  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13572  PPE family protein  60.11 
 
 
479 aa  116  7e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  5.42589e-05 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12783  PPE family protein  52.23 
 
 
382 aa  115  1e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34943 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13380  PPE family protein  49.15 
 
 
2472 aa  115  2e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.21147  normal  0.142656 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12781  PPE family protein  53.25 
 
 
394 aa  107  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000422215  normal  0.399199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11721  PPE family protein  52.66 
 
 
394 aa  106  7e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.168821 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11057  PPE family protein  55.84 
 
 
391 aa  99.8  8e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.824067 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12458  PPE family protein  34.3 
 
 
194 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.755851 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13652  PPE family protein  53.95 
 
 
413 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.134565  hitchhiker  0.000334929 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11193  PPE family protein  39.18 
 
 
346 aa  89  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10459  PPE family protein  40.49 
 
 
518 aa  84.7  3e-15  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0327  PPE protein  35.9 
 
 
445 aa  83.6  6e-15  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.821755  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13465  PPE family protein  32.58 
 
 
178 aa  81.3  3e-14  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.13323e-10  hitchhiker  0.000182876 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10259  PPE family protein  35.9 
 
 
556 aa  80.5  5e-14  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0388917 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0216  pentapeptide repeat-containing protein  38.92 
 
 
316 aa  79.7  9e-14  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0207  pentapeptide repeat-containing protein  38.92 
 
 
316 aa  79.7  9e-14  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11416  PPE family protein  37.42 
 
 
539 aa  79.7  9e-14  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.93928e-11  normal  0.128386 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10293  PPE family protein  46.15 
 
 
513 aa  78.6  2e-13  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.312861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0196  pentapeptide repeat-containing protein  42.25 
 
 
315 aa  77.8  3e-13  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13462  PPE family protein  31.87 
 
 
180 aa  77  7e-13  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.19714e-09  decreased coverage  4.0288e-05 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13908  PPE family protein  38.2 
 
 
368 aa  76.3  1e-12  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00117141  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12140  PPE family protein  41 
 
 
213 aa  73.6  6e-12  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.95332e-49  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0768  PPE protein  31.58 
 
 
436 aa  73.6  7e-12  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10097  PPE family protein  39.74 
 
 
463 aa  73.6  8e-12  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13037  PPE family protein  39.39 
 
 
435 aa  72.8  1e-11  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.52144e-113  hitchhiker  0.00208652 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0325  PPE protein  37.34 
 
 
540 aa  73.2  1e-11  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500492  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13033  PPE family protein  39.39 
 
 
434 aa  72.8  1e-11  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.2921e-59  normal  0.0390657 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0059  PPE protein  37.18 
 
 
443 aa  72  2e-11  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0146152 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0069  PPE protein  37.18 
 
 
443 aa  72.4  2e-11  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439016  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0078  PPE protein  37.18 
 
 
443 aa  72.4  2e-11  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.6171  normal  0.0155913 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13459  PPE family protein  30.34 
 
 
173 aa  71.6  3e-11  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.091e-18  hitchhiker  0.000474891 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10287  PPE family protein  39.24 
 
 
536 aa  70.5  6e-11  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.80093e-35  normal  0.372086 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0415  PPE protein  41.67 
 
 
524 aa  70.5  6e-11  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13458  hypothetical protein  30.9 
 
 
176 aa  70.1  7e-11  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.23938e-12  hitchhiker  9.23952e-05 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0077  PPE protein  34.84 
 
 
439 aa  66.2  1e-09  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.150251  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0374  PPE protein  40.38 
 
 
525 aa  65.5  2e-09  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0363  PPE protein  40.38 
 
 
525 aa  65.5  2e-09  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0384  PPE protein  40.38 
 
 
525 aa  65.5  2e-09  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3860  pentapeptide repeat containing protein  44.57 
 
 
285 aa  62.8  1e-08  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.179261  normal  0.135456 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13156  PPE family protein  47.11 
 
 
185 aa  61.6  3e-08  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1851  pentapeptide repeat-containing protein  38.64 
 
 
551 aa  60.8  4e-08  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  4.06154e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5559  PPE protein  31.65 
 
 
452 aa  57  7e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67535  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5962  PPE protein  31.65 
 
 
452 aa  57  7e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.738574  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12155  PPE family protein  38.92 
 
 
496 aa  56.2  1e-06  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.649845 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13771  PPE family protein  45.07 
 
 
77 aa  51.6  3e-05  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5774  PPE protein  36 
 
 
413 aa  50.1  7e-05  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.118496 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5459  PPE protein  35.29 
 
 
450 aa  50.1  9e-05  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.785537  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  43.56 
 
 
819 aa  49.7  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0811  pentapeptide repeat containing protein  45.68 
 
 
278 aa  49.7  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2875  pentapeptide repeat containing protein  45.68 
 
 
278 aa  49.7  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.88171  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80553  Nucleoporin NUP145 precursor (Nuclear pore protein NUP145) Contains: Nucleoporin NUP145N (N-NUP145) Nucleoporin NUP145C (C-NUP145)  31.67 
 
 
1348 aa  43.9  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>