205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10736 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10736  50S ribosomal protein L30  100 
 
 		 65 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000107725  normal  0.417501 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5029  50S ribosomal protein L30  80 
 
 		 61 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000128267  normal  0.550586 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1340  50S ribosomal protein L30  81.03 
 
 		 59 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00168719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1062  50S ribosomal protein L30  82.98 
 
 		 59 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000861748  normal  0.537655 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6596  ribosomal protein L30  63.93 
 
 		 61 aa  79.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1033  50S ribosomal protein L30  80.85 
 
 		 61 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000415927  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1050  50S ribosomal protein L30  80.85 
 
 		 61 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0317363  normal  0.122599 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3399  ribosomal protein L30  68.42 
 
 		 59 aa  78.2  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34793  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04160  LSU ribosomal protein L30P  66.67 
 
 		 60 aa  75.1  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3688  ribosomal protein L30  63.33 
 
 		 60 aa  75.1  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00000284143  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0605  ribosomal protein L30  57.89 
 
 		 60 aa  69.7  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.243208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4489  ribosomal protein L30  54.39 
 
 		 60 aa  70.1  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3125  50S ribosomal protein L30  59.65 
 
 		 62 aa  68.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0580  50S ribosomal protein L30  53.85 
 
 		 65 aa  67.8  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.868195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3905  50S ribosomal protein L30  53.33 
 
 		 60 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0899974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4297  50S ribosomal protein L30  53.33 
 
 		 60 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4303  ribosomal protein L30  59.32 
 
 		 60 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2137  50S ribosomal protein L30P  58.33 
 
 		 61 aa  66.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274633  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2958  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 68 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0270162  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  46.67 
 
 		 61 aa  65.5  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0949  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 60 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0324  50S ribosomal protein L30P  51.67 
 
 		 60 aa  64.3  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151243 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29560  LSU ribosomal protein L30P  48.33 
 
 		 60 aa  64.3  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.349049  normal  0.73381 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2670  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 68 aa  63.9  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6031  50S ribosomal protein L30  52.46 
 
 		 61 aa  64.3  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2641  ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  63.9  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0645  ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 60 aa  63.5  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_434  ribosomal protein L30/L7E  49.12 
 
 		 60 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00214762  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3887  50S ribosomal protein L30  48.33 
 
 		 60 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1833  50S ribosomal protein L30  55.77 
 
 		 63 aa  62  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20690  LSU ribosomal protein L30P  50.88 
 
 		 60 aa  62  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 61 aa  62  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0076  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.663543  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1203  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1141  ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 67 aa  61.6  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.529136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0706  ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.214746 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2628  50S ribosomal protein L30  59.65 
 
 		 61 aa  60.8  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115062  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1889  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0469  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000219229  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0600  50S ribosomal protein L30  49.18 
 
 		 61 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0492  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278097  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5142  ribosomal protein L30  54.39 
 
 		 61 aa  60.5  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.632245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3987  ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 61 aa  60.5  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0158731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0269  ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0199  50S ribosomal protein L30  56.36 
 
 		 61 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.166144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2405  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 		 61 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137776  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 59 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2278  50S ribosomal protein L30  55.77 
 
 		 61 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000000449635  hitchhiker  0.00309208 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1358  ribosomal protein L30  50 
 
 		 61 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0307  50S ribosomal protein L30  57.41 
 
 		 66 aa  59.3  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0473987  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0097  50S ribosomal protein L30  58.49 
 
 		 56 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.108985 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0612  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 61 aa  58.2  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0237089  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4008  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000205864  hitchhiker  0.0000650866 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2046  50S ribosomal protein L30  48.15 
 
 		 62 aa  57.4  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00780916  normal  0.406407 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2160  ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 63 aa  55.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0544492  normal  0.73473 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16990  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 74 aa  55.8  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000049489  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3506  ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 58 aa  55.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000460865  hitchhiker  0.000000075211 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23620  LSU ribosomal protein L30P  50.91 
 
 		 59 aa  55.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844957  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3804  ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 61 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00029637  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0439  50S ribosomal protein L30P  50 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188702  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3983  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 59 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1104  ribosomal protein L30p/L7e  56.52 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0341  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 59 aa  55.1  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00191247  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 58 aa  55.1  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000499402  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00748  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 58 aa  55.1  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  45.61 
 
 		 58 aa  55.1  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000860316  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0346  ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0149627  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0423  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 59 aa  54.7  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0858998  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0176  ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000191615  hitchhiker  0.000355415 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23290  LSU ribosomal protein L30P  50.94 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0884067  hitchhiker  0.00000565029 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4526  50S ribosomal protein L30  48.15 
 
 		 59 aa  54.7  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000879323  hitchhiker  0.000148464 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2239  50S ribosomal protein L30  54.72 
 
 		 56 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.108053  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1506  ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.41299  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03153  50S ribosomal protein L30  53.7 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00272403  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0411  ribosomal protein L30  53.7 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000158772  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3597  50S ribosomal protein L30  53.7 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0159663  normal  0.022282 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4625  50S ribosomal protein L30  53.7 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000160254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3687  50S ribosomal protein L30  53.7 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288891  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0411  50S ribosomal protein L30  53.7 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000870321  hitchhiker  0.00000243699 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0301  50S ribosomal protein L30  48.15 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000735954  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3006  50S ribosomal protein L30  43.4 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.319275  hitchhiker  0.00803225 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03104  hypothetical protein  53.7 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00160317  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3896  50S ribosomal protein L30  48.15 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000209135  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3496  50S ribosomal protein L30  53.7 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000235964  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3785  50S ribosomal protein L30  53.7 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000084288  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3726  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 59 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.990578  normal  0.0950772 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0507  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 59 aa  53.9  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0161189  hitchhiker  0.00326303 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3691  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 59 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0510411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3789  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 59 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.143721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3618  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 59 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0118319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3733  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 59 aa  53.9  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000176157  hitchhiker  0.00372314 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3618  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 59 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00151537  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0619  ribosomal protein L30  48.15 
 
 		 61 aa  53.9  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.191878  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2211  50S ribosomal protein L30  48.15 
 
 		 61 aa  53.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000289447  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 62 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0502  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000181767  normal  0.0669565 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0166  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 62 aa  53.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>