More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10735 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10735  30S ribosomal protein S5  100 
 
 		 220 aa  430  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000927793  normal  0.43056 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5030  30S ribosomal protein S5  93.18 
 
 		 222 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00000382419  normal  0.598493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1061  30S ribosomal protein S5  93.14 
 
 		 223 aa  323  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000257421  normal  0.422171 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1032  30S ribosomal protein S5  93.14 
 
 		 223 aa  323  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000681641  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1049  30S ribosomal protein S5  93.14 
 
 		 223 aa  323  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00405345  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1339  30S ribosomal protein S5  94.48 
 
 		 225 aa  308  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000696393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3689  ribosomal protein S5  91.46 
 
 		 215 aa  299  2e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000541133  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3400  ribosomal protein S5  88.76 
 
 		 215 aa  298  5e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.608039  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3888  SSU ribosomal protein S5P  79.64 
 
 		 205 aa  272  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.361  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1103  Ribosomal protein S5-like protein  84.57 
 
 		 210 aa  271  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6032  30S ribosomal protein S5  80.84 
 
 		 202 aa  272  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2629  30S ribosomal protein S5  80.47 
 
 		 200 aa  271  5.000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192925  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0599  30S ribosomal protein S5  80.84 
 
 		 202 aa  271  5.000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5141  ribosomal protein S5  79.29 
 
 		 200 aa  271  8.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2959  30S ribosomal protein S5  77.59 
 
 		 236 aa  270  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103501  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0323  SSU ribosomal protein S5P  77.33 
 
 		 199 aa  266  2e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179129 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0579  30S ribosomal protein S5  81.48 
 
 		 210 aa  265  2.9999999999999995e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.898965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2671  30S ribosomal protein S5  79.52 
 
 		 238 aa  265  4e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1202  30S ribosomal protein S5  78.44 
 
 		 208 aa  264  8e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.0445875 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4304  ribosomal protein S5  80.49 
 
 		 205 aa  263  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6597  30S ribosomal protein S5  88.02 
 
 		 201 aa  262  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4490  ribosomal protein S5  82.04 
 
 		 204 aa  256  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04150  30S ribosomal protein S5  83.83 
 
 		 209 aa  252  3e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3906  30S ribosomal protein S5  76.67 
 
 		 204 aa  246  3e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.497899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4298  30S ribosomal protein S5  76.67 
 
 		 204 aa  245  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1140  ribosomal protein S5  80.24 
 
 		 210 aa  244  6e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.5558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0705  ribosomal protein S5  78.79 
 
 		 218 aa  243  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.235874 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0604  ribosomal protein S5  78.49 
 
 		 218 aa  244  9.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.221884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0644  ribosomal protein S5  78.11 
 
 		 218 aa  242  3e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.883982  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2642  ribosomal protein S5  78.44 
 
 		 214 aa  239  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29570  SSU ribosomal protein S5P  78.79 
 
 		 223 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.219662  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23630  SSU ribosomal protein S5P  79.88 
 
 		 227 aa  237  9e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.684257  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20700  SSU ribosomal protein S5P  79.11 
 
 		 232 aa  231  7.000000000000001e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.950879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0948  ribosomal protein S5  80.38 
 
 		 212 aa  230  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.10743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3126  ribosomal protein S5  73.56 
 
 		 226 aa  229  3e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1724  30S ribosomal protein S5  68.71 
 
 		 243 aa  227  1e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00276041  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17000  SSU ribosomal protein S5P  73.81 
 
 		 249 aa  226  2e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000450138  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0268  ribosomal protein S5  68.1 
 
 		 233 aa  221  6e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  67.3 
 
 		 197 aa  199  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  60.37 
 
 		 173 aa  196  3e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  61.88 
 
 		 166 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2161  ribosomal protein S5  63.4 
 
 		 175 aa  191  7e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0929942  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0415  ribosomal protein S5  59.51 
 
 		 183 aa  190  1e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4300  30S ribosomal protein S5  58.23 
 
 		 167 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000220088  unclonable  0.0000000000604487 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  63.12 
 
 		 166 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  60.12 
 
 		 166 aa  188  5e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0230  30S ribosomal protein S5  57.41 
 
 		 168 aa  188  5e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259388  unclonable  0.00000856318 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0175  30S ribosomal protein S5  57.59 
 
 		 167 aa  187  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000490298  decreased coverage  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0859  ribosomal protein S5  61.69 
 
 		 182 aa  187  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3897  30S ribosomal protein S5  60.53 
 
 		 167 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000777438  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4527  30S ribosomal protein S5  60.53 
 
 		 167 aa  187  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000233492  hitchhiker  0.000167424 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4039  30S ribosomal protein S5  56.33 
 
 		 167 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000362616  unclonable  0.0000000000030102 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0213  30S ribosomal protein S5  56.33 
 
 		 167 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000121956  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4153  30S ribosomal protein S5  56.33 
 
 		 167 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000035229  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0217  30S ribosomal protein S5  56.33 
 
 		 167 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000106861  hitchhiker  0.000109901 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0600  30S ribosomal protein S5  60.53 
 
 		 167 aa  187  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155795  normal  0.912114 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4673  30S ribosomal protein S5  56.79 
 
 		 168 aa  187  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000106514  unclonable  0.00000000908127 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0300  30S ribosomal protein S5  60.53 
 
 		 167 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000391785  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00955  30S ribosomal protein S5  56.17 
 
 		 166 aa  186  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.136647  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0248  30S ribosomal protein S5  56.96 
 
 		 167 aa  186  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0216  30S ribosomal protein S5  56.96 
 
 		 167 aa  186  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000901319  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0211  30S ribosomal protein S5  56.96 
 
 		 167 aa  186  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010203  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0216  30S ribosomal protein S5  56.96 
 
 		 167 aa  186  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000281151  hitchhiker  0.00000000127878 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  61.59 
 
 		 168 aa  187  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3742  30S ribosomal protein S5  56.33 
 
 		 167 aa  186  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000003426  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0201  30S ribosomal protein S5  56.79 
 
 		 168 aa  186  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000549797  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0187  30S ribosomal protein S5  56.33 
 
 		 167 aa  186  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000820766  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0165  30S ribosomal protein S5  56.33 
 
 		 167 aa  186  4e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000786846  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0340  30S ribosomal protein S5  59.87 
 
 		 166 aa  184  8e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000106255  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  62.03 
 
 		 166 aa  184  9e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1006  30S ribosomal protein S5  56.33 
 
 		 167 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00241211  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  62.5 
 
 		 166 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3805  30S ribosomal protein S5  59.21 
 
 		 166 aa  182  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000511085  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  59.38 
 
 		 164 aa  182  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001725  SSU ribosomal protein S5p (S2e)  54.55 
 
 		 167 aa  182  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000199413  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3984  30S ribosomal protein S5  59.21 
 
 		 166 aa  182  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183647  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0410  ribosomal protein S5  59.21 
 
 		 167 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117054  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3619  30S ribosomal protein S5  59.21 
 
 		 167 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00166416  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4626  30S ribosomal protein S5  59.21 
 
 		 167 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000983466  normal  0.887849 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3497  30S ribosomal protein S5  59.21 
 
 		 167 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000313723  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3786  30S ribosomal protein S5  59.21 
 
 		 167 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000185577  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3619  30S ribosomal protein S5  59.21 
 
 		 167 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0273199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0410  30S ribosomal protein S5  59.21 
 
 		 167 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000646681  hitchhiker  0.00000284656 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3727  30S ribosomal protein S5  59.21 
 
 		 167 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0653825 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0422  30S ribosomal protein S5  59.21 
 
 		 166 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0728588  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3692  30S ribosomal protein S5  59.21 
 
 		 167 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0779682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3688  30S ribosomal protein S5  59.21 
 
 		 167 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000204497  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3790  30S ribosomal protein S5  59.21 
 
 		 167 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3598  30S ribosomal protein S5  59.21 
 
 		 167 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00671988  normal  0.0253177 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3734  30S ribosomal protein S5  59.21 
 
 		 166 aa  181  6e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000123332  decreased coverage  0.00107093 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00747  30S ribosomal protein S5  54.55 
 
 		 167 aa  181  6e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2157  30S ribosomal protein S5  55.15 
 
 		 167 aa  181  6e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000232198  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  61.94 
 
 		 167 aa  181  8.000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  58.64 
 
 		 173 aa  181  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  64.24 
 
 		 162 aa  181  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03154  30S ribosomal protein S5  58.55 
 
 		 167 aa  179  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387677  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  57.06 
 
 		 168 aa  179  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03105  hypothetical protein  58.55 
 
 		 167 aa  179  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00221736  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  60 
 
 		 166 aa  179  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4259  ribosomal protein S5  54.37 
 
 		 166 aa  178  5.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000144419  unclonable  0.00000000000259852 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>