More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10715 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 217 aa  437  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  91.24 
 
 		 218 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  88.02 
 
 		 217 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  88.02 
 
 		 217 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  88.02 
 
 		 217 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  88.53 
 
 		 218 aa  391  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  75 
 
 		 219 aa  335  3.9999999999999995e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  73.83 
 
 		 218 aa  323  2e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  74.06 
 
 		 213 aa  315  3e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  71.7 
 
 		 216 aa  300  9e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  68.2 
 
 		 218 aa  300  1e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  69.67 
 
 		 216 aa  299  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1123  ribosomal protein L3  70.05 
 
 		 220 aa  296  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4507  50S ribosomal protein L3  70.75 
 
 		 221 aa  296  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  68.54 
 
 		 216 aa  290  1e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0582  50S ribosomal protein L3  66.82 
 
 		 235 aa  290  1e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  66.98 
 
 		 217 aa  290  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6049  50S ribosomal protein L3  67.15 
 
 		 236 aa  288  6e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185718  normal  0.220559 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29740  LSU ribosomal protein L3P  68.27 
 
 		 219 aa  287  7e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  68.1 
 
 		 216 aa  286  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  67.46 
 
 		 219 aa  286  2e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  65.57 
 
 		 215 aa  284  5.999999999999999e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  68.57 
 
 		 222 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  64.29 
 
 		 216 aa  281  8.000000000000001e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2687  50S ribosomal protein L3  64.29 
 
 		 216 aa  278  3e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.740328 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  65.24 
 
 		 223 aa  276  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  62.86 
 
 		 216 aa  275  5e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3143  ribosomal protein L3  65.38 
 
 		 220 aa  274  7e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0896196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  64.59 
 
 		 226 aa  273  1.0000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2659  50S ribosomal protein L3  64.9 
 
 		 219 aa  272  2.0000000000000002e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  63.81 
 
 		 219 aa  271  6e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0688  ribosomal protein L3  65.71 
 
 		 219 aa  271  6e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1185  50S ribosomal protein L3  68.08 
 
 		 220 aa  270  9e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0627  ribosomal protein L3  63.94 
 
 		 217 aa  267  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4315  50S ribosomal protein L3  65.22 
 
 		 219 aa  266  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3923  50S ribosomal protein L3  65.22 
 
 		 219 aa  264  8e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0255  50S ribosomal protein L3  59.72 
 
 		 216 aa  256  2e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1707  50S ribosomal protein L3  57.82 
 
 		 213 aa  251  4.0000000000000004e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00287886  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0458  50S ribosomal protein L3P  57 
 
 		 218 aa  228  5e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.310193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  55.87 
 
 		 212 aa  228  7e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  53.88 
 
 		 206 aa  227  1e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  55.24 
 
 		 209 aa  227  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  53.14 
 
 		 209 aa  226  2e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  53.33 
 
 		 210 aa  226  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0398  ribosomal protein L3  52.11 
 
 		 213 aa  224  8e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  54.55 
 
 		 210 aa  223  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0847  50S ribosomal protein L3P  53.05 
 
 		 214 aa  223  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000479377  decreased coverage  0.0000116579 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  54.46 
 
 		 209 aa  218  3.9999999999999997e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  55.83 
 
 		 206 aa  218  3.9999999999999997e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  54.76 
 
 		 209 aa  217  8.999999999999998e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  53.3 
 
 		 205 aa  217  8.999999999999998e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000660439  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  54.29 
 
 		 209 aa  215  2.9999999999999998e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  51.43 
 
 		 211 aa  215  5e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000374639  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  55.24 
 
 		 212 aa  214  5.9999999999999996e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0323  ribosomal protein L3  53.11 
 
 		 209 aa  214  9e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000222247  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0295  ribosomal protein L3  52.15 
 
 		 212 aa  213  9.999999999999999e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000479422  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  54.07 
 
 		 214 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  52.15 
 
 		 209 aa  212  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000145621  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0962  ribosomal protein L3  54.37 
 
 		 206 aa  212  3.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000608869  hitchhiker  0.0000000000269964 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  52.86 
 
 		 211 aa  211  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 211 aa  211  4.9999999999999996e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  52.15 
 
 		 209 aa  211  9e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3909  50S ribosomal protein L3  52.63 
 
 		 209 aa  211  9e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.031884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0405  ribosomal protein L3  52.15 
 
 		 209 aa  210  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0421  50S ribosomal protein L3P  52.63 
 
 		 212 aa  210  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00399818  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  52.15 
 
 		 209 aa  210  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 212 aa  210  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477342  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  48.13 
 
 		 211 aa  210  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  50.47 
 
 		 211 aa  209  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0715  ribosomal protein L3  53.37 
 
 		 204 aa  209  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1938  50S ribosomal protein L3  49.51 
 
 		 205 aa  209  3e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4548  50S ribosomal protein L3  52.15 
 
 		 211 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00256892  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  48.34 
 
 		 207 aa  208  5e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000858376  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0626  ribosomal protein L3  52.15 
 
 		 211 aa  208  6e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00000165351  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3915  50S ribosomal protein L3  52.15 
 
 		 209 aa  207  7e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.44377e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0283  50S ribosomal protein L3  52.15 
 
 		 209 aa  207  7e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000156273  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0584  50S ribosomal protein L3  52.15 
 
 		 209 aa  207  7e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000183333  normal  0.0735815 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0454  50S ribosomal protein L3  52.15 
 
 		 211 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00952841  unclonable  0.000000209689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0487  50S ribosomal protein L3  52.15 
 
 		 211 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000838631  normal  0.0709669 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 210 aa  207  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0484  50S ribosomal protein L3  52.15 
 
 		 211 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000200613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  51.9 
 
 		 209 aa  207  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4749  50S ribosomal protein L3  51.67 
 
 		 211 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000212363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00445  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 212 aa  207  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000559916  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 210 aa  206  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  52.58 
 
 		 213 aa  206  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1854  50S ribosomal protein L3  50.23 
 
 		 217 aa  206  2e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000292484  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  52.38 
 
 		 210 aa  206  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0405  50S ribosomal protein L3P  52.13 
 
 		 214 aa  205  3e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  unclonable  0.0000000000324929  normal  0.15101 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5079  50S ribosomal protein L3  52.15 
 
 		 211 aa  205  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374535  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0469  50S ribosomal protein L3  50.72 
 
 		 212 aa  206  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000509154  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0320  50S ribosomal protein L3  50.72 
 
 		 209 aa  206  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0285067  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3822  50S ribosomal protein L3  51.2 
 
 		 209 aa  205  5e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000994751  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  53.52 
 
 		 207 aa  205  5e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4001  50S ribosomal protein L3  50.72 
 
 		 209 aa  204  6e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000133554  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0337  50S ribosomal protein L3  50.23 
 
 		 217 aa  204  7e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000773756  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  51.92 
 
 		 207 aa  204  8e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  51.92 
 
 		 207 aa  204  8e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3514  50S ribosomal protein L3  50.72 
 
 		 209 aa  204  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000214725  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3803  50S ribosomal protein L3  50.72 
 
 		 209 aa  204  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000338592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>