18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10683 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10683  hydrolase  100 
 
 
637 aa  1297    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000458391  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0673  Neutral/alkaline nonlysosomal ceramidase  49.7 
 
 
643 aa  553  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2003  Ceramidase  41.81 
 
 
682 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.921318  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53340  hypothetical protein  40.99 
 
 
670 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.19927 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4675  hypothetical protein  40.55 
 
 
670 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2570  Ceramidase  40.64 
 
 
610 aa  369  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.544363  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2292  neutral/alkaline nonlysosomal ceramidase  33.78 
 
 
743 aa  325  1e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00401419 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20082  predicted protein  31.05 
 
 
716 aa  287  4e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04245  neutral/alkaline nonlysosomal ceramidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06470)  29.62 
 
 
723 aa  251  3e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.162608  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2360  hypothetical protein  28.4 
 
 
677 aa  123  8e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0223287  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4362  hypothetical protein  31.68 
 
 
452 aa  70.5  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4339  hypothetical protein  31.19 
 
 
452 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4355  hypothetical protein  29.33 
 
 
402 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.517333 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4207  hypothetical protein  30.74 
 
 
410 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3853  hypothetical protein  24.5 
 
 
459 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.676835 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1053  hypothetical protein  33.33 
 
 
427 aa  45.4  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0062163  hitchhiker  0.0000000635319 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0295  hypothetical protein  21.46 
 
 
410 aa  44.7  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1384  hypothetical protein  25.24 
 
 
398 aa  44.3  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>