61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10638 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10638  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  256  7e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000594146  normal  0.603416 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4819  PilT protein domain protein  49.14 
 
 
127 aa  87.8  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10607  hypothetical protein  40.77 
 
 
130 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.353151 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3106  PilT domain-containing protein  45.08 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194845  normal  0.285105 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0552  PilT domain-containing protein  40.16 
 
 
127 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4109  PilT protein-like  40.16 
 
 
127 aa  67  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3714  PilT protein domain protein  42.28 
 
 
139 aa  61.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2016  hypothetical protein  46 
 
 
112 aa  60.5  0.000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10678  hypothetical protein  39.22 
 
 
112 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0141  PilT protein-like  33.81 
 
 
157 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1337  PilT protein domain protein  29.51 
 
 
129 aa  53.9  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.1325  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1067  PilT protein domain protein  33.33 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6878  PilT domain-containing protein  39.74 
 
 
136 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.425666  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0305  PilT protein domain protein  24.39 
 
 
128 aa  50.8  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0032427  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0038  PilT domain-containing protein  27.69 
 
 
146 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1138  PilT domain-containing protein  35.16 
 
 
133 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6255  PilT domain-containing protein  38.46 
 
 
135 aa  50.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0358672  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  30.34 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3326  PilT domain-containing protein  35.07 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2777  PilT protein domain protein  30.43 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0444  PilT domain-containing protein  39.84 
 
 
133 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1904  PilT protein domain protein  30.4 
 
 
129 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2951  PilT domain-containing protein  30.65 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1325  nucleic acid binding protein  31.3 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000354508  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0657  PilT protein domain protein  32.26 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0983  PilT domain-containing protein  32 
 
 
133 aa  47.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2302  plasmid stabilization protein  38.1 
 
 
142 aa  47.4  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.171886  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0058  PilT protein domain protein  36.36 
 
 
118 aa  47  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0223117  normal  0.362621 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0012  PilT protein domain-containing protein  30 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.948131 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1765  PilT protein domain protein  33.58 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0806025  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5055  PilT domain-containing protein  29.92 
 
 
133 aa  46.2  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1533  PilT protein domain protein  30.97 
 
 
132 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0497484  hitchhiker  0.000597174 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03915  predicted nucleic acid-binding protein,contains PIN domain  28.74 
 
 
101 aa  45.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.968864  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4147  PilT domain-containing protein  29.31 
 
 
134 aa  45.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448502  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10629  galactose-1-phosphate uridylyltransferase galTa  64.1 
 
 
231 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000850534  normal  0.554989 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1319  PilT protein domain protein  35.79 
 
 
140 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3558  PilT domain-containing protein  32.38 
 
 
128 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8106  PilT protein domain protein  32.26 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4764  PilT domain-containing protein  39.39 
 
 
138 aa  44.3  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.310304 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5572  PilT domain-containing protein  33.59 
 
 
126 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0396621  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3939  PilT protein domain protein  28.8 
 
 
133 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1780  plasmid stability protein, putative  38.1 
 
 
139 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1456  PilT protein domain protein  38.1 
 
 
139 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.208651  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4050  PilT protein domain protein  28.07 
 
 
131 aa  43.9  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0638  PilT protein domain protein  28 
 
 
136 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0478  virulence-associated protein, putative  28 
 
 
134 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2472  virulence associated protein C  30.23 
 
 
133 aa  43.5  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2655  PIN domain protein  37.33 
 
 
128 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2281  PilT protein domain protein  37.33 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.913458  hitchhiker  0.0000308693 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0701  PilT protein domain protein  28.7 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.528227 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0442  nitrogen regulatory protein NtrR  32.04 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315733  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3585  PilT protein domain protein  31.75 
 
 
129 aa  41.6  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1812  PilT domain-containing protein  22.77 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.034692  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0152  PilT protein domain protein  31.2 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1848  PilT protein domain protein  28.45 
 
 
129 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4425  PilT domain-containing protein  33.6 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1868  PilT domain-containing protein  29.07 
 
 
133 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000212984  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1045  virulence-associated protein, putative  31.45 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.491192  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3988  PilT protein domain protein  27.78 
 
 
133 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1669  PilT protein domain protein  37.1 
 
 
138 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.47893  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4014  PilT protein domain protein  30.85 
 
 
137 aa  40  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00102621  hitchhiker  0.000259631 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>