87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10588 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10588  PE-PGRS family protein  100 
 
 		 1306 aa  2093    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00297042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12868  PE-PGRS family protein  56.8 
 
 		 663 aa  144  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00218222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11480  PE-PGRS family protein  61.48 
 
 		 737 aa  143  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.94455e-50  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13628  PE-PGRS family protein  69.92 
 
 		 439 aa  137  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000236295  normal  0.0644121 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11478  PE-PGRS family protein  59.02 
 
 		 1407 aa  128  8.000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000217058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13422  PE-PGRS family protein  59.35 
 
 		 731 aa  125  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000255336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11086  PE-PGRS family protein  56.91 
 
 		 463 aa  123  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.21582e-33  normal  0.255 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10889  PE-PGRS family protein  59.06 
 
 		 609 aa  122  7e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.275087  normal  0.540095 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12513  PE-PGRS family protein  59.02 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.7912e-70  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13545  PE-PGRS family protein  59.35 
 
 		 1888 aa  120  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000435663  hitchhiker  0.000141751 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12611  PE-PGRS family protein  56.86 
 
 		 543 aa  117  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0987331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10995  PE-PGRS family protein  48.84 
 
 		 923 aa  114  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  5.02084e-24  normal  0.770391 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12192  PE-PGRS family protein  65.29 
 
 		 532 aa  111  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.9578499999999997e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11796  PE-PGRS family protein  54.14 
 
 		 618 aa  108  9e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000152846 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10110  PE-PGRS family protein  54.01 
 
 		 533 aa  107  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11469  PE-PGRS family protein  54.14 
 
 		 491 aa  105  6e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0503304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13378  PE-PGRS family protein  52.24 
 
 		 1570 aa  103  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.793451  normal  0.887646 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13403  PE-PGRS family protein  56.44 
 
 		 591 aa  102  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000216419  normal  0.654566 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10125  PE-PGRS family protein  63.64 
 
 		 561 aa  102  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000011228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12014  PE-PGRS family protein  54.89 
 
 		 558 aa  102  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11425  PE-PGRS family protein  63.64 
 
 		 576 aa  101  9e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000100458  normal  0.0951709 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12424  PE-PGRS family protein  55.81 
 
 		 382 aa  100  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.712465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12653  PE-PGRS family protein  61.24 
 
 		 788 aa  99.8  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000028408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12509  PE-PGRS family protein  67.14 
 
 		 431 aa  97.8  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.90533e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11085  PE-PGRS family protein  61.79 
 
 		 667 aa  97.4  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.21525e-28  normal  0.25323 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10996  PE-PGRS family protein  56 
 
 		 313 aa  95.5  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.7191000000000003e-35  normal  0.547752 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10998  PE-PGRS family protein  57.72 
 
 		 457 aa  95.1  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104383  normal  0.995085 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12754  PE-PGRS family protein  52.38 
 
 		 565 aa  94  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000417196  normal  0.0386161 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13623  PE-PGRS family protein  59.06 
 
 		 584 aa  91.7  9e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.91824e-18  normal  0.0516609 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11105  PE-PGRS family protein  53.38 
 
 		 779 aa  91.3  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  5.19894e-57  normal  0.745031 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11834  PE-PGRS family protein  46.15 
 
 		 650 aa  90.9  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00239965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13542  PE-PGRS family protein  55.28 
 
 		 2332 aa  88.6  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000034434  hitchhiker  0.00332748 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12540  PE family protein  49.01 
 
 		 492 aa  87.4  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000611241  hitchhiker  0.0026092 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13547  PE-PGRS family protein  55.28 
 
 		 1086 aa  87.4  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.98986e-36  hitchhiker  0.0000786536 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11357  PE-PGRS family protein  50 
 
 		 603 aa  86.7  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0271727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13114  hypothetical protein  54.26 
 
 		 437 aa  84.7  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.773081 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11496  PE-PGRS family protein  56.8 
 
 		 375 aa  84  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000634061  normal  0.0755488 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10849  PE-PGRS family protein  52.31 
 
 		 879 aa  82.8  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.4370299999999996e-27  hitchhiker  0.00000147431 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10304  PE-PGRS family protein  62.1 
 
 		 622 aa  81.3  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0360601  normal  0.165119 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11669  PE-PGRS family protein  50.81 
 
 		 549 aa  78.2  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.43838e-17  normal  0.300456 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11848  PE-PGRS family protein  56.39 
 
 		 518 aa  77  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.114393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12634  PE-PGRS family protein  42.26 
 
 		 461 aa  75.5  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000268791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13512  PE family protein  52.63 
 
 		 98 aa  74.3  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.951509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10284  PE-PGRS family protein  56.99 
 
 		 372 aa  73.2  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.00543e-83  normal  0.307797 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12364  PE-PGRS family protein  58.02 
 
 		 413 aa  73.2  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11112  PE-PGRS family protein  49.63 
 
 		 853 aa  72.8  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336586  normal  0.286221 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  39.87 
 
 		 1580 aa  72  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  38.69 
 
 		 1055 aa  71.6  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  34.76 
 
 		 842 aa  71.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  39.41 
 
 		 1168 aa  71.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  38.65 
 
 		 1219 aa  70.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  37.89 
 
 		 815 aa  69.3  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11197  PE family protein  53.23 
 
 		 308 aa  69.7  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11269  PE-PGRS family protein  46.67 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119088  hitchhiker  0.00152162 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  35.91 
 
 		 936 aa  65.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11459  PE family protein  57.45 
 
 		 528 aa  65.1  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11868  PE-PGRS family protein  56.19 
 
 		 515 aa  64.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000473061  normal  0.517398 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12351  PE family protein  39.17 
 
 		 382 aa  63.2  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10756  PE-PGRS family protein  60.26 
 
 		 172 aa  62.4  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.95619e-19  normal  0.324596 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10760  PE-PGRS family protein  52.11 
 
 		 783 aa  62.4  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.45953e-26  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10847  PE-PGRS family protein  49.22 
 
 		 137 aa  61.6  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.4239e-69  hitchhiker  0.000000132499 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1748  hypothetical protein  34.81 
 
 		 1408 aa  59.7  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11663  PE family protein  43.28 
 
 		 310 aa  59.3  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11821  PE family protein  61.22 
 
 		 105 aa  58.9  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.784266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10543  PE-PGRS family protein  59.48 
 
 		 622 aa  58.9  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.9713400000000003e-40  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  39.49 
 
 		 748 aa  58.9  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10152  PE family protein  47.73 
 
 		 588 aa  58.5  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11238  PE family protein  53.25 
 
 		 110 aa  58.5  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000499938  normal  0.0437659 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13846  PE-PGRS family protein  45.1 
 
 		 504 aa  58.2  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200621  normal  0.262827 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12436  PE family protein  48.15 
 
 		 334 aa  57.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11783  PE-PGRS family protein  59.06 
 
 		 911 aa  55.5  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.68379e-22  hitchhiker  0.0000000263323 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10285  PE-PGRS family protein  51.76 
 
 		 906 aa  55.5  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.9295399999999998e-51  normal  0.572415 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13541  PE-PGRS family protein  50.4 
 
 		 1403 aa  55.1  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.3382500000000002e-18  hitchhiker  0.000118269 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11818  PE family protein  57.14 
 
 		 99 aa  54.7  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.850225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10286  PE-PGRS family protein  43.16 
 
 		 837 aa  54.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.18338e-28  normal  0.53963 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10161  PE family protein  40.66 
 
 		 502 aa  53.5  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00736493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  41.46 
 
 		 459 aa  53.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12133  PE-PGRS family protein  72.09 
 
 		 389 aa  52.8  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000978875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12782  PE family protein  52.38 
 
 		 275 aa  52  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.45258  normal  0.270609 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  37.92 
 
 		 1451 aa  51.2  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  36.13 
 
 		 1297 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  36.89 
 
 		 1147 aa  48.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10160  PE family protein  53.25 
 
 		 468 aa  47.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  34.11 
 
 		 1170 aa  47.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  39.26 
 
 		 462 aa  47.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  38.94 
 
 		 512 aa  46.6  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10934  PE family protein  46.15 
 
 		 99 aa  46.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>