More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10562 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  100 
 
 		 537 aa  1081    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  74.72 
 
 		 536 aa  822    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  74.72 
 
 		 536 aa  822    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  74.72 
 
 		 536 aa  822    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  39.48 
 
 		 584 aa  342  1e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3404  Amidohydrolase 3  40.93 
 
 		 586 aa  325  2e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000897209  hitchhiker  0.00001315 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2885  amidohydrolase 3  40.04 
 
 		 569 aa  314  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00571861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3625  amidohydrolase 3  39.1 
 
 		 556 aa  307  3e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433177  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  34.39 
 
 		 575 aa  303  4.0000000000000003e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  35.6 
 
 		 583 aa  302  9e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  34.2 
 
 		 575 aa  302  1e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  32.3 
 
 		 604 aa  266  5e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  33.27 
 
 		 601 aa  266  5e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1040  amidohydrolase 3  35.52 
 
 		 590 aa  252  1e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.80433  normal  0.260287 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  33.82 
 
 		 601 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1124  amidohydrolase 3  31.19 
 
 		 625 aa  232  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  29.64 
 
 		 581 aa  230  4e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1885  Amidohydrolase 3  30.05 
 
 		 587 aa  218  2e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.5166  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3462  amidohydrolase 3  32.24 
 
 		 650 aa  212  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  29.96 
 
 		 581 aa  211  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1541  putative amidohydrolase 3  32.66 
 
 		 648 aa  211  4e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.260198  normal  0.229672 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  33.99 
 
 		 538 aa  209  7e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4766  amidohydrolase 3  33.52 
 
 		 545 aa  208  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  32.38 
 
 		 556 aa  206  8e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  32.73 
 
 		 553 aa  204  5e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  29.6 
 
 		 564 aa  202  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  27.06 
 
 		 539 aa  200  6e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0108  Amidohydrolase 3  31.82 
 
 		 547 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134206  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4359  Amidohydrolase 3  29.73 
 
 		 552 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.747715 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  33.04 
 
 		 620 aa  197  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2075  putative lipoprotein  26.97 
 
 		 585 aa  196  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860152  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0760  amidohydrolase 3  29.11 
 
 		 592 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0134  amidohydrolase-like  32.5 
 
 		 547 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.900918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1985  amidohydrolase 3  31.82 
 
 		 554 aa  195  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2000  twin-arginine translocation pathway signal  28.42 
 
 		 638 aa  194  5e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  30.8 
 
 		 542 aa  193  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  31.88 
 
 		 537 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6052  amidohydrolase 3  30.98 
 
 		 555 aa  189  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.863749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7627  amidohydrolase-like  30.74 
 
 		 555 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.137819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  30.05 
 
 		 569 aa  188  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  28.86 
 
 		 603 aa  187  4e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5666  amidohydrolase 3  31.53 
 
 		 554 aa  186  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498872  normal  0.0259745 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5757  amidohydrolase:amidohydrolase-like  31.09 
 
 		 547 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  30.91 
 
 		 539 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  29.72 
 
 		 606 aa  183  8.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3250  amidohydrolase 3  29.59 
 
 		 542 aa  183  9.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383305  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  33.21 
 
 		 537 aa  182  9.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  28.23 
 
 		 556 aa  182  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  29.62 
 
 		 541 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0099  hypothetical protein  27.04 
 
 		 577 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.119429  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4295  amidohydrolase 3  29.42 
 
 		 557 aa  180  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  27.61 
 
 		 563 aa  179  8e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  31.03 
 
 		 583 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  31.03 
 
 		 583 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  29.45 
 
 		 564 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  29.62 
 
 		 543 aa  178  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  30.59 
 
 		 543 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4287  amidohydrolase 3  29.95 
 
 		 544 aa  176  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.275898  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3889  Amidohydrolase 3  27.31 
 
 		 624 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  25.74 
 
 		 574 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  29.13 
 
 		 589 aa  172  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  29.85 
 
 		 544 aa  169  1e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  28.26 
 
 		 527 aa  168  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  32.62 
 
 		 548 aa  169  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  27.44 
 
 		 533 aa  168  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  27.85 
 
 		 543 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  26.29 
 
 		 520 aa  166  8e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  29.78 
 
 		 546 aa  166  9e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  28.73 
 
 		 532 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  30.14 
 
 		 549 aa  164  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  28.57 
 
 		 543 aa  164  4.0000000000000004e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  28.09 
 
 		 616 aa  163  8.000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  29.51 
 
 		 565 aa  163  9e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2836  amidohydrolase 3  24.73 
 
 		 597 aa  162  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214714 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  28.3 
 
 		 560 aa  161  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2078  hypothetical protein  24.14 
 
 		 576 aa  160  5e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4231  Amidohydrolase 3  27.84 
 
 		 626 aa  160  8e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  28.98 
 
 		 569 aa  158  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0654  Amidohydrolase 3  29.89 
 
 		 540 aa  158  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.214598 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  29.13 
 
 		 545 aa  158  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  28.14 
 
 		 569 aa  156  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  28.3 
 
 		 582 aa  155  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  28.81 
 
 		 564 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  28.15 
 
 		 583 aa  153  8e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  29.37 
 
 		 556 aa  153  8.999999999999999e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  30.3 
 
 		 550 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  31.1 
 
 		 543 aa  152  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  30.54 
 
 		 548 aa  152  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  27.29 
 
 		 543 aa  151  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1737  Amidohydrolase 3  27.87 
 
 		 618 aa  150  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.493619  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  27.31 
 
 		 541 aa  150  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  30.3 
 
 		 550 aa  149  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  29.89 
 
 		 522 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  27.98 
 
 		 549 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  29.34 
 
 		 576 aa  148  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  29.34 
 
 		 545 aa  147  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  26.53 
 
 		 608 aa  145  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  28.44 
 
 		 530 aa  144  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  28.32 
 
 		 601 aa  144  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0578  amidohydrolase 3  25.22 
 
 		 545 aa  143  8e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>