More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10558 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10558  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 294 aa  589  1e-167  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0196339 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0726  short chain dehydrogenase  67.7 
 
 		 291 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.352329 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0026  short chain dehydrogenase  67.93 
 
 		 319 aa  397  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122051  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0732  short chain dehydrogenase  67.7 
 
 		 291 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.403449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0746  short chain dehydrogenase  67.7 
 
 		 291 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.095749 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0944  short chain dehydrogenase  67.59 
 
 		 294 aa  397  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0860  short chain dehydrogenase  62.46 
 
 		 291 aa  359  4e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0854  short chain dehydrogenase  62.46 
 
 		 291 aa  358  7e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0871  short chain dehydrogenase  62.46 
 
 		 291 aa  358  7e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3466  short chain dehydrogenase  63.08 
 
 		 294 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.241299 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  45.66 
 
 		 661 aa  226  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4023  short chain dehydrogenase  43.8 
 
 		 671 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.367232  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.03 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0182353  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0491  short chain dehydrogenase  43.28 
 
 		 668 aa  207  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0442129 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3526  short chain dehydrogenase  43.8 
 
 		 665 aa  205  9e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309759  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3494  short chain dehydrogenase  43.58 
 
 		 664 aa  202  5e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.447449 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.26 
 
 		 275 aa  198  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2917  short chain dehydrogenase  46.67 
 
 		 665 aa  195  6e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0126943  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.02 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.366872  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4550  Male sterility domain protein  42.57 
 
 		 659 aa  190  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.2 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.623354  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1299  fatty acyl-CoA reductase protein  41.63 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11576  fatty acyl-CoA reductase  45.77 
 
 		 341 aa  181  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0002  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 273 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.690765 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3608  Male sterility domain protein  46.73 
 
 		 637 aa  165  8e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.619777  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13425  short chain dehydrogenase  35.6 
 
 		 650 aa  165  9e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1527  short chain dehydrogenase  39.61 
 
 		 653 aa  165  9e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4896  short chain dehydrogenase  40.89 
 
 		 671 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0501144 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1750  Male sterility domain protein  39.53 
 
 		 642 aa  160  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.64 
 
 		 280 aa  159  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1104  Male sterility domain protein  39.77 
 
 		 701 aa  146  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.972313  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6897  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.95 
 
 		 264 aa  109  7.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4456  short chain dehydrogenase  36.87 
 
 		 258 aa  106  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.968852  decreased coverage  0.00124263 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.2 
 
 		 330 aa  102  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11068  oxidoreductase  35.26 
 
 		 301 aa  102  6e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.205536 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 		 252 aa  102  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2596  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 		 287 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.2 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0961773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 266 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.88 
 
 		 238 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0669  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.31 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.154574  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3524  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.45 
 
 		 272 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.382394  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.87 
 
 		 249 aa  99.8  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.2 
 
 		 253 aa  99.8  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 244 aa  99.8  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000989308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 		 266 aa  99  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.47 
 
 		 261 aa  98.6  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.04 
 
 		 262 aa  98.6  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.133593  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3756  gluconate 5-dehydrogenase  31.19 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0911  short chain dehydrogenase  35.36 
 
 		 242 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1904  gluconate 5-dehydrogenase  30.81 
 
 		 270 aa  97.4  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000312184  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 		 247 aa  97.4  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.69 
 
 		 253 aa  97.4  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260507  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 		 244 aa  97.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7167  short chain dehydrogenase  35.57 
 
 		 249 aa  96.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 		 248 aa  96.7  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.574158  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0938  short chain dehydrogenase  35.36 
 
 		 242 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.65 
 
 		 244 aa  97.1  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123251 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2534  gluconate 5-dehydrogenase  29.72 
 
 		 262 aa  96.7  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.74 
 
 		 259 aa  96.3  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.63 
 
 		 256 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224395  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.63 
 
 		 256 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.53 
 
 		 259 aa  95.9  8e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.12 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367673  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0925  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.55 
 
 		 251 aa  95.1  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.568448  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6091  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.52 
 
 		 260 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.50583  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0943  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.22 
 
 		 293 aa  95.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1896  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.73 
 
 		 247 aa  95.1  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.176277 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.12 
 
 		 262 aa  94.7  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.34 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.459049  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1751  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.5 
 
 		 257 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1164  gluconate 5-dehydrogenase  31.75 
 
 		 263 aa  94.7  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.34 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1752  short chain dehydrogenase  35.86 
 
 		 254 aa  94.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0490  gluconate 5-dehydrogenase  32.49 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3359  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.2 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.711372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7084  gluconate 5-dehydrogenase  32.65 
 
 		 255 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.17 
 
 		 257 aa  93.6  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.605713  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 		 332 aa  94  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261589  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.49 
 
 		 264 aa  93.6  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  0.46236 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.67 
 
 		 257 aa  94  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.355177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 		 252 aa  93.2  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.22334  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.44 
 
 		 261 aa  93.6  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2470  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.12 
 
 		 244 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2771  short chain dehydrogenase  35.14 
 
 		 253 aa  93.2  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1626  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.09 
 
 		 245 aa  93.2  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0813857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.91 
 
 		 271 aa  93.2  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.61951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 		 240 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 342 aa  92.8  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1055  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.99 
 
 		 258 aa  92.8  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.24 
 
 		 246 aa  92.8  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0420142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.56 
 
 		 249 aa  92.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.311099  normal  0.357873 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0353  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.08 
 
 		 262 aa  92.4  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 		 247 aa  92.4  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.269971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.56 
 
 		 251 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6443  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.56 
 
 		 259 aa  92.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0150364  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>