More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10520 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_0669  glutamyl-tRNA reductase  78.57 
 
 		 447 aa  646    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0067  glutamyl-tRNA reductase  77.01 
 
 		 455 aa  644    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00785406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0676  glutamyl-tRNA reductase  78.57 
 
 		 447 aa  646    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0689  glutamyl-tRNA reductase  78.57 
 
 		 447 aa  646    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10520  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 468 aa  916    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0844  glutamyl-tRNA reductase  76.78 
 
 		 456 aa  629  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0729524  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0667  glutamyl-tRNA reductase  61.99 
 
 		 445 aa  508  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1013  glutamyl-tRNA reductase  59.96 
 
 		 457 aa  487  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0741734  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6730  glutamyl-tRNA reductase  56.06 
 
 		 438 aa  428  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02850  glutamyl-tRNA reductase  53.02 
 
 		 443 aa  404  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.766325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0548  Glutamyl-tRNA reductase  53.24 
 
 		 440 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675459  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4440  glutamyl-tRNA reductase  52.17 
 
 		 434 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0261  glutamyl-tRNA reductase  50.46 
 
 		 435 aa  381  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.719241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0238  glutamyl-tRNA reductase  46.07 
 
 		 473 aa  378  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.264008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2733  glutamyl-tRNA reductase  46.74 
 
 		 477 aa  373  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4580  glutamyl-tRNA reductase  52.63 
 
 		 458 aa  375  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0356  glutamyl-tRNA reductase  49.35 
 
 		 455 aa  374  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5696  glutamyl-tRNA reductase  49.33 
 
 		 448 aa  368  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0426  glutamyl-tRNA reductase  49.89 
 
 		 455 aa  355  8.999999999999999e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  hitchhiker  0.00912158 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4372  glutamyl-tRNA reductase  43.67 
 
 		 501 aa  338  9.999999999999999e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8326  glutamyl-tRNA reductase  49.89 
 
 		 440 aa  335  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.522016 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0485  glutamyl-tRNA reductase  42.98 
 
 		 473 aa  320  3e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.472188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0617  Glutamyl-tRNA reductase  48.37 
 
 		 442 aa  318  2e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.186934  normal  0.0532706 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0494  glutamyl-tRNA reductase  47.7 
 
 		 430 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6131  glutamyl-tRNA reductase  41.61 
 
 		 476 aa  313  4.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24410  glutamyl-tRNA reductase  44.07 
 
 		 456 aa  303  4.0000000000000003e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.557757  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  34.29 
 
 		 443 aa  268  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  33.72 
 
 		 464 aa  264  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  35.2 
 
 		 464 aa  264  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  38.84 
 
 		 436 aa  260  4e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  34.55 
 
 		 443 aa  258  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  34.03 
 
 		 454 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  34.79 
 
 		 436 aa  252  8.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  37.91 
 
 		 446 aa  249  7e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  33.57 
 
 		 434 aa  248  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  35.12 
 
 		 434 aa  246  6e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  33.57 
 
 		 434 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  32.71 
 
 		 434 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  35.12 
 
 		 461 aa  243  7e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  32.34 
 
 		 458 aa  241  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  32.71 
 
 		 434 aa  240  4e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  34.42 
 
 		 443 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  28.9 
 
 		 444 aa  239  9e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  37.21 
 
 		 441 aa  237  4e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 		 434 aa  237  4e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  28.98 
 
 		 444 aa  233  5e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  28.98 
 
 		 444 aa  233  5e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  28.98 
 
 		 444 aa  233  5e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  28.98 
 
 		 444 aa  233  5e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  28.98 
 
 		 444 aa  233  5e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  28.98 
 
 		 444 aa  233  6e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  29.2 
 
 		 444 aa  233  6e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  35.32 
 
 		 458 aa  233  7.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  28.54 
 
 		 444 aa  231  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  28.54 
 
 		 444 aa  231  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  29.98 
 
 		 441 aa  229  7e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  32.87 
 
 		 438 aa  229  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  33.87 
 
 		 421 aa  229  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  28.67 
 
 		 443 aa  226  6e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2071  glutamyl-tRNA reductase  37.63 
 
 		 473 aa  224  2e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0822368  hitchhiker  0.0000218323 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  31.64 
 
 		 428 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  33.86 
 
 		 436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0949  glutamyl-tRNA reductase  30.34 
 
 		 431 aa  219  6e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  32.33 
 
 		 428 aa  219  7.999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3544  glutamyl-tRNA reductase  36.03 
 
 		 414 aa  219  8.999999999999998e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.037813  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  36.87 
 
 		 425 aa  218  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 		 440 aa  218  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  37.1 
 
 		 453 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  33.26 
 
 		 442 aa  217  4e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  31.41 
 
 		 428 aa  216  7e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0504  glutamyl-tRNA reductase  33.18 
 
 		 438 aa  216  8e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 		 430 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1764  glutamyl-tRNA reductase  30.93 
 
 		 448 aa  215  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1730  glutamyl-tRNA reductase  30.93 
 
 		 448 aa  215  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.234502  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  35.7 
 
 		 451 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  33.03 
 
 		 420 aa  213  7e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  32.87 
 
 		 420 aa  211  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1746  glutamyl-tRNA reductase  37.84 
 
 		 425 aa  210  5e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  31.72 
 
 		 432 aa  209  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  32.27 
 
 		 450 aa  209  8e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  36.13 
 
 		 440 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  32.35 
 
 		 422 aa  208  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  33.26 
 
 		 443 aa  208  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  37 
 
 		 422 aa  207  4e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  30.95 
 
 		 428 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  30.95 
 
 		 428 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  34.25 
 
 		 422 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1236  glutamyl-tRNA reductase  30.09 
 
 		 448 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.116001  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0286  glutamyl-tRNA reductase  32.55 
 
 		 419 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  34.02 
 
 		 422 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1538  glutamyl-tRNA reductase  29.09 
 
 		 426 aa  200  5e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000572654  hitchhiker  0.00320604 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 		 432 aa  199  7.999999999999999e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 		 426 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.66 
 
 		 429 aa  198  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  31.49 
 
 		 442 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1296  glutamyl-tRNA reductase  32.64 
 
 		 425 aa  197  5.000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0896  glutamyl-tRNA reductase  30.34 
 
 		 429 aa  196  6e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.583722  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  33.72 
 
 		 418 aa  196  6e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41480  glutamyl-tRNA reductase  36.08 
 
 		 408 aa  196  6e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340284  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09941  glutamyl-tRNA reductase  30.14 
 
 		 435 aa  196  7e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.521011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>