More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10411 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10411  beta lactamase like protein  100 
 
 
272 aa  548  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0697  beta-lactamase domain-containing protein  63.29 
 
 
246 aa  311  4.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0317435 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0212  beta-lactamase domain-containing protein  58.47 
 
 
247 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0531  beta-lactamase-like protein  61.09 
 
 
242 aa  278  8e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235067  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0543  beta-lactamase domain-containing protein  61.09 
 
 
242 aa  278  8e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0521  beta-lactamase domain-containing protein  61.09 
 
 
242 aa  278  8e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926076  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0215  beta-lactamase domain protein  42.37 
 
 
252 aa  185  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1277  beta-lactamase domain protein  42.8 
 
 
242 aa  182  8.000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4384  beta-lactamase domain protein  38.6 
 
 
258 aa  172  5.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0493064 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0249  beta-lactamase domain protein  39.32 
 
 
248 aa  169  4e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19030  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.46 
 
 
278 aa  108  8.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3735  beta-lactamase domain protein  29.3 
 
 
246 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.555348  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2710  beta-lactamase domain protein  32.7 
 
 
237 aa  94.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1024  beta-lactamase domain protein  31.65 
 
 
256 aa  86.7  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  30.6 
 
 
242 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  27.31 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  28.94 
 
 
243 aa  68.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5146  metallo-beta-lactamase family protein  30.13 
 
 
240 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4832  beta-lactamase domain-containing protein  30.42 
 
 
240 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1391  beta-lactamase domain-containing protein  26.32 
 
 
244 aa  66.2  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.354164  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  30.09 
 
 
321 aa  65.5  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5152  metallo-beta-lactamase family protein  30.43 
 
 
240 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.810942  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2396  beta-lactamase domain protein  27.23 
 
 
228 aa  65.1  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5141  metallo-beta-lactamase family protein  29 
 
 
240 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2563  beta-lactamase domain protein  33.92 
 
 
282 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4874  metallo-beta-lactamase family protein  29.44 
 
 
240 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4731  metallo-beta-lactamase family protein  29.44 
 
 
240 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5245  metallo-beta-lactamase family protein  29.44 
 
 
240 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4716  metallo-beta-lactamase family protein  29.87 
 
 
240 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1085  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
263 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2292  beta-lactamase domain protein  27.24 
 
 
321 aa  62.8  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0204091  normal  0.304902 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5114  metallo-beta-lactamase family protein  29 
 
 
240 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  23.93 
 
 
255 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0673  beta-lactamase-like  39.24 
 
 
232 aa  60.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0769  beta-lactamase domain-containing protein  29.15 
 
 
273 aa  60.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.310253 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0462  metallo-beta-lactamase family protein  25.45 
 
 
269 aa  60.5  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000870775  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2272  beta-lactamase domain protein  29.02 
 
 
324 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1374  beta-lactamase domain-containing protein  27.19 
 
 
192 aa  60.5  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.09884  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  29.44 
 
 
211 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00137  metallo-beta-lactamase family protein  26.63 
 
 
260 aa  59.3  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.229532  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2405  beta-lactamase-like  27.65 
 
 
237 aa  59.3  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4154  beta-lactamase domain-containing protein  30.17 
 
 
299 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.336345 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  27.04 
 
 
285 aa  58.2  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  26.06 
 
 
207 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  26.06 
 
 
207 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4522  beta-lactamase domain protein  29.27 
 
 
299 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231723  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1117  beta-lactamase domain-containing protein  28.83 
 
 
205 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  28.31 
 
 
240 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0784  beta-lactamase domain protein  30.9 
 
 
354 aa  57  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0834  beta-lactamase domain-containing protein  30.28 
 
 
205 aa  57  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0513  beta-lactamase domain-containing protein  26.92 
 
 
228 aa  57.4  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000126924  hitchhiker  0.000693595 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1287  beta-lactamase domain-containing protein  32.35 
 
 
226 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0372729  normal  0.0146108 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1530  beta-lactamase domain protein  27.87 
 
 
297 aa  56.6  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.788095  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15960  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.24 
 
 
269 aa  56.6  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.612617  hitchhiker  0.00000215477 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.11 
 
 
346 aa  57  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  25.66 
 
 
226 aa  56.2  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0035  beta-lactamase domain protein  23.83 
 
 
210 aa  56.2  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2203  beta-lactamase domain-containing protein  27.68 
 
 
252 aa  55.8  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  32.2 
 
 
213 aa  55.8  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3140  metallo-beta-lactamase family protein  30.53 
 
 
281 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0313805  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2427  beta-lactamase domain-containing protein  31.44 
 
 
300 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.501309  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  27.47 
 
 
245 aa  55.5  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1560  beta-lactamase domain-containing protein  28.74 
 
 
205 aa  55.5  0.0000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2960  putative hydrolase  25.44 
 
 
217 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047526 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  31.37 
 
 
234 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  25.44 
 
 
217 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0733  beta-lactamase domain protein  26.57 
 
 
235 aa  54.3  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20260  beta-lactamase domain protein  36.84 
 
 
263 aa  54.3  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  28.16 
 
 
329 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  27.5 
 
 
231 aa  54.3  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  29.33 
 
 
204 aa  54.3  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2578  beta-lactamase domain protein  27.17 
 
 
340 aa  54.3  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2493  beta-lactamase-like  29.72 
 
 
232 aa  54.7  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1110  metallo-beta-lactamase family protein  24.24 
 
 
207 aa  53.5  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3142  metallo-beta-lactamase family protein  30.82 
 
 
285 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0970008  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  29.03 
 
 
348 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5582  beta-lactamase domain protein  27.8 
 
 
322 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4159  beta-lactamase domain-containing protein  31.21 
 
 
303 aa  53.9  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274128  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  24.23 
 
 
231 aa  53.5  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1949  beta-lactamase domain protein  28.79 
 
 
208 aa  53.1  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2827  metal-dependent hydrolase  30.82 
 
 
285 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0133277  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  29.73 
 
 
241 aa  53.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3529  beta-lactamase-like  31.34 
 
 
277 aa  53.5  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  27.6 
 
 
321 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2483  putative Beta-lactamase  31.11 
 
 
290 aa  52.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0352  beta-lactamase domain protein  28.32 
 
 
323 aa  52.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  29.45 
 
 
209 aa  52.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  27.35 
 
 
314 aa  52.4  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2035  beta-lactamase domain-containing protein  25.48 
 
 
301 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2879  beta-lactamase domain protein  28.17 
 
 
216 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191235  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0424  beta-lactamase domain protein  31.16 
 
 
223 aa  52  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.65466  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51250  hypothetical protein  34.12 
 
 
252 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188489 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0136  beta-lactamase domain-containing protein  28.22 
 
 
305 aa  51.6  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2218  beta-lactamase domain-containing protein  24.38 
 
 
217 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0019  beta-lactamase domain-containing protein  27.83 
 
 
207 aa  50.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.751358  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4636  beta-lactamase domain protein  28.95 
 
 
299 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3121  metallo-beta-lactamase family protein  28.66 
 
 
285 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  30.3 
 
 
213 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3996  beta-lactamase domain-containing protein  29.36 
 
 
296 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590455  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2327  beta-lactamase domain protein  31.72 
 
 
319 aa  50.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>