More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10409 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10409  acyl-CoA synthetase  100 
 
 
585 aa  1204    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11554  acyl-CoA synthetase  45.64 
 
 
583 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13860  acyl-CoA synthetase  44.44 
 
 
584 aa  489  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3104  acyl-CoA synthetase  44.02 
 
 
601 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3124  acyl-CoA synthetase  44.02 
 
 
601 aa  485  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3164  acyl-CoA synthetase  44.02 
 
 
601 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254716  normal  0.383191 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3127  acyl-CoA synthetase  45.19 
 
 
576 aa  485  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.274694  normal  0.640606 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3394  acyl-CoA synthetase  45.78 
 
 
577 aa  483  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.682932  normal  0.36093 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12955  acyl-CoA synthetase  45.8 
 
 
580 aa  480  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11209  acyl-CoA synthetase  44.86 
 
 
578 aa  475  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3396  acyl-CoA synthetase  43.93 
 
 
592 aa  478  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.733588  normal  0.231896 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3129  acyl-CoA synthetase  43.42 
 
 
592 aa  473  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.853236  normal  0.2084 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11562  acyl-CoA synthetase  44.18 
 
 
584 aa  474  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12944  acyl-CoA synthetase  44.06 
 
 
626 aa  473  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12964  acyl-CoA synthetase  43.84 
 
 
619 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2836  acyl-CoA synthetase  44.23 
 
 
580 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.562117  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2867  acyl-CoA synthetase  44.23 
 
 
580 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.70026  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2880  acyl-CoA synthetase  44.23 
 
 
631 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.894395  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0402  acyl-CoA synthetase  42.47 
 
 
573 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795318  normal  0.658379 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0272  acyl-CoA synthetase  42.41 
 
 
573 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984727  normal  0.936672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0237  acyl-CoA synthetase  41.72 
 
 
590 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.114716  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0247  acyl-CoA synthetase  41.72 
 
 
590 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0257  acyl-CoA synthetase  41.72 
 
 
590 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00930641 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3604  putative fatty-acid--CoA ligase  38.69 
 
 
593 aa  334  3e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.698537  normal  0.297666 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4760  AMP-dependent synthetase and ligase  35.81 
 
 
597 aa  326  8.000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0174  AMP-dependent synthetase and ligase  36.21 
 
 
636 aa  321  1.9999999999999998e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.121627  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.68 
 
 
629 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  33.39 
 
 
579 aa  305  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13835  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.16 
 
 
637 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.331415  normal  0.284181 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  35.62 
 
 
592 aa  304  3.0000000000000004e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  33.28 
 
 
1067 aa  302  1e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5392  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.37 
 
 
629 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.117566 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1168  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.54 
 
 
629 aa  301  3e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5011  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.37 
 
 
629 aa  300  4e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934148  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5099  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.37 
 
 
629 aa  300  4e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.383876  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1714  AMP-binding domain-containing protein  35.37 
 
 
610 aa  300  6e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0293  AMP-binding domain-containing protein  35.37 
 
 
599 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117519  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1016  AMP-binding domain-containing protein  35.37 
 
 
599 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322447  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0277  AMP-binding domain-containing protein  35.37 
 
 
599 aa  299  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1302  AMP-binding domain-containing protein  35.37 
 
 
610 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.679407  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  35.29 
 
 
6889 aa  298  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5330  AMP-dependent synthetase and ligase  35.97 
 
 
608 aa  297  3e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.611061 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  32.2 
 
 
1656 aa  297  4e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0214  AMP-dependent synthetase and ligase  34.9 
 
 
640 aa  295  2e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.541656  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1800  AMP-binding domain-containing protein  35.02 
 
 
610 aa  295  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  31.71 
 
 
611 aa  294  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2901  putative fatty-acid--CoA ligase  36.01 
 
 
593 aa  291  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.650918  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  34.51 
 
 
2103 aa  291  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  31.97 
 
 
586 aa  291  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8830  peptide synthetase  34.55 
 
 
574 aa  290  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426227  decreased coverage  0.000549729 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  34.3 
 
 
578 aa  289  8e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1903  AMP-dependent synthetase and ligase  34.46 
 
 
599 aa  288  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2453  putative acyl-CoA synthase  32.14 
 
 
588 aa  288  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0769746  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1972  AMP-dependent synthetase and ligase  31.85 
 
 
614 aa  287  2.9999999999999996e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  31.86 
 
 
991 aa  287  2.9999999999999996e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.911479  normal  0.633615 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3869  putative fatty-acid--CoA ligase  36.32 
 
 
605 aa  286  5e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3943  putative fatty-acid--CoA ligase  36.32 
 
 
605 aa  286  5e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.082676  normal  0.0172927 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  31.13 
 
 
2997 aa  286  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3855  putative fatty-acid--CoA ligase  36.9 
 
 
605 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724696  hitchhiker  0.00746256 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11954  putative fatty-acid--CoA ligase  35.37 
 
 
620 aa  284  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.607108 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  36.78 
 
 
1789 aa  283  6.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6561  AMP-binding domain-containing protein  33.39 
 
 
609 aa  282  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  32.75 
 
 
1474 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  33.9 
 
 
4318 aa  281  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  33.56 
 
 
4317 aa  280  6e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  32.66 
 
 
4317 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  32.55 
 
 
2791 aa  278  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  33.05 
 
 
4317 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2966  putative fatty-acid--CoA ligase  34.8 
 
 
607 aa  278  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.453521  normal  0.382652 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  30.9 
 
 
581 aa  277  3e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1649  AMP-dependent synthetase and ligase  32.05 
 
 
602 aa  278  3e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.443768 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  30.44 
 
 
581 aa  276  8e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  33.84 
 
 
6403 aa  276  9e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  32.6 
 
 
4332 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  32.72 
 
 
4336 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3181  AMP-dependent synthetase and ligase  30.74 
 
 
596 aa  273  7e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  33.39 
 
 
3231 aa  271  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  32.55 
 
 
4317 aa  272  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  29.9 
 
 
2762 aa  272  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7308  polyketide synthetase  32.39 
 
 
755 aa  271  2.9999999999999997e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39684  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3741  AMP-dependent synthetase and ligase  31.67 
 
 
725 aa  270  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.101405 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  32.21 
 
 
1801 aa  270  5.9999999999999995e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3687  AMP-dependent synthetase and ligase  31.67 
 
 
725 aa  269  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  33.11 
 
 
4336 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4074  AMP-dependent synthetase and ligase  31.33 
 
 
597 aa  267  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  34.11 
 
 
2820 aa  267  4e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  31.33 
 
 
597 aa  266  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  32.34 
 
 
3235 aa  266  7e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3680  amino acid adenylation domain protein  32.82 
 
 
2721 aa  266  8e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2145  AMP-dependent synthetase and ligase  33.69 
 
 
958 aa  265  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6306  AMP-dependent synthetase and ligase  32.52 
 
 
595 aa  261  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.580679 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  33.4 
 
 
3208 aa  259  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  31.69 
 
 
4342 aa  259  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2989  AMP-dependent synthetase and ligase  29.83 
 
 
593 aa  258  3e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204097  normal  0.579724 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  32.05 
 
 
582 aa  256  6e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  32.55 
 
 
1776 aa  256  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2129  acyltransferase family protein  32.03 
 
 
852 aa  255  2.0000000000000002e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  32.52 
 
 
1779 aa  254  4.0000000000000004e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  31.19 
 
 
4342 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2789  AMP-binding domain-containing protein  32.4 
 
 
617 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.472303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>