25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10406 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10406  transmembrane protein  100 
 
 
123 aa  229  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0459  putative transmembrane protein  68.07 
 
 
129 aa  152  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0167  putative transmembrane protein  70.83 
 
 
127 aa  140  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0176  putative transmembrane protein  70.83 
 
 
127 aa  140  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0157  putative transmembrane protein  70.83 
 
 
127 aa  140  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0193  putative transmembrane protein  64.71 
 
 
148 aa  135  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580354  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3725  hypothetical protein  52.25 
 
 
127 aa  103  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2924  CGLD9; hypothetical protein  54.46 
 
 
118 aa  98.2  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000992549  hitchhiker  0.0000308384 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2206  hypothetical protein  45.63 
 
 
138 aa  86.7  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00274639  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4484  hypothetical protein  39.45 
 
 
137 aa  85.1  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38663  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0483  hypothetical protein  42.16 
 
 
124 aa  80.1  0.000000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3912  putative transmembrane protein  41.35 
 
 
127 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.116991  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0350  hypothetical protein  38.21 
 
 
146 aa  79.3  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0794  hypothetical protein  41.44 
 
 
123 aa  78.2  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.332572  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13960  hypothetical protein  44.64 
 
 
132 aa  75.5  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.735929 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1943  hypothetical protein  40.38 
 
 
144 aa  67  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000376833 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0888  hypothetical protein  37.04 
 
 
129 aa  67  0.00000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1060  hypothetical protein  50.63 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2730  putative transmembrane protein  51.72 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137333  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4543  hypothetical protein  41.18 
 
 
136 aa  62.8  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25040  hypothetical protein  38.6 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22010  hypothetical protein  43.33 
 
 
142 aa  57  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.186895  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12090  hypothetical protein  46.91 
 
 
138 aa  52  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0468866  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0051  hypothetical protein  30.09 
 
 
139 aa  43.5  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0289  hypothetical protein  31.15 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.723479  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>