174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10397 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  100 
 
 
441 aa  872    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  59.88 
 
 
511 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  59.88 
 
 
488 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  59.94 
 
 
480 aa  329  6e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  59.94 
 
 
480 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  59.94 
 
 
480 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4099  hypothetical protein  43.42 
 
 
517 aa  254  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165873  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  41.3 
 
 
535 aa  249  9e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0179  hypothetical protein  42.86 
 
 
524 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1180  hypothetical protein  41.67 
 
 
519 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209528  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  41.71 
 
 
512 aa  237  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5065  hypothetical protein  42.2 
 
 
506 aa  225  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  43.39 
 
 
464 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  37.71 
 
 
539 aa  220  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  44.87 
 
 
473 aa  219  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  45.83 
 
 
519 aa  218  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4927  hypothetical protein  38.19 
 
 
546 aa  216  7e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.929076 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12134  hypothetical protein  44.66 
 
 
550 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000034137  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4917  hypothetical protein  41.58 
 
 
508 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5006  hypothetical protein  41.58 
 
 
508 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3935  hypothetical protein  40.64 
 
 
514 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0910355 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1272  HNH endonuclease  39.45 
 
 
532 aa  205  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  45.7 
 
 
484 aa  203  5e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  45.79 
 
 
567 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3920  hypothetical protein  40.76 
 
 
508 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3994  hypothetical protein  40.76 
 
 
508 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00383359  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5299  hypothetical protein  41.3 
 
 
516 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0159919  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0621  hypothetical protein  41.25 
 
 
491 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0634  hypothetical protein  41.25 
 
 
491 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0612  hypothetical protein  40.95 
 
 
491 aa  196  9e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10401  13E12 repeat-containing protein  85.45 
 
 
122 aa  187  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  50.47 
 
 
581 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  50.47 
 
 
581 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  50.24 
 
 
578 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5774  HNH endonuclease  43.9 
 
 
516 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300125  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  48.58 
 
 
578 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  50.71 
 
 
593 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  50.71 
 
 
593 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  49.29 
 
 
578 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  49.29 
 
 
578 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2144  hypothetical protein  45.41 
 
 
593 aa  162  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170651  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5546  hypothetical protein  44.04 
 
 
571 aa  153  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419973  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2714  hypothetical protein  48.13 
 
 
601 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.707807  normal  0.117401 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5188  hypothetical protein  44.3 
 
 
586 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0262711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  49.18 
 
 
582 aa  149  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3176  hypothetical protein  48.09 
 
 
601 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436761  normal  0.0313411 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2756  HNH nuclease  47.37 
 
 
550 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3422  hypothetical protein  44.35 
 
 
620 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.023087  normal  0.778813 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  31.92 
 
 
519 aa  133  6.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  31.45 
 
 
566 aa  108  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4350  hypothetical protein  29.95 
 
 
579 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000306151  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  32.83 
 
 
567 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  30.68 
 
 
426 aa  90.9  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  33.05 
 
 
443 aa  87.8  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  55 
 
 
620 aa  85.5  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  30.71 
 
 
510 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  31.78 
 
 
443 aa  84.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  47.57 
 
 
637 aa  83.6  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00460  HNH endonuclease  48.31 
 
 
565 aa  82.8  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.711457 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  31.91 
 
 
551 aa  82.4  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4183  HNH endonuclease  44.83 
 
 
434 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3219  HNH endonuclease  34.33 
 
 
427 aa  80.9  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125237  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0740  hypothetical protein  37.84 
 
 
618 aa  80.1  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3082  HNH endonuclease  45.05 
 
 
709 aa  79.7  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  37.35 
 
 
714 aa  79  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  32.03 
 
 
498 aa  78.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  36.26 
 
 
602 aa  77  0.0000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  49.41 
 
 
748 aa  76.6  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02410  HNH endonuclease  43.82 
 
 
198 aa  76.6  0.0000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3627  HNH endonuclease  47.78 
 
 
743 aa  76.3  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0415546 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  44.44 
 
 
535 aa  75.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1741  hypothetical protein  35.56 
 
 
475 aa  75.5  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  32.14 
 
 
580 aa  74.3  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  32.65 
 
 
512 aa  73.6  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  51.35 
 
 
603 aa  72.8  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  32.97 
 
 
628 aa  72  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  34.44 
 
 
485 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  29.44 
 
 
499 aa  69.7  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  33.61 
 
 
530 aa  69.7  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  31.09 
 
 
516 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  31.35 
 
 
535 aa  68.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11717  hypothetical protein  26.84 
 
 
454 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.12455 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  32.66 
 
 
469 aa  67  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  36.69 
 
 
580 aa  67  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  45.07 
 
 
605 aa  66.6  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02590  HNH endonuclease  39.78 
 
 
169 aa  65.9  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  36.69 
 
 
584 aa  64.3  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  46.15 
 
 
558 aa  64.3  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  31.22 
 
 
408 aa  63.2  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  33.16 
 
 
310 aa  63.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  29.35 
 
 
556 aa  62  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3886  hypothetical protein  39.22 
 
 
554 aa  61.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00540166  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  29.07 
 
 
568 aa  59.7  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  32.86 
 
 
566 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  46.03 
 
 
442 aa  57.4  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  35.63 
 
 
620 aa  57.4  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4696  hypothetical protein  44.09 
 
 
635 aa  57  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0062  hypothetical protein  35.4 
 
 
572 aa  56.6  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161525  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1476  HNH endonuclease  36.54 
 
 
586 aa  56.2  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266278  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1666  hypothetical protein  34.51 
 
 
557 aa  55.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>