More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10333 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2679  transcriptional regulator, TetR family  39.69 
 
 		 210 aa  121  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569392  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2766  regulatory protein, TetR  38.27 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.597397  hitchhiker  0.0084658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8769  putative transcriptional regulator, TetR family  37.44 
 
 		 202 aa  104  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3882  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 190 aa  98.6  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5621  transcriptional regulator, TetR family  34.03 
 
 		 195 aa  98.2  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00254336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1492  putative transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 216 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0023  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 205 aa  93.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22250  transcriptional regulator  31.29 
 
 		 196 aa  91.7  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0446991  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3751  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0636766  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5669  regulatory protein TetR  30.81 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1885  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2069  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.118237  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1938  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3324  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 212 aa  62  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3323  TetR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2546  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  42.7 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  27.22 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  37.04 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2853  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14520  Transcriptional regulator PsrA  35.48 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1978  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000899637  hitchhiker  0.000000574301 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  36 
 
 		 233 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6888  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 235 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 235 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2259  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1789  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.461504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02639  transcriptional regulator  26.81 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 235 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01897  transcriptional regulator, TetR family protein  40.91 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111118  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2245  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  37.89 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2258  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.968255  hitchhiker  0.0010637 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2171  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.068169  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2050  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274298  normal  0.196014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1925  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00396712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2155  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.116273  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  28.68 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2339  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.519522  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0813  AcrR/TetR family transcription regulator  36.92 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2543  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214617 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2066  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.612632  hitchhiker  0.000107098 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1888  transcriptional regulator, TetR family protein  40 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4789  transcriptional regulator  30.99 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 240 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2746  regulatory protein TetR  35.59 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  43.42 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3446  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 335 aa  53.9  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.843948  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4787  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0422575  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2116  regulatory protein, TetR  40 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000093152  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2689  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  51.06 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3508  transcriptional regulator PsrA  38.71 
 
 		 238 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4386  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4396  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3282  regulatory protein, TetR  38.71 
 
 		 238 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4482  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  31.46 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0168  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4770  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  31.46 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 222 aa  53.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  39.62 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4761  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1647  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3483  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 218 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3211  regulatory protein, TetR  38.2 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0474  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.542957  hitchhiker  4.20035e-18 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2410  transcriptional regulator, TetR family  44.59 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>