17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10307 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10307  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  285  2e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000112369  normal  0.0967595 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5190  PilT domain-containing protein  65.12 
 
 
137 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.745864  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2785  PilT protein domain protein  65.38 
 
 
141 aa  167  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.030495 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5559  PilT domain-containing protein  59.7 
 
 
136 aa  161  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.966422  normal  0.472394 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0935  PilT protein domain protein  63.43 
 
 
137 aa  161  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.827464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7130  PilT domain-containing protein  64.35 
 
 
159 aa  143  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428024  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12770  hypothetical protein  42.42 
 
 
138 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10231  hypothetical protein  42.97 
 
 
226 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2779  PilT protein domain protein  39.69 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156737  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1339  hypothetical protein  57.14 
 
 
99 aa  65.1  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0087  PilT protein domain protein  39.86 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12566  hypothetical protein  51.61 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.342692  normal  0.114809 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4093  PilT protein domain-containing protein  36.62 
 
 
137 aa  56.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7412  hypothetical protein  63.89 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.502389  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3760  PilT protein domain protein  30.83 
 
 
148 aa  45.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.383915  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0521  hypothetical protein  46.94 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.281693  normal  0.161001 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1221  PilT domain-containing protein  32.31 
 
 
164 aa  40  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>