More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10301 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10301  trans-aconitate 2-methyltransferase  100 
 
 
261 aa  529  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0338576  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0386  trans-aconitate 2-methyltransferase  66.14 
 
 
254 aa  356  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0397352  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0374  trans-aconitate 2-methyltransferase  66.14 
 
 
254 aa  356  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603842  normal  0.758289 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0395  trans-aconitate 2-methyltransferase  66.14 
 
 
254 aa  356  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0425  trans-aconitate 2-methyltransferase  63.64 
 
 
254 aa  346  3e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.500195  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0316  trans-aconitate 2-methyltransferase  65.22 
 
 
255 aa  340  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.224637  normal  0.898974 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13820  trans-aconitate 2-methyltransferase  61.35 
 
 
255 aa  318  5e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328183  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1297  trans-aconitate 2-methyltransferase  58.5 
 
 
249 aa  284  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8614  Trans-aconitate 2-methyltransferase  49.22 
 
 
250 aa  238  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1778  trans-aconitate 2-methyltransferase  48.67 
 
 
265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525506  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3158  trans-aconitate 2-methyltransferase  47.84 
 
 
252 aa  229  4e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  47.84 
 
 
259 aa  228  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2075  trans-aconitate 2-methyltransferase  47.45 
 
 
287 aa  227  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.864232  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3852  trans-aconitate 2-methyltransferase  49.23 
 
 
269 aa  227  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223127  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0992  Trans-aconitate 2-methyltransferase  47.04 
 
 
294 aa  226  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0608  Trans-aconitate 2-methyltransferase  48.24 
 
 
262 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1765  trans-aconitate 2-methyltransferase  47.86 
 
 
264 aa  224  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.736943  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17170  trans-aconitate methyltransferase  45.88 
 
 
255 aa  206  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00821566  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  46.06 
 
 
257 aa  206  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  43.32 
 
 
307 aa  193  2e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3467  Trans-aconitate 2-methyltransferase  38.04 
 
 
257 aa  190  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  40.87 
 
 
258 aa  186  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.7 
 
 
252 aa  186  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.335531  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4574  Trans-aconitate 2-methyltransferase  40.78 
 
 
255 aa  186  4e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01476  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.1 
 
 
252 aa  185  6e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2127  Trans-aconitate 2-methyltransferase  38.1 
 
 
252 aa  185  6e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01487  hypothetical protein  38.1 
 
 
252 aa  185  6e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2139  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.1 
 
 
252 aa  185  6e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2132  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.7 
 
 
252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523623  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1601  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.7 
 
 
252 aa  182  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.767111  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1653  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.3 
 
 
252 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.217982  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  40.08 
 
 
257 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.89 
 
 
258 aa  177  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1690  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.4 
 
 
243 aa  175  7e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00892197  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3508  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.77 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510981  normal  0.74985 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.8 
 
 
260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  37.15 
 
 
256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.36 
 
 
258 aa  170  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1603  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.46 
 
 
258 aa  169  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.463552  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1770  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.46 
 
 
258 aa  169  6e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480921  hitchhiker  0.00972565 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.4 
 
 
259 aa  168  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1498  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.6 
 
 
258 aa  168  8e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.87545e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.57 
 
 
258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.13 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0119  Trans-aconitate 2-methyltransferase  38.87 
 
 
268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.464742  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1621  trans-aconitate methyltransferase  37.74 
 
 
344 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898496  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2545  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.91 
 
 
272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00229105 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2018  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.08 
 
 
252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00947857  normal  0.156367 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2673  trans-aconitate methyltransferase  37.5 
 
 
280 aa  163  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3170  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.91 
 
 
258 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.781198  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3371  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.91 
 
 
258 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.362106 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.22 
 
 
260 aa  162  7e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2430  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.5 
 
 
268 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2136  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.14 
 
 
256 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000208135  decreased coverage  0.00294275 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0827  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 
256 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.52 
 
 
255 aa  159  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2909  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.92 
 
 
256 aa  158  7e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0465109  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1455  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.41 
 
 
255 aa  157  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1410  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.41 
 
 
255 aa  157  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2216  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.91 
 
 
258 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414358  normal  0.438361 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.65 
 
 
258 aa  155  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2425  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.73 
 
 
253 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.576064 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3612  methyltransferase type 11  34.65 
 
 
256 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2481  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.54 
 
 
256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0101749  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31370  hypothetical protein  36.03 
 
 
275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14144  hitchhiker  0.000000000000010613 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0941  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.37 
 
 
256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.842807  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3451  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.73 
 
 
256 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3156  trans-aconitate 2-methyltransferase  40.39 
 
 
258 aa  152  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5169  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.55 
 
 
262 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2668  hypothetical protein  36.29 
 
 
275 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  36.86 
 
 
258 aa  148  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1922  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.56 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.146762  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4126  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.81 
 
 
256 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3331  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.36 
 
 
262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.911002 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4124  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.97 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2805  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.97 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  32.43 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10909  conserved hypothetical protein  31.98 
 
 
333 aa  137  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00364748  normal  0.0877124 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0640  Trans-aconitate 2-methyltransferase  39.22 
 
 
252 aa  137  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1276  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.95 
 
 
271 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.281343  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  32.03 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0581  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.35 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0567  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.04 
 
 
293 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.445388  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6020  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30.23 
 
 
252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  33.2 
 
 
258 aa  125  7e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4775  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.2 
 
 
253 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3392  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.2 
 
 
221 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4335  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.47 
 
 
254 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  31.56 
 
 
253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0474  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.16 
 
 
277 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.901578 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3939  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.27 
 
 
255 aa  103  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3620  Trans-aconitate 2-methyltransferase  35.92 
 
 
201 aa  82  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2012  Methyltransferase type 11  29.52 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000802206  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  25.1 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  33.54 
 
 
268 aa  80.9  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  33.76 
 
 
268 aa  75.1  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  29.45 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0112  Methyltransferase type 11  26.15 
 
 
258 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.387929 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  27.8 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  26.79 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>