34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10262 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10262  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  305  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.277133  normal  0.125869 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 220 aa  104  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28140  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 216 aa  100  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  31.5 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3404  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64747  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 217 aa  64.3  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 203 aa  57.4  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2506  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 219 aa  57  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  30.71 
 
 		 207 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 204 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 204 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 209 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 204 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 197 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0459  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 193 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0472  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 193 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.957077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0483  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 193 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0641  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 211 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109704  normal  0.126118 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  25.38 
 
 		 196 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1733  transcriptional regulator, TetR family  28.46 
 
 		 213 aa  48.1  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446931  hitchhiker  0.00691691 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 185 aa  47  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3055  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 208 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 205 aa  43.9  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 198 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 235 aa  42  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0576  transcriptional regulator, TetR family  23.02 
 
 		 210 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 202 aa  40.8  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  42.55 
 
 		 205 aa  40.4  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>