72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10259 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10259  PPE family protein  100 
 
 
556 aa  1083  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0388917 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10459  PPE family protein  66.85 
 
 
518 aa  219  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13037  PPE family protein  52.45 
 
 
435 aa  217  6e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.52144e-113  hitchhiker  0.00208652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13033  PPE family protein  43.45 
 
 
434 aa  199  1e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.2921e-59  normal  0.0390657 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10287  PPE family protein  73.56 
 
 
536 aa  197  3e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.80093e-35  normal  0.372086 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0325  PPE protein  65.17 
 
 
540 aa  198  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500492  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10293  PPE family protein  57.33 
 
 
513 aa  191  3e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.312861 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12155  PPE family protein  61.8 
 
 
496 aa  187  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.649845 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11416  PPE family protein  37.09 
 
 
539 aa  184  5e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.93928e-11  normal  0.128386 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10097  PPE family protein  55.25 
 
 
463 aa  181  3e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0374  PPE protein  72.15 
 
 
525 aa  173  6e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0384  PPE protein  72.15 
 
 
525 aa  173  6e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0363  PPE protein  72.15 
 
 
525 aa  173  6e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0415  PPE protein  68.32 
 
 
524 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5962  PPE protein  44.77 
 
 
452 aa  147  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.738574  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5559  PPE protein  44.77 
 
 
452 aa  147  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67535  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13770  PPE family protein  68.89 
 
 
315 aa  125  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0059  PPE protein  45.22 
 
 
443 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0146152 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0078  PPE protein  45.22 
 
 
443 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.6171  normal  0.0155913 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0069  PPE protein  45.22 
 
 
443 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439016  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0768  PPE protein  40 
 
 
436 aa  115  2e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13908  PPE family protein  47.44 
 
 
368 aa  114  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00117141  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0077  PPE protein  42.58 
 
 
439 aa  112  1e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.150251  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0327  PPE protein  41.57 
 
 
445 aa  108  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.821755  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13771  PPE family protein  68.83 
 
 
77 aa  102  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5459  PPE protein  39.61 
 
 
450 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.785537  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11820  PPE family protein  35.32 
 
 
350 aa  87  8e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.261988  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11817  PPE family protein  35.32 
 
 
350 aa  85.9  2e-15  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13565  PPE family protein  37.43 
 
 
406 aa  85.5  3e-15  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  8.59509e-09 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13157  PPE family protein  35.06 
 
 
380 aa  82.4  2e-14  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11392  PPE family protein  35.71 
 
 
396 aa  81.6  3e-14  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11832  PPE family protein  37.85 
 
 
423 aa  80.9  6e-14  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.6976e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10447  PPE family protein  37.43 
 
 
487 aa  80.5  7e-14  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.925376  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10392  PPE family protein  36.05 
 
 
443 aa  78.6  3e-13  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.54935e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11220  PPE family protein  35.62 
 
 
391 aa  78.2  4e-13  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.540836  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11838  PPE family protein  36.14 
 
 
409 aa  74.7  4e-12  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11833  PPE family protein  32.19 
 
 
463 aa  73.2  1e-11  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.1557e-11  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11839  PPE family protein  35.98 
 
 
470 aa  72  2e-11  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12906  PPE family protein  39.76 
 
 
408 aa  71.2  4e-11  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00379008  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12376  PPE family protein  39.33 
 
 
391 aa  70.9  6e-11  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  5.84927e-25  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13513  PPE family protein  33.99 
 
 
392 aa  70.5  8e-11  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12458  PPE family protein  28.4 
 
 
194 aa  68.9  2e-10  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.755851 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13652  PPE family protein  42.86 
 
 
413 aa  69.3  2e-10  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.134565  hitchhiker  0.000334929 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11720  PPE family protein  34.57 
 
 
385 aa  69.3  2e-10  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.112292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11581  PPE family protein  31.74 
 
 
760 aa  69.3  2e-10  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.912214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13145  PPE family protein  36.18 
 
 
391 aa  68.6  3e-10  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.213785 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10933  PPE family protein  37.2 
 
 
423 aa  67.4  6e-10  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11837  PPE family protein  37.36 
 
 
403 aa  66.6  1e-09  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  32 
 
 
655 aa  64.7  4e-09  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12783  PPE family protein  35.93 
 
 
382 aa  65.1  4e-09  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34943 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11946  PPE family protein  32.93 
 
 
1457 aa  65.1  4e-09  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.515956  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10310  PPE family protein  33.95 
 
 
3166 aa  64.3  5e-09  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.395007 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11819  PPE family protein  35.47 
 
 
393 aa  64.3  5e-09  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.240142  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10895  PPE family protein  35.03 
 
 
448 aa  64.3  6e-09  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0951157  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  33.54 
 
 
580 aa  63.5  1e-08  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.2358e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11721  PPE family protein  32.21 
 
 
394 aa  60.1  1e-07  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.168821 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10769  PPE family protein  33.54 
 
 
645 aa  58.5  3e-07  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000490344  normal  0.972574 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10360  PPE family protein  36.71 
 
 
3295 aa  57.4  6e-07  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.683224 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12140  PPE family protein  30.25 
 
 
213 aa  57  9e-07  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.95332e-49  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12781  PPE family protein  35.33 
 
 
394 aa  56.6  1e-06  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000422215  normal  0.399199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13165  PPE family protein  33.54 
 
 
409 aa  53.9  7e-06  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11947  PPE family protein  31.87 
 
 
1013 aa  52.4  2e-05  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11193  PPE family protein  30.72 
 
 
346 aa  52.4  2e-05  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11771  PPE family protein  29.75 
 
 
975 aa  50.8  6e-05  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.49393e-28  hitchhiker  1.53091e-08 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13386  PPE family protein  34.9 
 
 
3787 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000441987 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13458  hypothetical protein  25.88 
 
 
176 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.23938e-12  hitchhiker  9.23952e-05 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11057  PPE family protein  39.19 
 
 
391 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.824067 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5774  PPE protein  55.81 
 
 
413 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.118496 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13465  PPE family protein  26.79 
 
 
178 aa  46.2  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.13323e-10  hitchhiker  0.000182876 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13566  PPE family protein  32.56 
 
 
582 aa  45.8  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.514261  hitchhiker  7.13233e-08 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13572  PPE family protein  33.99 
 
 
479 aa  45.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  5.42589e-05 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13459  PPE family protein  25.15 
 
 
173 aa  43.9  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.091e-18  hitchhiker  0.000474891 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>