18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10231 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10231  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12770  hypothetical protein  45.26 
 
 
138 aa  105  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2779  PilT protein domain protein  42.96 
 
 
141 aa  94.7  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156737  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12566  hypothetical protein  37.96 
 
 
137 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.342692  normal  0.114809 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7130  PilT domain-containing protein  47.52 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428024  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10307  hypothetical protein  42.97 
 
 
141 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000112369  normal  0.0967595 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5190  PilT domain-containing protein  41.79 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.745864  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0087  PilT protein domain protein  41.6 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5559  PilT domain-containing protein  40.31 
 
 
136 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.966422  normal  0.472394 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0935  PilT protein domain protein  38.58 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.827464 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2785  PilT protein domain protein  36.57 
 
 
141 aa  62.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.030495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1339  hypothetical protein  52.46 
 
 
99 aa  58.9  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1159  PilT protein domain protein  34.17 
 
 
132 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.876268  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3760  PilT protein domain protein  36.63 
 
 
148 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.383915  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4093  PilT protein domain-containing protein  33.33 
 
 
137 aa  52  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12547  hypothetical protein  32.79 
 
 
133 aa  43.9  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0120006 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0232  PilT protein domain protein  32.03 
 
 
135 aa  43.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.363167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8889  hypothetical protein  38.89 
 
 
98 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>