More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10167 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0714  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  71.97 
 
 		 579 aa  800    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  75.34 
 
 		 556 aa  816    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356608  normal  0.265858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0115  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  75.34 
 
 		 556 aa  816    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  75.34 
 
 		 556 aa  816    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514213  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  73.71 
 
 		 570 aa  800    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10167  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 		 554 aa  1129    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3129  AMP-dependent synthetase and ligase  56.78 
 
 		 534 aa  601  1e-170  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  58.48 
 
 		 525 aa  587  1e-166  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2522  AMP-dependent synthetase and ligase  56.12 
 
 		 534 aa  582  1.0000000000000001e-165  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4181  AMP-dependent synthetase and ligase  55.15 
 
 		 527 aa  579  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4684  AMP-dependent synthetase and ligase  51.36 
 
 		 526 aa  523  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  49.81 
 
 		 1043 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  47.05 
 
 		 520 aa  411  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  42.59 
 
 		 532 aa  342  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  40.31 
 
 		 518 aa  326  7e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  40.66 
 
 		 514 aa  325  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  39.65 
 
 		 516 aa  325  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  41.04 
 
 		 503 aa  320  5e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4202  acyl-CoA synthetase  40.87 
 
 		 534 aa  314  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269622  hitchhiker  0.00584314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3204  O-succinylbenzoate-CoA ligase  41.17 
 
 		 517 aa  313  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716175  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  41.17 
 
 		 517 aa  313  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  41.17 
 
 		 517 aa  313  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  39.63 
 
 		 499 aa  312  1e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1604  AMP-dependent synthetase and ligase  38.12 
 
 		 540 aa  306  6e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  40.36 
 
 		 509 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  38.4 
 
 		 524 aa  300  6e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  36.93 
 
 		 496 aa  299  8e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  36.69 
 
 		 518 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.63 
 
 		 519 aa  297  3e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1515  AMP-dependent synthetase and ligase  37.35 
 
 		 515 aa  297  4e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00288915  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1538  AMP-dependent synthetase and ligase  37.35 
 
 		 515 aa  297  4e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  36.4 
 
 		 496 aa  296  5e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2377  AMP-dependent synthetase and ligase  38.12 
 
 		 530 aa  296  5e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581612  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3816  AMP-dependent synthetase and ligase  37.85 
 
 		 518 aa  296  6e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0163789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0737  AMP-dependent synthetase and ligase  39.17 
 
 		 522 aa  296  7e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188702  normal  0.517642 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  36.53 
 
 		 496 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  36.53 
 
 		 496 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.62 
 
 		 514 aa  293  5e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  37.33 
 
 		 518 aa  293  6e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.36 
 
 		 526 aa  293  6e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0843  acyl-CoA synthetase  37.25 
 
 		 513 aa  293  8e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333452  normal  0.193709 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  37.3 
 
 		 502 aa  291  2e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.45 
 
 		 526 aa  291  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0970  AMP-dependent synthetase and ligase  38.32 
 
 		 520 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  35.34 
 
 		 515 aa  290  6e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  37.45 
 
 		 509 aa  289  7e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0743  AMP-dependent synthetase and ligase  38.98 
 
 		 522 aa  287  4e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.83543  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  38.98 
 
 		 522 aa  287  4e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147131  normal  0.360345 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7494  acyl-CoA synthetase  36.03 
 
 		 521 aa  286  5.999999999999999e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.489378  normal  0.204527 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.4 
 
 		 525 aa  286  7e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.71 
 
 		 512 aa  286  8e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.06 
 
 		 524 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.08 
 
 		 525 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6078  AMP-dependent synthetase and ligase  37.7 
 
 		 553 aa  283  5.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5271  AMP-dependent synthetase and ligase  37.48 
 
 		 541 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  39.29 
 
 		 509 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  35.42 
 
 		 518 aa  283  6.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  38.52 
 
 		 505 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  37.97 
 
 		 551 aa  283  7.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4891  AMP-dependent synthetase and ligase  36.43 
 
 		 520 aa  282  9e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.862065  normal  0.74496 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0894  acyl-CoA synthetase  36.05 
 
 		 520 aa  282  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.493906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.91 
 
 		 525 aa  280  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  36.52 
 
 		 530 aa  280  5e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  39.41 
 
 		 501 aa  280  6e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.04 
 
 		 525 aa  280  7e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  36.66 
 
 		 520 aa  280  7e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.16 
 
 		 530 aa  279  9e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  36.96 
 
 		 508 aa  279  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  36.86 
 
 		 508 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2406  AMP-dependent synthetase and ligase  36.76 
 
 		 509 aa  277  3e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0466191 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3818  AMP-dependent synthetase and ligase  35.95 
 
 		 501 aa  277  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0411  acyl-CoA synthetase  34.52 
 
 		 522 aa  277  3e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5763  AMP-dependent synthetase and ligase  36.1 
 
 		 500 aa  276  5e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  35.71 
 
 		 520 aa  277  5e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  36.2 
 
 		 511 aa  276  6e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.28 
 
 		 525 aa  276  6e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1676  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.22 
 
 		 526 aa  276  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1261  AMP-dependent synthetase and ligase  33.02 
 
 		 546 aa  276  7e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0532703  hitchhiker  0.000000308481 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  36.35 
 
 		 518 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  35.88 
 
 		 520 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  37.06 
 
 		 508 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08640  acyl-CoA synthetase  35.6 
 
 		 516 aa  272  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.310549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0642  acyl-CoA synthetase  35.32 
 
 		 529 aa  272  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.95301  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.05 
 
 		 518 aa  271  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.18 
 
 		 527 aa  271  2e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  36.13 
 
 		 523 aa  271  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1052  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.92 
 
 		 518 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3708  AMP-dependent synthetase and ligase  35.7 
 
 		 551 aa  271  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  35.86 
 
 		 662 aa  269  8e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0707  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.48 
 
 		 518 aa  269  8e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.413153  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.67 
 
 		 518 aa  269  8e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  36.66 
 
 		 516 aa  269  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4921  acyl-CoA synthetase  34.95 
 
 		 531 aa  268  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0661  AMP-binding enzyme family protein  32.68 
 
 		 520 aa  267  2.9999999999999995e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0779  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.19 
 
 		 518 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.746675  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3550  AMP-dependent synthetase and ligase  35.74 
 
 		 520 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5576  acyl-CoA synthetase  36.76 
 
 		 519 aa  266  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628229  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  36.48 
 
 		 503 aa  265  1e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  37.12 
 
 		 511 aa  266  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4691  AMP-dependent synthetase and ligase  36.56 
 
 		 502 aa  264  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>