More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10100 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10100  acyl-CoA synthetase  100 
 
 
540 aa  1087    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.935703 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0959  AMP-dependent synthetase and ligase  35.29 
 
 
530 aa  204  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.866447  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  29.85 
 
 
518 aa  177  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.57 
 
 
526 aa  177  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  29.08 
 
 
508 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.65 
 
 
519 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4949  acyl-CoA synthetase  28.81 
 
 
521 aa  173  6.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131807  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  29.71 
 
 
5154 aa  171  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  30 
 
 
509 aa  171  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  30.85 
 
 
525 aa  170  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  28.2 
 
 
508 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  28.76 
 
 
508 aa  169  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.39 
 
 
526 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1676  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.21 
 
 
526 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591328  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  29.96 
 
 
2374 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  29.62 
 
 
511 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4674  acyl-CoA synthetase  27.76 
 
 
531 aa  164  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  27.43 
 
 
516 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.05 
 
 
525 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.88 
 
 
527 aa  164  6e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.94 
 
 
530 aa  162  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5453  AMP-dependent synthetase and ligase  27.37 
 
 
554 aa  161  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  27.09 
 
 
512 aa  160  5e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  29.92 
 
 
499 aa  159  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.32 
 
 
525 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  30.02 
 
 
507 aa  159  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4891  AMP-dependent synthetase and ligase  27.89 
 
 
520 aa  158  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.862065  normal  0.74496 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5778  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.56 
 
 
565 aa  157  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4613  AMP-dependent synthetase and ligase  29.12 
 
 
512 aa  156  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3230  AMP-dependent synthetase and ligase  29.42 
 
 
526 aa  156  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0524  AMP-dependent synthetase and ligase  29.12 
 
 
525 aa  155  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.319633  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  30.26 
 
 
511 aa  155  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29.55 
 
 
503 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  27.67 
 
 
523 aa  154  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.97 
 
 
525 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.95 
 
 
525 aa  154  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  32.04 
 
 
583 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  29.37 
 
 
515 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.866195  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0959  AMP-dependent synthetase and ligase  33.24 
 
 
512 aa  152  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0739056  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5138  malonyl-CoA synthase  27.41 
 
 
510 aa  152  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  0.695279 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  29.27 
 
 
504 aa  152  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  27.56 
 
 
525 aa  151  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2819  acyl-CoA synthetase  27.58 
 
 
529 aa  151  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.427573  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  27.64 
 
 
520 aa  151  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.76 
 
 
529 aa  151  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  28.77 
 
 
520 aa  151  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.14 
 
 
525 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2905  AMP-dependent synthetase and ligase  28.74 
 
 
502 aa  150  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.587257 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1973  AMP-dependent synthetase and ligase  30.66 
 
 
553 aa  150  4e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.935913  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  29.19 
 
 
2376 aa  150  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  26.96 
 
 
505 aa  150  6e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1068  AMP-binding domain-containing protein  29.08 
 
 
731 aa  149  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3453  AMP-binding protein  24.07 
 
 
500 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  33.51 
 
 
6768 aa  149  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0916  AMP-binding protein  28.73 
 
 
521 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0991636  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0370  AMP-binding domain-containing protein  28.73 
 
 
521 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0119  AMP-binding domain-containing protein  28.73 
 
 
521 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2505  AMP-binding domain-containing protein  28.73 
 
 
521 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0670  AMP-binding domain-containing protein  28.73 
 
 
521 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  25.78 
 
 
496 aa  148  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3220  AMP-binding protein  24.07 
 
 
500 aa  148  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.530837  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  25.78 
 
 
496 aa  148  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3439  AMP-binding protein  24.07 
 
 
500 aa  148  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3198  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.63 
 
 
497 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.335021  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0912  AMP-binding protein  28.89 
 
 
570 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  26.41 
 
 
496 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  28.33 
 
 
520 aa  147  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3127  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.02 
 
 
500 aa  147  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3473  AMP-binding protein  24.06 
 
 
488 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  27.03 
 
 
503 aa  146  8.000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  26.32 
 
 
496 aa  146  9e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3917  AMP-dependent synthetase and ligase  27.07 
 
 
521 aa  146  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.287192  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  29.82 
 
 
530 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4810  AMP-dependent synthetase and ligase  30.74 
 
 
528 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.672528  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3436  AMP-binding protein  23 
 
 
499 aa  145  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.48 
 
 
514 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1016  AMP-dependent synthetase and ligase  28.41 
 
 
507 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0745502 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3426  AMP-binding protein  23.64 
 
 
500 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.473482  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3550  AMP-dependent synthetase and ligase  28.7 
 
 
520 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4900  AMP-dependent synthetase and ligase  29.62 
 
 
527 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309388  normal  0.552445 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1821  AMP-binding protein  23.6 
 
 
500 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.133341 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0714  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.46 
 
 
579 aa  144  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0040  AMP-binding protein  27.9 
 
 
550 aa  144  4e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0957157  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  26.78 
 
 
490 aa  144  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0311  AMP-dependent synthetase and ligase  28.48 
 
 
501 aa  144  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0140314 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0186  AMP-dependent synthetase and ligase  29.3 
 
 
503 aa  144  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0861  AMP-dependent synthetase and ligase  27.67 
 
 
514 aa  144  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2837  AMP-dependent synthetase and ligase  28.97 
 
 
554 aa  143  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.336629  normal  0.585824 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3211  AMP-dependent synthetase and ligase  27.99 
 
 
520 aa  143  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  29.09 
 
 
492 aa  143  7e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0727  AMP-binding domain-containing protein  29.6 
 
 
520 aa  143  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  28.34 
 
 
510 aa  143  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.371172  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1894  putative AMP-binding protein  27.79 
 
 
502 aa  143  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0631  malonyl-CoA synthase  27.41 
 
 
507 aa  143  8e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2702  malonyl-CoA synthase  28.66 
 
 
501 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0670195 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  28.49 
 
 
515 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  27.91 
 
 
549 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  28.32 
 
 
506 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223442  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3117  AMP-dependent synthetase and ligase  23.64 
 
 
500 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  27.24 
 
 
501 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>