204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10098 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10098  oxidoreductase  100 
 
 
289 aa  595  1e-169  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.594688 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0955  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  43.8 
 
 
303 aa  234  9e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.3545  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6017  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.27 
 
 
301 aa  156  5e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0746  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase oxidoreductase protein  29.23 
 
 
301 aa  102  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0762  Taurine dioxygenase  29.14 
 
 
300 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4409  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  28.2 
 
 
301 aa  93.2  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425898  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34750  putative taurine catabolism dioxygenase  27.21 
 
 
295 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.109909  normal  0.0729012 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5058  taurine dioxygenase  27.3 
 
 
299 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5198  dioxygenase, TauD/TfdA family  26.22 
 
 
298 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0188  taurine dioxygenase  27.3 
 
 
299 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.354503 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0696  Taurine dioxygenase  28.78 
 
 
300 aa  90.5  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0988  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  23.85 
 
 
284 aa  90.5  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.534798 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  26.37 
 
 
306 aa  89  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0137  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  28.21 
 
 
298 aa  89  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6050  taurine dioxygenase  27.2 
 
 
291 aa  88.2  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0337  taurine dioxygenase  26.04 
 
 
298 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0190  taurine dioxygenase  27.14 
 
 
299 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0978  Taurine dioxygenase  25.87 
 
 
287 aa  86.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9237  taurine dioxygenase  23.91 
 
 
279 aa  86.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4158  taurine dioxygenase  26.22 
 
 
297 aa  85.9  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6251  taurine dioxygenase  26.44 
 
 
308 aa  85.9  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6536  taurine dioxygenase  26.44 
 
 
308 aa  85.9  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.788384 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0169  TauD/TfdA family dioxygenase  26.79 
 
 
299 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0511  Taurine dioxygenase  27.3 
 
 
299 aa  85.5  9e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  24.48 
 
 
277 aa  85.1  1e-15  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4136  taurine dioxygenase (TauD/TfdA family)  28.11 
 
 
308 aa  84.3  2e-15  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.805351 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30930  taurine catabolic dioxygenase protein  27.14 
 
 
273 aa  84  3e-15  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  24.48 
 
 
291 aa  83.6  4e-15  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4751  taurine dioxygenase  26.39 
 
 
304 aa  83.2  5e-15  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325692  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2169  taurine dioxygenase  26.05 
 
 
302 aa  81.6  1e-14  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1245  taurine dioxygenase  27 
 
 
308 aa  80.9  2e-14  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02787  hypothetical protein  23.72 
 
 
314 aa  80.9  2e-14  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6587  taurine dioxygenase  27 
 
 
308 aa  80.9  2e-14  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51854  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4466  TauD/TfdA family dioxygenase  24.91 
 
 
290 aa  80.9  3e-14  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.038749 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1800  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  23.6 
 
 
287 aa  80.5  3e-14  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.971023  normal  0.0172073 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1214  TauD/TfdA family dioxygenase  23.99 
 
 
297 aa  79.3  6e-14  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.631548  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  26.98 
 
 
283 aa  79.3  7e-14  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2415  TauD/TfdA family dioxygenase  24.71 
 
 
297 aa  79.3  8e-14  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1740  TauD/TfdA family dioxygenase  24.71 
 
 
297 aa  79.3  8e-14  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  23.08 
 
 
277 aa  79  8e-14  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0776  TauD/TfdA family dioxygenase  24.71 
 
 
297 aa  79.3  8e-14  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0690  TauD/TfdA family dioxygenase  24.71 
 
 
297 aa  79.3  8e-14  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1139  TauD/TfdA family dioxygenase  24.71 
 
 
297 aa  79.3  8e-14  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6191  taurine dioxygenase  26.24 
 
 
308 aa  78.6  1e-13  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  23.43 
 
 
277 aa  78.2  1e-13  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  25.37 
 
 
285 aa  77.8  2e-13  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0816  TauD/TfdA family dioxygenase  26.9 
 
 
283 aa  77.4  2e-13  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292051  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  26.98 
 
 
283 aa  77.8  2e-13  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3604  taurine dioxygenase  25.29 
 
 
304 aa  77.8  2e-13  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  26.98 
 
 
283 aa  77.8  2e-13  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  26.98 
 
 
283 aa  77.4  3e-13  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0153  taurine dioxygenase  25.48 
 
 
302 aa  77  3e-13  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.93116 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  26.98 
 
 
283 aa  77.4  3e-13  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  26.98 
 
 
283 aa  77.4  3e-13  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  26.98 
 
 
283 aa  77.4  3e-13  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0908  TauD/TfdA family dioxygenase  27.54 
 
 
283 aa  77.4  3e-13  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0747691  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  26.98 
 
 
283 aa  77  4e-13  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  24.71 
 
 
280 aa  75.9  7e-13  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  24.48 
 
 
277 aa  75.1  1e-12  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4401  TauD/TfdA family dioxygenase  25.94 
 
 
296 aa  74.7  2e-12  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.0785293 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  24.13 
 
 
277 aa  74.3  2e-12  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4218  Taurine dioxygenase  25.62 
 
 
322 aa  74.7  2e-12  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04663  taurine dioxygenase  25.67 
 
 
305 aa  73.2  5e-12  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2171  TauD/TfdA family dioxygenase  27.11 
 
 
292 aa  72.8  6e-12  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0808968  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2123  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  28.24 
 
 
293 aa  71.6  1e-11  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28342  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2504  taurine dioxygenase  26.18 
 
 
285 aa  70.9  2e-11  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4891  taurine dioxygenase  23.17 
 
 
273 aa  71.6  2e-11  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440182  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21960  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA family  24.38 
 
 
317 aa  70.5  3e-11  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.162155  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  24.44 
 
 
278 aa  70.1  4e-11  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5504  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  25.89 
 
 
288 aa  69.7  5e-11  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255533  normal  0.425831 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3809  taurine dioxygenase  25.09 
 
 
267 aa  69.7  5e-11  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4542  taurine dioxygenase  24.28 
 
 
301 aa  69.7  6e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0422287  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0828  taurine dioxygenase  24.81 
 
 
276 aa  68.9  8e-11  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.297497  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6479  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  25.53 
 
 
287 aa  68.2  1e-10  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  26.15 
 
 
272 aa  67.8  2e-10  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  23.93 
 
 
277 aa  67  3e-10  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  24.53 
 
 
283 aa  66.6  4e-10  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  26.37 
 
 
295 aa  66.6  4e-10  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  23.93 
 
 
335 aa  66.6  5e-10  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  23.76 
 
 
277 aa  66.2  5e-10  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2717  taurine dioxygenase  25.09 
 
 
305 aa  65.9  7e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2152  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  27.37 
 
 
301 aa  65.9  8e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.898117 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5823  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  24.72 
 
 
295 aa  65.5  9e-10  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02435  hypothetical protein  26.49 
 
 
299 aa  65.5  1e-09  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3050  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  29.14 
 
 
294 aa  64.7  2e-09  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0131  TauD/TfdA family dioxygenase  23.4 
 
 
327 aa  64.7  2e-09  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1559  TauD/TfdA family dioxygenase  23.05 
 
 
327 aa  63.5  3e-09  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1242  TauD/TfdA family dioxygenase  23.78 
 
 
281 aa  63.5  3e-09  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1640  TauD/TfdA family dioxygenase  23.05 
 
 
327 aa  63.5  3e-09  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0273  hypothetical protein  25.56 
 
 
299 aa  63.5  4e-09  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0252  taurine dioxygenase  27.07 
 
 
308 aa  63.5  4e-09  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1161  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  24.57 
 
 
281 aa  63.5  4e-09  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00427132  normal  0.195503 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2092  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  24.91 
 
 
313 aa  63.5  4e-09  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.231505  normal  0.780487 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2158  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  23.49 
 
 
299 aa  63.5  4e-09  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516401  normal  0.312932 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2141  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  28.19 
 
 
298 aa  63.5  4e-09  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0720  taurine dioxygenase  26.34 
 
 
309 aa  63.2  5e-09  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21870  taurine catabolism dioxygenase, TauD/TfdA family  23.66 
 
 
287 aa  62.4  9e-09  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719092  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7076  Taurine dioxygenase  24.32 
 
 
282 aa  62  1e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  24.44 
 
 
293 aa  61.6  1e-08  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  23.23 
 
 
305 aa  61.2  2e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>