More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10088 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10088  formate hydrogenase hycE  100 
 
 
492 aa  976  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.301164  normal  0.197013 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2989  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  60.98 
 
 
506 aa  548  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.016212  hitchhiker  0.00562837 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4707  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  60.49 
 
 
486 aa  541  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4465  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  64.39 
 
 
391 aa  460  1e-128  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.314486  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2464  NADH dehydrogenase (quinone)  42.53 
 
 
531 aa  329  7e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.511351  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0325  putative formate hydrogenlyase subunit  37.94 
 
 
515 aa  304  2e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0170  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  43.76 
 
 
501 aa  300  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.679833  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2478  NADH dehydrogenase (quinone)  38.2 
 
 
492 aa  296  4e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.487557 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0175  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit  40.97 
 
 
522 aa  296  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1138  hydrogenase subunit  43.75 
 
 
527 aa  292  1e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0311036  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0699  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  38.15 
 
 
524 aa  291  1e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6069  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  40.39 
 
 
524 aa  288  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289137 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0933  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  41.51 
 
 
502 aa  287  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0795  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  38.08 
 
 
525 aa  286  8e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0920  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  41.63 
 
 
516 aa  281  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4284  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  36.61 
 
 
551 aa  271  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1317  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  39.5 
 
 
526 aa  270  5e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3288  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  40.14 
 
 
519 aa  268  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.14856  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2153  hydrogenase-4, G subunit  39.01 
 
 
515 aa  266  6e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1265  hydrogenase-3, subunit E  40.93 
 
 
559 aa  266  6e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0101141  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1811  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  39.01 
 
 
515 aa  266  6e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1264  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  40.88 
 
 
503 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0324503 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1303  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  36.93 
 
 
478 aa  265  1e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4667  hydrogenase 4 subunit G  41.03 
 
 
514 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.986005  normal  0.679723 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1528  putative hydrogenase subunit  41.23 
 
 
574 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0107  hydrogenase subunit  41.23 
 
 
567 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3785  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  39.52 
 
 
515 aa  263  7e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.315955 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1123  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  39.03 
 
 
526 aa  261  2e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165135  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1613  putative hydrogenase subunit  40.79 
 
 
574 aa  260  4e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1400  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  40.76 
 
 
482 aa  258  2e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2554  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  35.61 
 
 
506 aa  258  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1818  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  36.85 
 
 
519 aa  258  2e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.207478  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1571  hydrogenase, group 4, HycE subunit, putative  38.15 
 
 
526 aa  256  5e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0265592  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1449  hydrogenase, HycE subunit  38.83 
 
 
526 aa  255  1e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0376579  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3188  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  37.94 
 
 
503 aa  255  2e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.377236  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3851  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  39.91 
 
 
503 aa  253  4e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.425582  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2622  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  38.68 
 
 
493 aa  253  7e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1073  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  37.56 
 
 
503 aa  253  7e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.15376e-34 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3800  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  37.95 
 
 
521 aa  251  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3659  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  38.1 
 
 
521 aa  251  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3717  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  37.75 
 
 
521 aa  250  5e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.000990438  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1687  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  34.97 
 
 
530 aa  249  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0888  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  35.07 
 
 
507 aa  245  1e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0371  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  38.24 
 
 
502 aa  244  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2597  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  36.67 
 
 
506 aa  241  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0743  NAD-dependent dehydrogenase subunit  38.53 
 
 
505 aa  241  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0340  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  36.66 
 
 
504 aa  241  3e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0164129  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2466  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  38.86 
 
 
499 aa  238  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278234  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0774  NAD-dependent dehydrogenase subunit  35.48 
 
 
565 aa  236  5e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.133337  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3430  hypothetical protein  37.72 
 
 
513 aa  231  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3217  hypothetical protein  37.5 
 
 
513 aa  231  3e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728125  normal  0.0835857 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0939  hydrogenase, component E-formate hydrogenlyase subunit 5-like protein  32.96 
 
 
518 aa  215  1e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.297277  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3280  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  34.6 
 
 
498 aa  214  2e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0183  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  33.87 
 
 
567 aa  210  4e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1790  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  35.43 
 
 
518 aa  204  3e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.57722  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3709  hydrogenase-4, G subunit  33.33 
 
 
571 aa  203  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2634  hydrogenase-4, G subunit  33.33 
 
 
571 aa  202  9e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2430  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  32.63 
 
 
567 aa  200  6e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85735  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2769  hydrogenase-4, G subunit  33.1 
 
 
571 aa  199  7e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2186  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  32.19 
 
 
574 aa  197  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00990  Ni,Fe-hydrogenase III large subunit  32.82 
 
 
576 aa  196  6e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2859  hydrogenase-4, G subunit  32.63 
 
 
571 aa  195  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4570  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  30.58 
 
 
571 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2713  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  30.99 
 
 
575 aa  189  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3194  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  31.69 
 
 
569 aa  187  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3159  formate hydrogenlyase, subunit E  30.99 
 
 
569 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.146854 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2970  formate hydrogenlyase, subunit E  30.99 
 
 
569 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3052  formate hydrogenlyase subunit E  30.99 
 
 
569 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.309808 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3036  formate hydrogenlyase subunit E  30.99 
 
 
569 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000143989 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3001  formate hydrogenlyase subunit E  30.99 
 
 
569 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.33609  normal  0.016492 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3009  formate hydrogenlyase, subunit E  30.65 
 
 
569 aa  186  8e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0991  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  30.65 
 
 
569 aa  186  9e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0591467 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02536  hypothetical protein  30.65 
 
 
569 aa  186  9e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.576982  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2857  formate hydrogenlyase, subunit E  30.65 
 
 
569 aa  186  9e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2846  formate hydrogenlyase, subunit E  30.65 
 
 
576 aa  186  9e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.15789 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02571  hydrogenase 3, large subunit  30.65 
 
 
569 aa  186  9e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.671666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0968  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  30.65 
 
 
569 aa  186  9e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02341  hypothetical protein  32.16 
 
 
555 aa  185  1e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2621  hydrogenase-4, G subunit  32.16 
 
 
555 aa  185  1e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3155  formate hydrogenlyase, subunit E  30.65 
 
 
569 aa  186  1e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02379  hydrogenase 4, subunit  32.16 
 
 
555 aa  185  1e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3972  formate hydrogenlyase, subunit E  30.65 
 
 
576 aa  186  1e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1189  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  32.16 
 
 
555 aa  185  1e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.454918 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1182  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  32.16 
 
 
555 aa  185  1e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1280  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  30.66 
 
 
575 aa  185  2e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.637418  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0316  NADH-ubiquinone oxidoreductase  31.29 
 
 
561 aa  179  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.371145  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0127  hydrogenase-4 component G  28.16 
 
 
582 aa  172  9e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.548953  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1866  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  28.71 
 
 
579 aa  167  3e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0728  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  32.44 
 
 
499 aa  166  1e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0174132  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0606  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  32.85 
 
 
476 aa  166  1e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.757635  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0711  DNA-3-methyladenine glycosylase I  28.48 
 
 
578 aa  164  4e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0105954  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1635  phage integrase family site specific recombinase  28.1 
 
 
578 aa  161  3e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0144556  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2786  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  30.47 
 
 
557 aa  160  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2794  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  30.47 
 
 
557 aa  160  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1071  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  28.01 
 
 
537 aa  155  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4118  NADH dehydrogenase (quinone)  32.75 
 
 
358 aa  153  6e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433928  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0803  NADH dehydrogenase (quinone)  31.78 
 
 
359 aa  146  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2728  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  31.34 
 
 
359 aa  145  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.316127  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1734  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  30.41 
 
 
359 aa  139  8e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00563551  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0028  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  29.55 
 
 
359 aa  139  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>