More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10087 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10087  hydrogenase hycQ  100 
 
 
488 aa  920  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.98381e-07  normal  0.186315 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4466  NADH dehydrogenase (quinone)  48.25 
 
 
428 aa  313  5e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2988  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  51.01 
 
 
537 aa  311  2e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0307877  hitchhiker  0.00569852 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4706  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  54.04 
 
 
572 aa  308  2e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1688  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.68 
 
 
495 aa  269  8e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.565022  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2188  hydrogenase 4 subunit F  39.95 
 
 
495 aa  264  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0794  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  38.89 
 
 
489 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4571  hydrogenase 4 subunit F  39.79 
 
 
512 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4668  hydrogenase 4 subunit F  39 
 
 
484 aa  258  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.423781  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1139  hydrogenase 4 subunit F  37.4 
 
 
488 aa  254  2e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0485021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2620  hydrogenase 4 subunit F  40.37 
 
 
526 aa  249  7e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1190  hydrogenase 4 subunit F  40.37 
 
 
526 aa  249  7e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.647759 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02378  NADH dehydrogenase subunit N  40.11 
 
 
526 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1183  NADH dehydrogenase (quinone)  40.11 
 
 
526 aa  248  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6068  hydrogenase 4 subunit F  39.11 
 
 
486 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0822285  hitchhiker  0.00325517 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02340  hypothetical protein  40.11 
 
 
526 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3708  hydrogenase 4 subunit F  39.84 
 
 
521 aa  246  8e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332962  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2633  hydrogenase 4 subunit F  41.09 
 
 
526 aa  245  1e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4285  NADH dehydrogenase (quinone)  35.76 
 
 
499 aa  245  1e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.14859  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0176  hydrogenase 4 subunit F  41.26 
 
 
486 aa  243  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399009  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0700  NADH dehydrogenase (quinone)  36.89 
 
 
484 aa  243  7e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.452975  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0919  hydrogenase 4 subunit F  36.79 
 
 
487 aa  243  7e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0326  hydrogenase 4 subunit F  40.44 
 
 
486 aa  242  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2712  hydrogenase 4 subunit F  41.12 
 
 
553 aa  241  3e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1281  hydrogenase 4 subunit F  41.42 
 
 
538 aa  241  3e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0834276  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1304  NADH dehydrogenase (quinone)  35.14 
 
 
480 aa  240  3e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00980  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  37.13 
 
 
533 aa  240  4e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.558351  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1399  hydrogenase 4 subunit F  38.85 
 
 
482 aa  239  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0932  hydrogenase 4 subunit F  36.32 
 
 
483 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.187708  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2463  NADH dehydrogenase (quinone)  37.84 
 
 
493 aa  237  5e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.873938  normal  0.528975 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3289  hydrogenase 4 subunit F  38.29 
 
 
484 aa  236  5e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.612532  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2858  hydrogenase 4 subunit F  40.23 
 
 
517 aa  236  1e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3852  hydrogenase 4 subunit F  36.9 
 
 
483 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0294681  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0185  NADH dehydrogenase (quinone)  36.91 
 
 
491 aa  233  4e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1038  hydrogenase-4 component F  36.44 
 
 
491 aa  233  5e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  4.18597e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1264  hydrogenase 4 subunit F  39.39 
 
 
463 aa  232  9e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218764  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2477  hydrogenase 4 subunit F  36.82 
 
 
481 aa  232  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.638656 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1529  hydrogenase 4 subunit F  39.12 
 
 
486 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0108  hydrogenase 4 subunit F  39.12 
 
 
486 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1614  hydrogenase 4 subunit F  39.12 
 
 
486 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1263  hydrogenase 4 subunit F  39.01 
 
 
483 aa  230  5e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0336263 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0169  hydrogenase 4 subunit F  37.44 
 
 
486 aa  229  8e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.20751  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1911  hypothetical protein  35.82 
 
 
493 aa  225  2e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.262508  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0320  NADH dehydrogenase (quinone)  37.13 
 
 
531 aa  220  5e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1865  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.22 
 
 
489 aa  213  6e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0128  hydrogenase-4 component F  34.58 
 
 
491 aa  213  9e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.223921  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1810  hydrogenase 4 subunit F  39.88 
 
 
484 aa  212  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.727571  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2152  hydrogenase 4 subunit F  39.88 
 
 
484 aa  212  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.915264  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0339  NADH dehydrogenase (quinone)  35.55 
 
 
477 aa  202  1e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.466096  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0729  NADH dehydrogenase (quinone)  41.03 
 
 
512 aa  198  2e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0359188  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1791  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  37.33 
 
 
492 aa  197  4e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0374875  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1072  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.18 
 
 
477 aa  192  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.41725e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3189  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.18 
 
 
477 aa  192  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.176155  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2621  NADH dehydrogenase (quinone)  36.73 
 
 
478 aa  190  5e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.773397  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0775  NADH dehydrogenase (quinone)  36.68 
 
 
497 aa  190  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.485892  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0605  NADH dehydrogenase (quinone)  35.35 
 
 
506 aa  188  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3716  NADH dehydrogenase (quinone)  35.92 
 
 
476 aa  186  8e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0275464  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3799  NADH dehydrogenase (quinone)  35.92 
 
 
476 aa  186  8e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.495272  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2598  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.37 
 
 
478 aa  185  2e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3658  NADH dehydrogenase (quinone)  35.66 
 
 
476 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3216  Hydrogenase 4 membrane component (E)  39.89 
 
 
483 aa  182  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.492531  normal  0.0423716 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3431  hypothetical protein  39.89 
 
 
483 aa  182  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.677661  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0889  NADH dehydrogenase (quinone)  32.95 
 
 
477 aa  178  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0742  NAD-dependent dehydrogenase subunit  34.27 
 
 
478 aa  177  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0940  NADH dehydrogenase (quinone)  32.97 
 
 
470 aa  176  7e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0548909  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0372  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  37.27 
 
 
477 aa  175  2e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330111  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1994  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.34 
 
 
440 aa  173  6e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1124  hydrogenase membrane subunit  32.83 
 
 
494 aa  172  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.113605  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3784  NADH dehydrogenase (quinone)  34.23 
 
 
477 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.688785  normal  0.510826 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0776  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.36 
 
 
448 aa  166  6e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.986701  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1318  hydrogenase membrane subunit  31.18 
 
 
493 aa  162  1e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2555  NADH dehydrogenase (quinone)  35.71 
 
 
479 aa  160  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1572  hydrogenase membrane subunit  30.23 
 
 
460 aa  160  4e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1819  hydrogenase membrane subunit  29.41 
 
 
489 aa  159  8e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00530932  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1450  hydrogenase subunit, NADH dehydrogenase subunit N-like protein  30.41 
 
 
499 aa  156  8e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2459  NADH dehydrogenase (quinone)  37.37 
 
 
480 aa  156  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38611  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4506  NADH dehydrogenase (quinone)  32.93 
 
 
1265 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.105233 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1428  hydrogenase 4 subunit F  29.47 
 
 
431 aa  146  7e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.289915  normal  0.541686 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0188  NADH dehydrogenase (quinone)  31.89 
 
 
737 aa  139  1e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1880  NADH dehydrogenase (quinone)  31.56 
 
 
1245 aa  137  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374238  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1420  NADH dehydrogenase (quinone)  29.5 
 
 
1265 aa  136  9e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1691  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.14 
 
 
688 aa  134  4e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  1.43823e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0380  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.07 
 
 
472 aa  134  4e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  5.95488e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3194  NADH dehydrogenase (quinone)  34.93 
 
 
1264 aa  130  5e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.466435 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0916  hydrogenase 4 subunit B  32.77 
 
 
674 aa  130  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1260  hydrogenase 4 subunit B  32.2 
 
 
672 aa  128  2e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0751084 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3855  hydrogenase 4 subunit B  31.94 
 
 
672 aa  126  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0184  NADH dehydrogenase (quinone)  31.23 
 
 
487 aa  126  1e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0929  hydrogenase 4 subunit B  32.77 
 
 
687 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0791  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.57 
 
 
661 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4671  hydrogenase 4 subunit B  33.05 
 
 
674 aa  123  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2191  hydrogenase 4 subunit B  29.05 
 
 
673 aa  122  2e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  28.13 
 
 
500 aa  122  2e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  2.49004e-12 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  28.33 
 
 
662 aa  122  2e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.20305  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0742  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.84 
 
 
538 aa  120  4e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.778742 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1822  hydrogenase membrane subunit  28.44 
 
 
643 aa  120  4e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0165692  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1107  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  24.17 
 
 
488 aa  120  6e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.980044  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0210  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.45 
 
 
525 aa  120  7e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.924509  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0508  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  28.44 
 
 
499 aa  119  1e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.63951e-07  hitchhiker  2.87422e-07 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4834  NADH dehydrogenase (quinone)  33.77 
 
 
585 aa  119  1e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>